Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG17:16
Sequence Length
1073 nt
GC Content
0.5722
CCGUCCCUCGCCGUCCUUCGCCAUCGCACGCCACCGCACCCCAUCUCUCGAAAUCUGCAGACAUCUUGAUUUUUCCCACGCUGUCUGUCAGGUCUCCGCCGCCACUCGACGCCAGGGCGCCGGGCCUUGUGGGCUGUGCUGCACCUCGGACGGCUUCGCACCAGCCAGCGCCCUCUCUCUCCUGCAGCACUCUGAUCUGCACCCCCUGAGGGGCUUCCACUGUCCGCGGGGUGAGAAUGCCCCUGGGAGUGUCACAUGACUGCCGCCCCAUGUGUGUGAGAGGCGUCCUCUGGGAGAGCAUGGAUCCUGAGGUCCCAGGAUUGUCAGCUGACCUCUGUCCUGUGUGCCCAGUGGCCCCAGGUGACGUGUCUUCAAGAAGAGGCUGAGCUGCGGUGCUUGUAAGGCAGGGUCUCAUUCUGUCACCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCAAUGAUGGCUCACUGCAGCCUCGACCUGGGCUCAAGUGAUCCUCCACCUCAGCUUCCUGAGUAGCUGGGACCACAGAGUCAUGUGCUGUUCCUGGGGCUUGGAUGAUGUAGGGGAAGCAAGGUGAAAGUGGUAUCCCGUGGUUCCACGUUCUGUCCUGCUGUGGGGCUGUCCCUCACAUGCUUUCAGUGGCUGUUGCAGAGGAAGAGCCUCCGGAAAUCUGCGUGGGUCUCAGCCUUAGAUCCAAGGACAGUCCAAGGAAGUCCUAAGACCAUGGAGUUGGUGAUCUGGGAUCUGGGUUUGCUGAUAUUUCUCACCGUGAAUCUCUUGGUGGUGUUUGUGGGCACGAGAGGGGCAGAGAAUGGAGAGUGAGGCUACCACAUGAAGCGUCACCAGAGCUGCUCCCUGCUGCCUGCUCAGAGCACCCCGGAUCCACUGUUCAAUCUGCACAAGAUUCGGGGUCCAGACAUGGGAGACUUCAGCUGCCUCAGAGGACCGUGGACAGGGAAGGCCAGCCUCGCAUCCCUCUGUCCAUGCCUGGAAUGACUUUAAUAACCAAGAGUUUUAUUUUUGAAUUUGUAGCUGUCGUUCACUUUUUACCCACCCAUUCAAUAAACCUUACAGAAUUGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-410.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -428.93
Frequency: 0.0000
Diversity: 185.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((..(((.....(((..((.(((((((((((.((((..((((((.(((((((((((.(.((........)).).)))))).))))).))((((((((((...(((((((((((..(((..((((((((((.(........).))))).)))))...))).)))))))...(((((((((.((.((((((((.(((((((.((.((.......)).)).).)))))))))..(((((.((((..(.(((((((((......((((((.(.(.(((((...))))).).)..))))))...(((.((((((((.....((((..((((((...((((.(.(((....))).))))).)).).)))........(((((((((.((.((.(((((...((((((((...)))))))).((((((.(.(((((((((((.((.......))))))))))..))).)))))))..)))))...))..)).)))))))))))))....)))))))).)))))))))))))..)))).)))))))))))).))))))))).....))))..))))))...((((((((((..(..(((((((..(.((((((((.(((.(.((.(.((((.(.((((.((.(...).)).)))).)..)))).))).).)))...)))))))).)....)))))))..)..))).........)))))))....))))....))))..))))..)))......(((.......)))......)))))))).))..)))))).)))))))...((((((....((((((.......(((((..((.(((...((((((...((.....))...))))((((((((((...(((.......)))...))))))))))..))...)))))..)))))...)))))).(((..(((((((((((...((.......))....)))))))))))))).(((((((....((((.(((((((...)))))))...))))....))))))).............))))))....................
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((..(((.....(((..((.(((((((((((.((((..((((((.(((((((((((.(.((........)).).)))))).))))).}}((((((((((...(((((((((((..(((..((((((((((.(,,.....,),)))))},))))...))).)))))))...(((((((((.((.(((({(((.(((((({.{,.(({{.....}},))},.)))))))))..(((((.((((,.(.(((((((((......((((((.{.(.(((((...))))).).}..))))))...(((.((((((((,,,,{((({{{({({.({{.{({{.{.|{{,,,.))}..)))},})}}.))).,,.....(((((((((.((.(({(((((...((((((((...)))))))).((((((.(,({(((((((((.((.......))))))))))..))),}))))))..))))),..))..)).))))))))))))),...)))))))).)))))))))))))..)))),)))))))))))).))))))))).....))))..))))))...((((((((({..{..(((((((,.{.((((((((.{{(,(,({.(,((((.(.((((.((.(...}.)).)))).}..)))}.,,),)})))...)))))))).}....)))))))..}..||}...,,,..,)))))))....))))....))))..))))..))).((...,{{,,,....))},.....)))))))).}),,)))))).)))))))...((((((.,.((((,(({.,....,|,||}.||}||,.(((((((({{{(({{...||{...)))((((((((((...(((.,.....)}),,.)))))))))).})).}},))))}.,,,)))}},}}},,.(((..((((((((((({..({.......)).}))),,))))))))))).(((((((..,.((((.(((((((...)))))))...)))).,..))))))).............))))))....................
Back