Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SNHG8:3
Sequence Length
313 nt
GC Content
0.4121
GUUCUAUAAGAGAGCGUGUGCCGAAGGCCUCGGCCUUUCACAUUCGGGAAGCGUCGGGAUUAGGUGAAAGAAGCUGAGCUGAACACAUUACGAUGGAUGAUGGAAACAUAAGACUAUCAAGAAAUCCAAGUGGUAAUGGGCGAAGUUUAUUCAGCAUCCGGCAAUGGACUUAUCGUAGUUGGGGAAACGGGUGUUCCGAAUAAUAUCCUGGAAGUUAUCAGGACACCUAUUUUAAAUAUAGGCCUGAAUUUUGUAAAGUAAUAUUUAAGGUGGUCCGUGAUAAUUAAAUAAAAUGCUUAAUUCAUGUGGCUAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-83.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -89.55
Frequency: 0.0001
Diversity: 64.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((.(((((((((((..((((((....))))))))).(((((((....(((((((..(.((((..(((((..(((.....((((((.(((((((((((..........)))))).....))))..).)))))))))..))))).)))).)(((((....(.((((......)))).).....))))))))))))......)))))))((((((((((((((((....(((((((..((..............)).))))))))))).)))).)))))))).......))))))...)).)))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{,(({{{.{|||||(((((..((((((....)))))))))}|((((((....((((({{..{.((((..(((((..(((.....((((((.(((((((((((..........)))))).....)))}.,).)))))))))..))))).)))}{|(((((....(.((((......)))).).....))))))))))))......))))))}(((((((((((({(((,,.,(((((((..{{,{............)).)))))))))))}}))).)))))))).......,,))))..,)).))))),,..
Back