Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG16:9
Sequence Length
568 nt
GC Content
0.4965
CUUUUCGAGGUCGGCCGCGUGGCUGGAAGACAUGGCCACUCCAGUCGGUGUUGAGCACGGCGAGCAGUCUCAGGCCUUUAGUGAUGAUGAGGCCUUUCUUUGUUUGGCAUCUGCAGAGACGGUGAAAAGCAGAGCUCCAGGUUGAAGGAUCAGAGUAAUAGAUGGAGCCCUUAACAUGAGUAAGAGUGGGUGCAGGCAGGGCCUGAGUGGUCACUAGAAAUGAGAAAGCACAGUUGGUGCCAUCACAUACAUUCACCUCCUGCUUUAUUCUGAAGUUCAAGUAUGAGAAUACGUGUUGACAUACAAGCCAGCUAUGAUUAAAGGUGGUGGCUGUGGCCUUGAAAACAGUCAUGUGAAAACUCAUCACCUUAAGGUGUUAAGUGUAAGGAUCUUCAUGAUGAAAUUUCUGUAAAUGGUGCAGUCAGCCUCAGUUUCCAAAGCCGGAAAAGGAUCCUCUAGUAGCCACGGUGUGGCAGCUGCUCUGAACCAGGACCUGGACCCGGACCCAAAGUGCCAUGUCUUUAAUGUUAGCUCCCAGCGAUGCCAGAUGGGAUCAGCACAGCCCUGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-177.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -189.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 161.17
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((....))(((.((((((((((((((((.(((...(((.((((...))))..(((((((....(((((((..........)))))))....)))))))((.(((((..............)))))))((((((((...((.((((((((.((.((..(((((((((.((((((....((((.((....((((((((((.(((.((((((...((......))...))))))))))))...(((.(((((.(((...((((.(((..(((...(((((..(((....)))..))))).))))))..))))....))).))))).))))))))))....)).))))......))))))....)))))).)))..)).))((((((((.....(((.....(((((.....)))))......))).(((((......)))))))))))))......(((((...)))))...)))))))).))..))))))))....)))....))))))))))))))..((((.(.(((((.(.......).))))).)))))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....,,.{,.||,,,(((.((((((((((((((({,(((...(((((,({.{,|,||,,|,,,..}})}}(((((((..........)))))))..((((((((..(((({{.......))))..)))))))).((((((((...((.((((((((.(({(,{{(,{(((({{,,(((({.((((((((.(((((.(((,..(({((({,(({({{...((.....,||,..}}})))),})},,...}},})}))))))))))))))))....|||}.{{{({,|.,|||{{{||{.,.,.{{{(((((((((.{{,...})),)))))},,}}|,}}}....}}},)})}}|...,}|}}}{{{{||||})})}}.,)}.},||{{{|{|,,,||}|}...,,|{{{{...,,})}}}.,,}},}},.{((((......)))))})),))))}}}{{.(((((...))))).}})))))))).))..)))))))).}},)))....))))))))))))))..{(((.(.(((((.(.......}.))))).))))}))))).)))
Back