Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG1:36
Sequence Length
633 nt
GC Content
0.4408
CUCAUUUUUCUACUGCUCGUGGAUUUACGCGCACGUUGGAACCGAAGAGAGCUCUGUUGUUGCAAUGUUCAGCCCACAAGAGCUUACUGGUGAAGGAAUGGGACAAGACCCAUCUUUAUGCAAAGCCAGCGUUACAGUAAUGUUCCAGGUAUUCCUGAUGACAGUCUGCCUCUAUCUUACAGAGCAGCUUGUUGCUAUAUACCAUUGAAAAGCCUUCAGAGCUGAGAGGUACUACUAACCAAUAACCUGCUUGGCUCAAAGGGCCAGCACCUUCUCUCUAAAGCCCAAGAGGAGUUUGAGGAAAACUAGGUGUCUGUGUUCACUCCAGGCUGAAGUUACAGGUGAGCACUGUAUAGAUGACCACUUUCGUAAACUACUGACCUAGCUUGUUGCCAAUUGUUGAUUGAACUUCCCAUAACUCCACUUCGUGUCUGUUCCUCUGUAUACAGCCACCUUCUGUUCCCGUCAUGAGCCUUUAGGUCUCCAUUUGCAUAUUGCAAAUACUAUGUUCCAUGUAGGUAGCUCAUUCAGGGCCUUGCUCUUCACUUCAAAAAAGGUUCCCUUGAGGACUGGCUGUCAAUUUGUGUUGCUGUGUUGGUUGUUGAUGAAAAUAAUAAAAUGAUUGAUUACAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-166.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -179.8
Frequency: 0.0000
Diversity: 111.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((((((((.((((....)))).))).).))))(((..((.(((((((((.((((.......))))..)).))))))).))))).(((((.((((......)))))))))...((((((((((...((((((((....((((....)))).((((((((.(((((........(((((((((((..(((((.(((.((.(((..(((((..((((((((((((..............)))).))))))))..)))))......(((((((..........)))))))..(((((((....(((((.((((((.((...(((((((((((.((((((.((..(.(((...((((......))))....))).)..)).))))))...(((((...)))))................)))))).)))))......)).)))))).)))))....))))..))).(((((....)).))).(((((((...)))))))......))).))))).))))).....))))...)))))))...........((((...)))))))).).))))))))......))))))))))))))).)))...........)))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((((((((((.((((....)))).))).),})))(((,.,(.((((((({{.({,({......}}))..)),))))))).))))).{(((,{((((......))))))))},,.{{,(((((((...((((((((....((((....)))).((((((((.(((((........(((((((((({..(((({.{{,.,,.({,..(((((..((((((((((((..............)))).))))))))..)))))......(((((((..........)))))))..|{,((((....(((((.((((((.((...(((((((((((.{{((((.{{..,.{{{..,({({......))))....,,),.,,}}.||,,},.},{{{{{...}}}}}................)))))).)))))......)).)))))).)))))....))))..,,,.(((((....)).))).(((((({...}))))))....,,}}}.))))),))))).....}}))}}.,))))))...........{(((...)))})))).).))))))))......))))))))))))))).}}},,.........}))))))...........
Back