Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SOX2-OT:42
Sequence Length
515 nt
GC Content
0.5146
CAGGGGAUUGCAGUGGCAAAGCUAGGCUAGGUCUUGGAGGCUGGUGUAAGGCGAUGUGGGUGAAGGCAGGAGGCUGAUGGAAAGACUGGGGGGAAGAAAAGCCGAAAUGGAUUCACGGUGCCUUGGAUGAAGGACGAGAGGGGAACUGCAAGCUCCUUCAACUGGUUCUGUCCGGUGAGAAGUGAUCAAGCUUGGGCUGACAAGAGGCUCAGGGAGCCCUCACGUUCUUUCGCUUUUUUACCUGCCAAUCAAACUGCUACAAGACAACACCCUGAUCUGGCAUGGACAUUCAUUGCAGUCACCUGGAGUCACGGAAAUGACCAUGAUUGCCUGAACUUUCAUGACUUCUGUGGAUAACUGUGGUUGCAGAAAAGAGAAAACCUGGACCGUGAGGGACAUUUCACUCCCUGGGCUUUGGUACAUGAGUCUUGCUGUGAUGCCCAGGCUGCUGGAGUGCAAUGGUGUGAUCUCUGCUCACUGCAACCUUUGAUUCCUGGGUUCAAGAGAUUCUCCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-166.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -177.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 186.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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