Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG18:7
Sequence Length
847 nt
GC Content
0.5053
CCCUUCCCGGUACAGGACCCCCACCUUCGCUCCUGGGAGCCCCGCUGCACCCCAGGAGUUCCAUUCCAGCCUCCCCAGUGCGAGUGCGGCCGAGCGCUGACUUUUGGGGGCUCCCUCCCCCGUCUCACUGGGUCCCUCUGCGGCUCCCCCGCCCGCUGUCCCGGUUCAGACGUGGCUGCACCCCGGAGGGGGGCGCCGGCCGAGACCUGAGACGUGGCGCUCCCUCUCUGCCGGCCUCGGCUUCAGUGCUUGAAUUUCAGCCACAUCCCUAAGCUGCCAUCUCAGACCAGAGGAACAGGGAGGGGGGCUUUCUGGAAAGAACAUCACCUGGAAGAAAUCAGGACAUGACUGUGGGCCAUGAGUGACCUUCAAAGGAAAGCCGGGUAUCUGUGGUCUUUAAGAUGUGGUAAGAUUGUAUUAAAAUUAUAGAAAAAAACCUCAAUCCAGAAAUCGUGGCCUCUUGACAUUUACAUCUUAACUGCAUUUUCCUACCAAUGAGAUGCAUUACAAUCAUCCUCCAUAAGUGUUCUCUUUUUACCCCUGUUUCCAUUCUUUUAGAUCCAUGACAUUUAAAAACUGAAGAAAUGGAAAGAUCAUCUGAUCAGGCCCAUCAGUCUUUUUCCUAAUGCUAAACAUUGGUACAAAGACGUGAAGUUUGAUGUCUCACUAAGAUUGCCUAGGGCUGCUUUAUUGCUCACCUACUUCAAAGUAUUGGGAAAACAUGAUUAUGGGUACAGGUGAUGCUGUGUUGCCCCCAGACAGGUUUCUUUUGUCAGGUUCUUUUGAUGGAUUAGGAACCUACAAGUGGGGAGAUUUUAGGGAAAUAGCCCCUCCACUUGGAUUUCAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-273.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -288.65
Frequency: 0.0000
Diversity: 244.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((...((....))......(((((((((.((......))..)))))))))..(((((..((((....)).)))))))((((((.(((((..(((((((((((..((.....(((((.((((((.(.....((((.....)))).....).))))))..))))).))..)).)))))))))..)))))))))))....((((((..(((((((........((((....))))....(((.((((...)))).))).......))).))))))))))))).).)))..))))..((((((.((((....))))(((((((((...((((..(((((((...((((((((((.((..((((.....((....))))))..)))))))..((((((((((((((((.((((.......))))...............(((.......)))..)))))....))))))))))).((((((((.........)))))))).............))))).)))))))..)))).......((((((((.((((((..................)))))).))))))))((((....))))..((((((.((((.(((((((((((((.....(((((....((((((........)))))).))))).......((((...((......))...))))......)))))))))))))...)))))))))).))))))))).......))))))....(((((((((((((((((....)))))))))..)))))))).(((((((((........(((......))))))))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,(((,(((...((..,{||{|,...(((((((((.((......}}..)))))))))..{{{{{..((({,,,.,,,|,}}}})((((((.(((((..(((((((((((..,,..{{.(((((.((((((.{.....((((,....}})),,,,.}.))))))..))))).))..)).)))))))))..))))))))))|,,,.(((((,.,{((({({,..,,,,.((((....))))....(((,{{({...}))),))).......}}},}}}}}}}))).,.,}|))|,|}}}},}||||||.{(((....}}}}(((((((((,..((((..(((((((...((((((,,(({((,,{(((.....||....}}}}||,,||,||||..,,(((((((((((((({((((.......,,,},,........,|,,.{{{.......)))..,,))},...,)))))))))},||||||||...,,,,..})))))),...,..}}}}..}))))}.)))))))..)))).......((((((((,((((((..................)))))).))))))))((((....))))..((((((.((((.(((((((((((((.....{((((....((((((.,....,.)))))).})))}..,|,..((((...((......))...))))......)))))))))))))...)))))))))).))))))))).......}}}})),..}|{|||||||{((({((({{{{|,},,,,,,..)))))))),||||})))).,......{({......}))}}}}})},)}}......
Back