Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

SOX1-OT:16

Sequence Length

368 nt

GC Content

0.6467

GCCCGCGGCUACGGGGCUGGCGCUGCCGGAGCCGGGCCGGACCGGGGUCCGAGAUCUGCGUCGCGCUGGGCACGCUGGCCACCCGGUCCGGAAUGAGUCGGGGCUCCGGGAGGUGCCCGUGGGCAGAGCGUUAGGGGCGCGGCCGUGCCGGACCCGCCCUGGGGACCCGCUGGAGCUGGAGGAGGAACUAACUAGCCAGCUUCCGUUCCUCAGCCUUUCUUCUCUAAACACCAAGUUCCACCAUUGACAGAACACUGAGUCCUGCACAGUCACAUGGACACGAGUAAGGAGAGUUCAGAGGCUGCAGUGGAGUUCCACACGAAGCACAGGAGGUGAAACCCCUUUUUCCUGGCUCCUCAGGAGACAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-153.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -160.17

Frequency: 0.0000

Diversity: 116.61

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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