Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

SNHG18:3

Sequence Length

842 nt

GC Content

0.5048

CCCGGUACAGGACCCCCACCUUCGCUCCUGGGAGCCCCGCUGCACCCCAGGAGUUCCAUUCCAGCCUCCCCAGUGCGAGUGCGGCCGAGCGCUGACUUUUGGGGGCUCCCUCCCCCGUCUCACUGGGUCCCUCUGCGGCUCCCCCGCCCGCUGUCCCGGUUCAGACGUGGCUGCACCCCGGAGGGGGGCGCCGGCCGAGACCUGAGACGUGGCGCUCCCUCUCUGCCGGCCUCGGCUUCAGUGCUUGAAUUUCAGCCACAUCCCUAAGCUGCCAUCUCAGACCAGAGGAACAGGGAGGGGGGCUUUCUGGAAAGAACAUCACCUGGAAGAAAUCAGGACAUGACUGUGGGCCAUGAGUGACCUUCAAAGGAAAGCCGGGUAUCUGUGGUCUUUAAGAUGUGGUAAGAUUGUAUUAAAAUUAUAGAAAAAAACCUCAAUCCAGAAAUCGUGGCCUCUUGACAUUUACAUCUUAACUGCAUUUUCCUACCAAUGAGAUGCAUUACAAUCAUCCUCCAUAAGUGUUCUCUUUUUACCCCUGUUUCCAUUCUUUUAGAUCCAUGACAUUUAAAAACUGAAGAAAUGGAAAGAUCAUCUGAUCAGGCCCAUCAGUCUUUUUCCUAAUGCUAAACAUUGGUACAAAGACGUGAAGUUUGAUGUCUCACUAAGAUUGCCUAGGGCUGCUUUAUUGCUCACCUACUUCAAAGUAUUGGGAAAACAUGAUUAUGGGUACAGGUGAUGCUGUGUUGCCCCCAGACAGGUUUCUUUUGUCAGGUUCUUUUGAUGGAUUAGGAACCUACAAGUGGGGAGAUUUUAGGGAAAUAGCCCCUCCACUUGGAUUUCAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-271.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -287.39

Frequency: 0.0000

Diversity: 243.92

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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