Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

STX18-AS1:14

Sequence Length

2131 nt

GC Content

0.4796

CCGGCCUCAGCCGGCGCACCUGGCGGAGGAGGAACCUCGCGACGCGCUCUCGGGCAUCGGUUUCUCCCAGCAAAGCUUGGAGGGUUUAGCUGCGCGGAGAGCUCAGCGAGCUCUUCUGUGUCUGUUUGGGGCGUGUGGGCUCCGGGAGCGUGAGGACCGGGAAGCUAGGAGGCUCCUUCCCUUCUGGCGGCUCCCUCACUGAGACCGGGCGGUUUGGUUGCGGGGGAAGUGGAGACGAGCCACCCUUGACCUUUGACUGCAAGAACUCACCUUGAGCAGGAUAGAGGCACGUGGACGGUGACCCUCGGGAUGCAAUAAAUGCUGAGACAGAUCAGCAAACAUUGAGUGGGCCAGACACUGUUCUGAAAAAUACGCAGUCGACUUUUGAACAGCACAGGCUUGAACUGCAUGCGGCCACUAAUACUCGGACUUCCUUCUGCCUCUGCCAUCCCUAAGACAGCAAGACCCACCCCUCCUGCUCCUCAGCCUACUCGAUGUGAUGAUGGGAACCAGAAGUCUGGACUAGAUCAGAGCUUCUCAAAUCAUCCGAGGAUCCUGUUAAAAUGUGGAGCCUGAUGAGGAGACCUGCUGGGGGCAGACAUCCUGCACUUCUAACAAGCUCCCAGAGGAUGCAGUUACUUUUGCCCAUCUGUGGAUUCACUGAGGAGCAAGCAGGACUUCUAAGGUCACCUCUUGCUCUGAAGGGACAGACCUUGAGCCCUGGCAGUGGGCACAAAGAGAGUGACAAAAACAAAAAACAAACAAACAACAACAACAACAAAAACCCAGUUGCCCAGAUUUGGGUCAGCCAGGAGAGCACAGAAUGUGAAAUGAUUCCAGAGGGAUCCUUCCAACCACAGAUACAAAAAUCAACAUCGUCAUCGUCACCAUCAGCAAACAUUUGUGCAGUGCUUUCCCCUGUCCUGAGCAGCUGUCACAUCCUUGAACCCAGUUGACCCCUACAGGCACCCUGGUGGGAGAGGAGGACACGGCUGAGGAAUCCAUUCAGUCCCGGUGGAGGAGCUGGGCAAGAGCACAAUAGUCCCUGAAAGGAUUGUUUCCAUGCAGCCCUUUGAUUUUCUUAGCAUUUUUUUUUUUUUGGUGCCUGCUUUCUGACCCCUUCUUCCUUUGUCUCCUAAUGCACCCCCACCCCGCUCCUAAUUCUUCCCUCCCCCAACACACACACACACACACACACACACACACACACACAAAAACGUCAGGAGGAGAAAAUCAGUGUAUCCACCCACAGAUUUCUCACUUUGAUCCUUUCCUGUCUCACCGCCUGGAACCCAGCUUCAGAGACCAGGAUUCUGGCUCGUUUUGGGGUGACCCAGUCACUUCCACUCUUCUCACUUGUAACUAUGCAAUUUUCCUUAAGGUGACAUUUGUGAAGGAUUUAUGUUGUCUGGGCACUAUGCUGAGUGACUUCAUUCUCACUUCACCCUAGGGAGUGGGAACUCUUAACUAUCUCCACUUCAUUGGUGAGAAAACUGAGCCUUUAGGAUGUUUGCCUGCCCAAGGUCACCUAGUUAGUAAAUGAUGGAGUCAGGACAUUACCUGACCUUGGCUGACUGACAUCAAAGAUCAUUGUAGAUGAACGCACAGUUGUAAGAAGUAAUACAGAGAGAUUUGUGUAACUCUUAUCCAGUUUUCUCCAAAGGGAGCAUCUUGCAAAACUGUACUACAAUAUCAUAACAAAGAUAUUGACACUGAUAAAAUCCACCAGCCUUAUUCAGAUUUCCUCAGUUUUACUUGUCCUCAUGUGAGUGUAUUUAGUUCUUUGCAAUUUUAACAUGUAUGUAGGUCCAUGUAUGUAGCGCCACAGUCAAGAUACACAACAGCUCUGUCAGCACAGGCUUCUGCAGCCUUUAAUAAUCACAUCUACUUCUCCAUGUCACCCAGCAUCCCUCAUUCUUGUAACACUAAACCUGUUCUCUAUCUCUAUAAUUUCAUUAUUUCGAGAAUGUUCUGUAAGUGGAAGUAUAUGCUUCUGGGAUUGGCUUUUUGACUCAGUCUAAUUCUCUUGAGAGUCACUGAGUUAUGGCAUGCAUCAGUAGUGUUUUGUUUUUUUUUUUAAUUUUAACUGAGUGGUGUUCCAUGGCAUAGAAGUACCACAGUUUCUUUAACC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-646.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -685.23

Frequency: 0.0000

Diversity: 432.12

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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