Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SOX1-OT:20
Sequence Length
471 nt
GC Content
0.5711
AGCAAGCGCAGCUCUCAGGCCGGGCCUGAGCCUGCAGCCUGUGUGCCCUCCAUCAUCAGGGCCCCCUCUCAGGACAGGCUACACCGAGGGUGGGACGGCGGACUUCCAGGGACACUUCCAAGUCGUGCCCAUGCAGAUACCUCAGUAUACACUGCCCACAGUUAAGAAACCACGACCUGAGACAUUGUUUUGAAGAGGUGAAAAUGCCUCCACUCAAGUGGCCCAGGAGCGUGAUCCAGGAAGACGAACACACAGAACCAUCUUCUGCAUGGUUUGAAAAUUCAGUGGAAACUAGGACUCCAAGCUGCUGUCCCCUCUCUGCCGCAUCUGAGGCUGGGAAAACUUCCUAGGAGAAGGCAAGAGAAAGCCACCAGACCAGAGCCGAGGACUAAACUUUAAGGUCGAAGACGGCAGAGGGGCAGGUUCUCCCCUGCACACCCCAAGGCCUCUCCUGCACCCGCGAGGCCUUCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-161.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -170.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 82.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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