Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

STX18-AS1:11

Sequence Length

808 nt

GC Content

0.5124

CCGGCCUCAGCCGGCGCACCUGGCGGAGGAGGAACCUCGCGACGCGCUCUCGGGCAUCGGUUUCUCCCAGCAAAGCUUGGAGGGUUUAGCUGCGCGGAGAGCUCAGCGAGCUCUUCUGUGUCUGUUUGGGGCGUGUGGGCUCCGGGAGCGUGAGGACCGGGAAGCUAGGAGGCUCCUUCCCUUCUGGCGGCUCCCUCACUGAGACCGGGCGGUUUGGUUGCGGGGGAAGUGGAGACGAGCCACCCUUGACCUUUGACUGCAAGAACUCACCUUGAGCAGGAUAGAGGCACGUGGACGGUGACCCUCGGGAUGCAAUAAAUGCUGAGACAGAUCAGGUGUGCAAGGCACAGAGCUAGAGGCCAGAGGCCUUUCUUCUCCAACCUUCAGUCACCUCUUUUUAAAGUGAAGCCAGCAUCCUCCUCGGGGUUUACUGUGAAAAUUAAGUGAGCUGACGCGUGCUGUGUUUUGAUGUUGCUUGGCUCCUACAAACAUUGAGUGGGCCAGACACUGUUCUGAAAAAUACGCAGUCGACUUUUGAACAGCACAGGCUUGAACUGCAUGCGGCCACUAAUACUCGGACUUCCUUCUGCCUCUGCCAUCCCUAAGACAGCAAGACCCACCCCUCCUGCUCCUCAGCCUACUCGAUGUGAUGAUGGUGAGUAUGAAGACCUUUACUUUAUGAUGAUCCACUUCCAUUUAAUGGAUAGUAAAUAUAUUUUCUCUUCCUAUGAUUUUCUUAAUACCAUUUUCUUUUCUCUAGCUUACUUUAUUGAAAGAAUACAGUAUCUAAUACAUAUGACAUGCAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-258.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -275.75

Frequency: 0.0000

Diversity: 203.94

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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