Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG1:55
Sequence Length
535 nt
GC Content
0.4542
UCUGCAGGAUUUACGCGCACGUUGGAACCGAAGAGAGCUCUGUUGUUGCAAUGUUCAGCCCACAAGAGCUUACUGGUGAAGGAAUGGGACAAGACCCAUCUUUAUGCAAAGCCAGCGUUACAGUAAUGUUCCAGCAUCUCAUAAUCUAUCCUGGGGAAUUCAGCUGCCUCCCAGGGUGAAUACAGGUAUUCCUGAUGACAGUCUGCCUCUAUCUUACAGAGCAGCUUGUUGCUAUAUACCAUUGAAAAGCCUUCAGAGCUGAGAGGUACUACUAACCAAUAACCUGCUUGGCUCAAAGGGCCAGCACCUUCUCUCUAAAGCCCAAGAGGAGUUUGAGGUAAAUGGCUUUGCAAUAGUUACCAUCAAUGGCUGCUAUAUAAAAUUUUCUGUGAUUUUUGUGUGUGAUAGCACUGUGGUCUGGGUGAAUGUACACAGACAUAACUGGCUUAACCCAAAGUCUUUGAUCUCCUGAACCACCAGUGAUGAAUUGCUGCUCACCAGUGAUGAGUUGAAUACCGCCCCAGUCUGAUCAAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-150.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -161.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 140.55
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((..(((((...(((.((((((.(((...(((....)))...))).))))))(((((.((.......((((((((((((((.((((......))))))))..((((((((((((...(((....)))....))((((((.....((((((((((............))))))))))....((((....))))..(((((.((((.(((.......))))))).)))))..................(((((..((((((((((((..............)))).))))))))..)))))......(((((((..........)))))))..))))))...))))))))))(((((..(((....)))..)))))..((((((......))))))(((.(((((((.((((........))))..))).)))).)))....(((......))).(((..((.(((..(((......))).))).))..)))..)))))))))))).)))))....)))...)))))...))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{,{,(({(({{(({{.{|||,|,|{||..|||(((((((,,.(||(|......||)).,}},})))))),{{{(((((((,{((((......))))))))}.((((((((((((,..(({....)))....)){{{{{{...,,{(((((((((............})))))))))....((((....)))).,(((((.((({{(((.......))))))).)))))},....,,,,...,....(((((..((((((((((((..............)))).))))))))..)))))....,.(((((((..........)))))))..})))))...))))))))))(((((..(((....}))..))))),,(((({(......))})))}}}||||}...}|||{(((((.{(((.({.,,{.{,.{{||,,...{((,,....}}},}))),.},,}}.))}|.})))}}))|),,.,}}}}))},,}}))})|||{.{||||.......,..))).)).))),...
Back