Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG1:56
Sequence Length
579 nt
GC Content
0.4318
UCUGCAGGAUUUACGCGCACGUUGGAACCGAAGAGAGCUCUGUUGUUGCACCCACAAGAGCUUACUGGUGAAGGAAUGGGACAAGACCCAUCUUUAUGCAAAGCCAGCGUUACAGUAAUGUUCCAGGUAGGUGUACAUGGUUUAUGCUCUUACAGAGGAGACCUUGUAGAUAACCACUCCAUGAUGAACACAAAAUGACAAGCAUAUGGCUGAACUUUCAAGUGAUGUCAUCUUACUACUGAGAAGUGAGAGAGAGGUCUUAAGGGGUCUUUGAAUGACUAUUUUUAGGUACAUAAAAUGCUUUCCUCUGUUGUCUACAGCAUCUCAUAAUCUAUCCUGGGGAAUUCAGCUGCCUCCCAGGGUGAAUACAGGUAAUUAUCCAAAUUGGUGUAUGUCAUCUUUGUAAAUGUUCAAGAAAACAAGUGGCCGGCGGAACAAUGUUUUUUGGCGCCUUCCAUCUUGUUCCUCUUGAAAUGAUUUUCUGGGGAGGGAGAUCGCAACCCGGUACUACAGUUCUUGUAAGGGUGUGCUGUUACCCUCAUCCAUAUAUCGAUCACGUUACUGUCAGAUGAUUUGAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-159.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -171.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 155.6
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((.(((((.((..((((((((...((((((.....(((.(((((.((..((((((((((...(((((.((((......)))))))))((((.......))))..)))))).))))...)).))))))))........))))))......((((..(((((((((((.....(((..((....))..)))..((((((.((((...(((....)))...))))(((((((.......)))))))....(..(((((((((((.......))))..)))))))..).....))))))......)))))))))))..))))......((((((((((............))))))))))......))).....)))))..))))))).))).............(((((((.(((((((((..((((...(((......))).))))..))).))))))..)))))))..(((....(((((((((.(((.(((((((..(((..........))).)))).))).))).))))).))))...)))..........))).))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,(((,(,...,,|||,|(((((((.(((..,(.(((((((,,,(..,...,.}},})))))).|||}|.((((,,((((......)))))))))...,....))))))).,{{{{{{{({,|..{({.,{{.|||{.{{{{....({{{,..}}}},|||}},||||,||,||}.........,|...{{{{{{{((({.((((,({(({,.,,,.,,.})).,}))},{((((((.....,.))))}}},{((({,{{{((({((((.......)))}..,}}))))..}.....,,,}}}}}))}|||||,,,,)))},}}}}....,,{(((((((((............}))))))))),,,...|||......}}.,..}})))),))))}}.))))}.....(((((((.(((((((((..((((...(((......))).))))..))).))))))..))))))}.,(((....(((((((((.(((.(((((((..(((..........))).)))).))).))).))))).))))...)))},..)))))))))}||||..........
Back