Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SOX2-OT:40
Sequence Length
629 nt
GC Content
0.4944
CAGGGGAUUGCAGUGGCAAAGCUAGGCUAGGUCUUGGAGGCUGGUGUAAGGCGAUGUGGGUGAAGGCAGGAGGCUGAUGGAAAGACUGGGGGGAAGAAAAGCCGAAAUGGAUUCACGGUGCCUUGGAUGAAGGACGAGAGGGGAACUGCAAGCUCCUUCAACUGGUUCUGUCCGGUGAGAAGUGAUCAAGCUUGGGCUGACAAGAGGCUCAGGGAGCCCUCACGUUCUUUCGCUUUUUUACCUGCCAAUCAAACUGCUACAAGACAACACCCUGAUCUGGCAUGGACAUUCAUUGCAGUCACCUGGAGUCACGGAAAUGACCAUGAUUGCCUGAACUUUCAUGACUUCUGUGGAUAACUGUGGUUGCAGAAAAGAGAAAACCUGGACCGUGAGGGACAUUUCACUCCCUGGGCUUUGCCUUGGUUGUUUACUUGUAUCUAAGACAGAGGUGUCCAAUAUUUUGGCUUCCCUGGGCCACAAUGGAAGAAGAAUAGUCUUGGGCCACACAUAAAAUACACUAAUGCUAACAAUAGCUGAUGAGCUAAAAAAUAAAAAUAAAAAUACGCCGGGCACGGUGGCCCACACCUGGAAUCCCAGCACUUUGGGACGACGAGGCAGGCGGAUCACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-197.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -209.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 133.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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