Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
SOX2-OT:46
Sequence Length
853 nt
GC Content
0.4642
CAGGGGAUUGCAGUGGCAAAGCUAGGCUAGGUCUUGGAGGCUGGUGUAAGGCGAUGUGGGUGAAGGCAGGAGGCUGAUGGAAAGACUGGGGGGAAGAAAAGCCGAAAUGGAUUCACGGUGCCUUGGAUGAAGGACGAGAGGGGAACUGCAAGCUCCUUCAACUGGUUCUGUCCGGUGAGAAGUGAUCAAGCUUGGGCUGACAAGAGGCUCAGGGAGCCCUCACGUUCUUUCGCUUUUUUACCUGCCAAUCAAACUGCUACAAGACAACACCCUGAUCUGGCAUGGACAUACUGAGUCUCACUCUGUCGCCCAGGUUGGAGUGCAGUGGCGCGAUCUUGGCUCACUGCAACCGCCACUUCCCAGGUUCAAGUGGUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUACCUGAAAUUACAGGCGCCCGCCACCACGCCAGUCUCAAUACCUUCACAGAGGUGAAGAAGCAGCAACCAAAUGAAUUAGACAGCAACAUGAUUCCUAGAGAAUGGCAAGACCAAUUCUUCAACUACUUCUUCAGCAUUUCUGAAACAUAUGGAAGAUGGCCCAUUGUGCUCUCUUAAUUCUUUGAUAAUCUGGACAUUGACUUUUCCAUUAUAUGACCUGGGCUUGUGGGCAUCAUGUCAUAAUGCACCUGUUCAGACAUCUCCCUGUACCAAUAUGGAUCACUUGAAGAGACUCCUUUGCCCCCAUCAAAAAGGAUACAGUUGUGUAUCUCUUCCAUUUUUGUUUACAGUGCCUAAAAUUAUUUGAGCAGUUUUUCACCUCUUCUCUGAUAAACACCUUAUUAGUCCUUAAAAAGAAAAGAAAAAAGGAAAAUAAAACUUUUAUUGAGAUCCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-252.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -271.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 220.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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