Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG1:17
Sequence Length
594 nt
GC Content
0.4343
CUUAUUGGGCUCCUGUCUGCAGGAUUUACGCGCACGUUGGAACCGAAGAGAGCUCUGUUGUUGCACCCACAAGAGCUUACUGGUGAAGGAAUGGGACAAGACCCAUCUUUAUGCAAAGCCAGCGUUACAGUAAUGUUCCAGGUAGGUGUACAUGGUUUAUGCUCUUACAGAGGAGACCUUGUAGAUAACCACUCCAUGAUGAACACAAAAUGACAAGCAUAUGGCUGAACUUUCAAGUGAUGUCAUCUUACUACUGAGAAGUGAGAGAGAGGUCUUAAGGGGUCUUUGAAUGACUAUUUUUAGGUACAUAAAAUGCUUUCCUCUGUUGUCUACAGCAUCUCAUAAUCUAUCCUGGGGAAUUCAGCUGCCUCCCAGGGUGAAUACAGGUAAUUAUCCAAAUUGGUGUAUGUCAUCUUUGUAAAUGUUCAAGAAAACAAGUGGCCGGCGGAACAAUGUUUUUUGGCGCCUUCCAUCUUGUUCCUCUUGAAAUGAUUUUCUGGGGAGGGAGAUCGCAACCCGGUACUACAGUUCUUGUAAGGGUGUGCUGUUACCCUCAUCCAUAUAUCGAUCACGUUACUGUCAGAUGAUUUGAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-165 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -177.6
Frequency: 0.0000
Diversity: 119.21
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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