Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

SNHG1:40

Sequence Length

997 nt

GC Content

0.4544

CUCAUUUUUCUACUGCUCGUGGUAAGUGGCUUCGUGGUCUUUAUAGCUGUUACUCUUUUGUACUUUGUCUUUUUCUUUUAUUUUCUUUUGAGCGAUUGUGCGAACAUAGCAUAGCACGCACUAUGCCUUCUGUGUUGUAGCUGCCUGGCCAGGGCGACUGGCGGAUAAGGUCUUGUGCGUGGCCUCGAGGCUUAAAAGUAGCAGUGGGGCUUUGUGAAGGACAAAAUGGCGAUGGCGGGCCGUGUAGGUCCCCCUUCCUAUGAUGAGGACCUUUUCACAGACCUGUACUGAGCUCCGUGAGGAUAAAUAACUCUGAGGAGAUGGGCCCUGCAAGCCUCUUGCUUAGCCGUCUGUUCAGAAAAUAGCGUUUUCGAAAUGCCCUGAGUUGACCUAAUGUCUUAUUGGGCUCCUGUCUGCAGGAUUUACGCGCACGUUGGAACCGAAGAGAGCUCUGUUGUUGCAAUGUUCAGCCCACAAGAGCUUACUGGUGAAGGAAUGGGACAAGACCCAUCUUUAUGCAAAGCCAGCGUUACAGUAAUGUUCCAGGUAGGUGUACAUGGUUUAUGCUCUUACAGAGGAGACCUUGUAGAUAACCACUCCAUGAUGAACACAAAAUGACAAGCAUAUGGCUGAACUUUCAAGUGAUGUCAUCUUACUACUGAGAAGUGAGAGAGAGGUCUUAAGGGGUCUUUGAAUGACUAUUUUUAGGUACAUAAAAUGCUUUCCUCUGUUGUCUACAGCAUCUCAUAAUCUAUCCUGGGGAAUUCAGCUGCCUCCCAGGGUGAAUACAGGUAAUUAUCCAAAUUGGUGUAUGUCAUCUUUGUAAAUGUUCAAGAAAACAAGUGGCCGGCGGAACAAUGUUUUUUGGCGCCUUCCAUCUUGUUCCUCUUGAAAUGAUUUUCUGGGGAGGGAGAUCGCAACCCGGUACUACAGUUCUUGUAAGGGUGUGCUGUUACCCUCAUCCAUAUAUCGAUCACGUUACUGUCAGAUGAUUUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-302 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -320.88

Frequency: 0.0000

Diversity: 294.8

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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