Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SOX2-OT:18
Sequence Length
847 nt
GC Content
0.4510
GAUUCCAAGGAUUGAGAAGUUUUGCAGUGGUCAACUGGUAUAGACAUCCCAUUACCACUACUUCCUUCAUUGGACUGCAAGGUAUUUCUGUUUGGAAAAGUAAUGGAGUCCAGUCAACUUCAUUGAUCGCCAAGGACUGUCAAAAUUAUAAAACUUGCUGUGGAGCUCUGACAUGCCAGAAGCCGCUAGAAAAAGAAGUUUGACAUUCAGAAACUUAUCAAGAGGUUCUACUCUUUGGAUAGAGACCAAAAUCAUACUUUGAAUGAUAUGCAAUGCAAGACUCCCAAGAUUCUGGGCAGUGGCAGGGAGGUGCAGCUUCUAGUCUGCCGCAUGAUCACAAUGAAAGCCUGACAGGUUUCUUCGGAAAAGUGGCCAUCCAUGGAAUGAAUGAAAUGUUCUCUUUCUAUUCCACCUCUAGAGACCAUCAAAAAACAAUGGCUCAUAAUGCUUUUAGAACAGAAACUGAAGUUGUAUACUGUGCAUAUGUAAUCCUACACAAGAGGAAGGCAAUGUUUAAAGCUGCUGUCACCUCUUAGGGAAAAAACUGGAAUUCUGAGUCAAGGGAUUGCAGUGGCAAAGCUAGGCUAGGUCUUGGAGGCUGGUGUAAGGCGAUGUGGGUGAAGGCAGGAGGCUGAUGGAAAGACUGGGGGGAAGAAAAGCCGAAAUGGAUUCACGGUGCCUUGGAUGAAGGACGAGAGGGGAACUGCAAGCUCCUUCAACUGGUUCUGUCCGGUGAGAAGUGAUCAAGCUUGGGCUGACAAGAGGCUCAGGGAGCCCUCACGUUCUUUCGCUUUUUUACCUGCCAAUCAAACUGCUACAAGACAACACCCUGAUCUGGCAUGGACAU

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-235.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -252.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 174.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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