Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

STX18-AS1:3

Sequence Length

2478 nt

GC Content

0.4685

GAAAAAGGUUCCGGCCUCAGCCGGCGCACCUGGCGGAGGAGGAACCUCGCGACGCGCUCUCGGGCAUCGGUUUCUCCCAGCAAAGCUUGGAGGGUUUAGCUGCGCGGAGAGCUCAGCGAGCUCUUCUGUGUCUGUUUGGGGCGUGUGGGCUCCGGGAGCGUGAGGACCGGGAAGCUAGGAGGCUCCUUCCCUUCUGGCGGCUCCCUCACUGAGACCGGGCGGUUUGGUUGCGGGGGAAGUGGAGACGAGCCACCCUUGACCUUUGACUGCAAGAACUCACCUUGAGCAGGAUAGAGGCACGUGGACGGUGACCCUCGGGAUGCAAUAAAUGCUGAGACAGAUCAGCAAACAUUGAGUGGGCCAGACACUGUUCUGAAAAAUACGCAGUCGACUUUUGAACAGCACAGGCUUGAACUGCAUGCGGCCACUAAUACUCGGACUUCCUUCUGCCUCUGCCAUCCCUAAGACAGCAAGACCCACCCCUCCUGCUCCUCAGCCUACUCGAUGUGAUGAUGAUGCAGAGAUUCAGAGAGUCUAAGCAACUUUUCUAAAUCAUCUAGCUGGAAUUCAGUAACUGAGCCAGGAUCUACCCCAGGUCUGUCUGACUCCAAAGCCUGUGUCUUCCAGCACACACUGCUGCUGCCUGGGGAAUGUGGAUAUGAUGUCUGGAGCUCUAGCAACCAUAUCAGACCACAAGGAUGAAUGUACACCCCAGGAAUGGAAGAGAGGAAAGCCAGAAAAAGACUCGGUCCCUGAUGGCUGAAGAGCUACCAUACCUGCCCCUAGAUCUUCUAUUUCUGAUCAUCUUCUAUGCAAGGCCUGGAAUGUAAUCAUGGAUAGCCAUGGAUGAUCAGCUUUCAUCAUGUGGGCAUGGAACAAGAUGGAAGGAAGCUGGGGCCCUGAGUGACCUGUGGAGCAGAGGCCUUUGCCCACCCUGGGCUGCCUGAUUUCCCCUGGACUAUCAUGAGACAGAAGAAAAAGCUUCUAUCUUAUUUGAACCACUGUGUUUUGGGAACCUUGGACUAGAGCAGCCUAGCCUUCAUACACUAACAAGGUACAUUACUGACUUCUCCUGUUAGCUCUGUCGUGCUUACAUCAUGAUGCCCAUUUUUCAGGUAAAGAAAUAGUGGCUCAAACAAGGUGAGUGGCCAAAGAUAACAUAGCUCAUAUGUAGCAAAGCAGGGACUUUGAUCUGGGUCUCAGCACUUUGUCCACCAUGGUGUCCACUGGUUGACUCAGGUGAUUCACCUGGGUAACAAGGCUUCCUGAAGGCCACCUGCUGGUAAAUGUCAUUGCCAGUUCAUUGACCGGGAGCCCCCAUGUGUUUCUACCAAGACCCCGCUCCUCUCUUCGCAUACAGUAAUCUGUUGUAUACACUUUGUACCUCACCCACAAGCGUGUGAAAAGCCUUAGCUGUUCUGGUGCCAGGACUAAUGGGAGCUGCUUACAGUCUAUGAGGACAAUCAGACUUGGCCGCCUGCCUUCUUUCCAUAUAAUUUUUAAUAAGCCAGUAAUAUCUCUCCAAGCACUACAGACCUCUGGCUUGGACCAGGAAACCUGGAACUGUUUAAGAGAACAUUAAUUUCCUUUGAGCUAGGAUUACAGGCCAUCUAAAACUUCUUAAUGAAUGGCCACACUGCCUUUUUGAAGCAUUUGUGUAUUUGCCAACACAGACUCGAAGGUUGCAUUAGAUAUUGGGAGUUGUCUUUUCUGGAAGUUAGGGUCUUCUAGAAGCUGACGGGCGAUGGAGGCCUGAUGCUCUGCCAUUUCUUUGGUGAGACCUCUGGACUGCUUCGUUCAUAGUCCUCUUUCCCACAUAUGCUCCCCUGAUGUCUUACUCUUUUAUUUUAUGGGUUUUUGGUAACUGAAACAUUUUAAGACUCAAUUCCGCCACUUUGUUGAAGAUAAAAUCAAGUUCAAACCCUGCUUUAUUUUAUUUUUCUUUUUUUUGGACGGAACUAGUGAGGAAACUGUGUGUGCAAACCCCAGAAAACCCACUUGAGACCUGAUGCUAAUUGGCUGGAUGAUGUUCAAUAGGACACGGCUCCACUGAGCCUCAAUUUCCUGAUGAGGGUUAAACUGAUGAUUCUUAACCAGGUCUGACAUUCUGUAAAUUAAGCAUACUUGCUUCUGAUUUCACAGUUUCCAUGGGAUCAGAGGAUUGAAAUGUCAAGGAACCUCCCUUGAUGUCCCCCUAAGACUCUGAAUUGAACUGUGAUGAGGACCCUUUUGAGAAUCUUUCAGUGAUCCCCUUCUCUAGGAAGGAAGGGUGAAGUAUGCUUUGUAAGAGAGAUUGUCUAUUUGUCUUUUAUCUCCUGAUUUCAAACACAGUGGUUCCGCUAAGCUGCAUCUUUUUUGUUCUUUCUGCUGUGAAAAUAAUUUUGUCGGAAAAUGUAACCAGUGCAAUUAUACUGAAAUUUCAUAUGAAAUGUUAAUAAAAUGGAUGUGUGACCAAUAAAAUACUUGAUGCCAAAUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-789.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -830.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 442.64

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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