Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

STX18-AS1:23

Sequence Length

2479 nt

GC Content

0.4683

GAAAAAGGUUCCGGCCUCAGCCGGCGCACCUGGCGGAGGAGGAACCUCGCGACGCGCUCUCGGGCAUCGGUUUCUCCCAGCAAAGCUUGGAGGGUUUAGCUGCGCGGAGAGCUCAGCGAGCUCUUCUGUGUCUGUUUGGGGCGUGUGGGCUCCGGGAGCGUGAGGACCGGGAAGCUAGGAGGCUCCUUCCCUUCUGGCGGCUCCCUCACUGAGACCGGGCGGUUUGGUUGCGGGGGAAGUGGAGACGAGCCACCCUUGACCUUUGACUGCAAGAACUCACCUUGAGCAGGAUAGAGGCACGUGGACGGUGACCCUCGGGAUGCAAUAAAUGCUGAGACAGAUCAGCAAACAUUGAGUGGGCCAGACACUGUUCUGAAAAAUACGCAGUCGACUUUUGAACAGCACAGGCUUGAACUGCAUGCGGCCACUAAUACUCGGACUUCCUUCUGCCUCUGCCAUCCCUAAGACAGCAAGACCCACCCCUCCUGCUCCUCAGCCUACUCGAUGUGAUGAUGAUGCAGAGAUUCAGAGAGUCUAAGCAACUUUUCUAAAUCAUCUAGCUGGAAUUCAGUAACUGAGCCAGGAUCUACCCCAGGUCUGUCUGACUCCAAAGCCUGUGUCUUCCAGCACACACUGCUGCUGCCUGGGGAAUGUGGAUAUGAUGUCUGGAGCUCUAGCAACCAUAUCAGACCACAAGGAUGAAUGUACACCCCAGGAAUGGAAGAGAGGAAAGCCAGAAAAAGACUCGGUCCCUGAUGGCUGAAGAGCUACCAUACCUGCCCCUAGAUCUUCUAUUUCUGAUCAUCUUCUAUGCAAGGCCUGGAAUGUAAUCAUGGAUAGCCAUGGAUGAUCAGCUUUCAUCAUGUGGGCAUGGAACAAGAUGGAAGGAAGCUGGGGCCCUGAGUGACCUGUGGAGCAGAGGCCUUUGCCCACCCUGGGCUGCCUGAUUUCCCCUGGACUAUCAUGAGACAGAAGAAAAAGCUUCUAUCUUAUUUGAACCACUGUGUUUUGGGAACCUUGGACUAGAGCAGCCUAGCCUUCAUACACUAACAAGGUACAUUACUGACUUCUCCUGUUAGCUCUGUCGUGCUUACAUCAUGAUGCCCAUUUUUCAGGUAAAGAAAUAGUGGCUCAAACAAGGUGAGUGGCCAAAGAUAACAUAGCUCAUAUGUAGCAAAGCAGGGACUUUGAUCUGGGUCUCAGCACUUUGUCCACCAUGGUGUCCACUGGUUGACUCAGGUGAUUCACCUGGGUAACAAGGCUUCCUGAAGGCCACCUGCUGGUAAAUGUCAUUGCCAGUUCAUUGACCGGGAGCCCCCAUGUGUUUCUACCAAGACCCCGCUCCUCUCUUCGCAUACAGUAAUCUGUUGUAUACACUUUGUACCUCACCCACAAGCGUGUGAAAAGCCUUAGCUGUUCUGGUGCCAGGACUAAUGGGAGCUGCUUACAGUCUAUGAGGACAAUCAGACUUGGCCGCCUGCCUUCUUUCCAUAUAAUUUUUAAUAAGCCAGUAAUAUCUCUCCAAGCACUACAGACCUCUGGCUUGGACCAGGAAACCUGGAACUGUUUAAGAGAACAUUAAUUUCCUUUGAGCUAGGAUUACAGGCCAUCUAAAACUUCUUAAUGAAUGGCCACACUGCCUUUUUGAAGCAUUUGUGUAUUUGCCAACACAGACUCGAAGGUUGCAUUAGAUAUUGGGAGUUGUCUUUUCUGGAAGUUAGGGUCUUCUAGAAGCUGACGGGCGAUGGAGGCCUGAUGCUCUGCCAUUUCUUUGGUGAGACCUCUGGACUGCUUCGUUCAUAGUCCUCUUUCCCACAUAUGCUCCCCUGAUGUCUUACUCUUUUAUUUUAUGGGUUUUUGGUAACUGAAACAUUUUAAGACUCAAUUCCGCCACUUUGUUGAAGAUAAAAUCAAGUUCAAACCCUGCUUUAUUUUAUUUUUCUUUUUUUUGGACGGAACUAGUGAGGAAACUGUGUGUGCAAACCCCAGAAAACCCACUUGAGACCUGAUGCUAAUUGGCUGGAUGAUGUUCAAUAGGACACGGCUCCACUGAGCCUCAAUUUCCUGAUGAGGGUUAAACUGAUGAUUCUUAACCAGGUCUGACAUUCUGUAAAUUAAGCAUACUUGCUUCUGAUUUCACAGUUUCCAUGGGAUCAGAGGAUUGAAAUGUCAAGGAACCUCCCUUGAUGUCCCCCUAAGACUCUGAAUUGAACUGUGAUGAGGACCCUUUUGAGAAUCUUUCAGUGAUCCCCUUCUCUAGGAAGGAAGGGUGAAGUAUGCUUUGUAAGAGAGAUUGUCUAUUUGUCUUUUAUCUCCUGAUUUCAAACACAGUGGUUCCGCUAAGCUGCAUCUUUUUUGUUCUUUCUGCUGUGAAAAUAAUUUUGUCGGAAAAUGUAACCAGUGCAAUUAUACUGAAAUUUCAUAUGAAAUGUUAAUAAAAUGGAUGUGUGACCAAUAAAAUACUUGAUGCCAAAUUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-789.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -831

Frequency: 0.0000

Diversity: 443.4

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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