Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

SNHG1:12

Sequence Length

870 nt

GC Content

0.4632

UUCUGUGUUGUAGCUGCCUGGCCAGGGCGACUGGCGGAUAAGGUCUUGUGCGUGGCCUCGAGGCUUAAAAGUAGCAGUGGGGCUUUGUGAAGGACAAAAUGGCGAUGGCGGGCCGUGUAGGUCCCCCUUCCUAUGAUGAGGACCUUUUCACAGACCUGUACUGAGCUCCGUGAGGAUAAAUAACUCUGAGGAGAUGGGCCCUGCAAGCCUCUUGCUUAGCCGUCUGUUCAGAAAAUAGCGUUUUCGAAAUGCCCUGAGUUGACCUAAUGUCUUAUUGGGCUCCUGUCUGCAGGAUUUACGCGCACGUUGGAACCGAAGAGAGCUCUGUUGUUGCAAUGUUCAGCCCACAAGAGCUUACUGGUGAAGGAAUGGGACAAGACCCAUCUUUAUGCAAAGCCAGCGUUACAGUAAUGUUCCAGGUAGGUGUACAUGGUUUAUGCUCUUACAGAGGAGACCUUGUAGAUAACCACUCCAUGAUGAACACAAAAUGACAAGCAUAUGGCUGAACUUUCAAGUGAUGUCAUCUUACUACUGAGAAGUGAGAGAGAGGUCUUAAGGGGUCUUUGAAUGACUAUUUUUAGGUACAUAAAAUGCUUUCCUCUGUUGUCUACAGCAUCUCAUAAUCUAUCCUGGGGAAUUCAGCUGCCUCCCAGGGUGAAUACAGGUAAUUAUCCAAAUUGGUGUAUGUCAUCUUUGUAAAUGUUCAAGAAAACAAGUGGCCGGCGGAACAAUGUUUUUUGGCGCCUUCCAUCUUGUUCCUCUUGAAAUGAUUUUCUGGGGAGGGAGAUCGCAACCCGGUACUACAGUUCUUGUAAGGGUGUGCUGUUACCCUCAUCCAUAUAUCGAUCACGUUACUGUCAGAUGAUUUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-270.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -286.17

Frequency: 0.0000

Diversity: 269.1

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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