Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

STX18-AS1:2

Sequence Length

665 nt

GC Content

0.5639

GAAAAAGGUUCCGGCCUCAGCCGGCGCACCUGGCGGAGGAGGAACCUCGCGACGCGCUCUCGGGCAUCGGUUUCUCCCAGCAAAGCUUGGAGGGUUUAGCUGCGCGGAGAGCUCAGCGAGCUCUUCUGUGUCUGUUUGGGGCGUGUGGGCUCCGGGAGCGUGAGGACCGGGAAGCUAGGAGGCUCCUUCCCUUCUGGCGGCUCCCUCACUGAGACCGGGCGGUUUGGUUGCGGGGGAAGUGGAGACGAGCCACCCUUGACCUUUGACUGCAAGAACUCACCUUGAGCAGGAUAGAGGCACGUGGACGGUGACCCUCGGGAUGCAAUAAAUGCUGAGACAGAUCAGGUGUGCAAGGCACAGAGCUAGAGGCCAGAGGCCUUUCUUCUCCAACCUUCAGUCACCUCUUUUUAAAGUGAAGCCAGCAUCCUCCUCGGGGUUUACUGUGAAAAUUAAGUGAGCUGACGCGUGCUGUGUUUUGAUGUUGCUUGGCUCCUACAAACAUUGAGUGGGCCAGACACUGUUCUGAAAAAUACGCAGUCGACUUUUGAACAGCACAGGCUUGAACUGCAUGCGGCCACUAAUACUCGGACUUCCUUCUGCCUCUGCCAUCCCUAAGACAGCAAGACCCACCCCUCCUGCUCCUCAGCCUACUCGAUGUGAUGAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-243.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -256.8

Frequency: 0.0000

Diversity: 121.3

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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