Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
STARD4-AS1:3
Sequence Length
523 nt
GC Content
0.3996
GUGGCAGCAUCUCGGUCACUUACCACAAGGAAACAAUGAGUUUCAAACUACUUCUAUACAUCAAAAGAGUACAUGGAUAAAAUAUAGAGAUAUACAGACAAUUGAUGAACAUAAACUACUAGAAUAACUCAAUCUCAGUGUGACUACUGAUCCGCCGCCACGUGGCUUCCCGGACACACUGCUGCAGCGCCAACAGUGGAGAGGAGCUCUCCAUCACAACCAGACAGCAGAAGCACAGCACAGUGAAGCACACCUGCCCACAUGAUGCACAAUACAGGUAUUCAUUUACAACAGAUAGAUUUUAUGCCCUGUACAGGUAUGAACACAGUGAAGAUUUGACGAUGGUCUCUCUUUCAGCUGAACUCUGGAGUUUUAAUUACUGACAUUUUCUUGGAAGAAAUUAUCCUUUGUGGUUUUAAAACAUGUGGGCUUUUUUUUUUGUUGCUCAAGUCACAUGUUCUAACAAGACAGUUUUAAUAAGCCAGUUUGACUAGAUGUAAAGUACUUGGAUUAAAGUGAUAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-111.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -122.8
Frequency: 0.0000
Diversity: 139.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..............(((((((....(((((((((.....)))))....(((((...((((((..((((.((((.((((((.....(((((....(((..((((((........((((.(((((...........((((((....))))))((((..(((....)))....))))....((((((...........((((((((...))))))))..........)))))).......((((((((..(((....))).))).)).))).........(((......)))...........((((((((.......))))))))..(((((((((...(((....)))..)))))..))))...))))))))))))))).)))....))))).........))))))..)))).))))..(((((((((.(((...............))))))))))))....((((...((((....))))...))))....))))))))))))))).....)))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((((.(((({...((((((((((,,,....,|||}}....,|||{,,,{,{,((....}}||,,{||||,....,,{{...,},},,,....,}}|}}}.....,{{{{.{((((...........{(((((,...}})))}{((({,((,..}})))....}))}....((((((,..........((((((((...))))))))........,.)))))).......{{{{{(((..(({....})).}}}.|},|||.,..(((((((((..{((({{....}.)}))}...)))|}}))))..}))}),,...(((((((({...(((....)))..}))))},})))...))))))))}}{((((.((..((......))..)).)))))}}))))))))).,{,.{(((((({{{({,...........,,,.}}}))))))))).}},..,{{{.((((....))))..))})))))))))))....{((((......))))).....
Back