Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

TEX26-AS1:1

Sequence Length

1131 nt

GC Content

0.4439

GACAAGAAGGGGAUGAAAUGGGGAGACAGUGGGAAAACAGGGUGGUUAGAAAGGGAAGAGAAGCAUCCAAAGGGGUGCUGUCGGGAUGCUAGGAGGGGAUCCUCCCUCCUCUGUCUCUCCUGUUUGCCUUCCCAUCAUAUAGAAACUGAGUGUAUUAGAUAUUUUCUGCACUAAUUAAGUAUUUUCAUUUUCCAUUCUUAAUUUACAACGGAAUGAAUUGGAAUGAAAAUAUGCAUUUCAUUCACUCUUUUGGGAGCACAAUUCUAGGGAAUUUGUACUUGAACAAUCCUUCACUGCUCCAUAGCCACUGUGGAAUCACAGUUACCCAACUAUACAGCAGCAAUGGCCAAUUAUUGCCACAAGAGACUAUGAUGGAGCUGACUACACGGUAAUCAUGCCACUAGCGUCACAGCUAGAGUGGUUCUCCCUCCACAGACCCAAAAGGCUGAACUGGUGAACCUGCUGCAUCUGUGGGCAGAAUUAGGAUGAAAAGCACUACCUCUGUGAAAUACAAAAUCUCUGUGGAAGAAAAAUCAAUUCAGUUCUUGCAGUGAGCUUUCCGGACCACUGUCUUGUAUGUUUCCUAAGAAAAGCAAAAAGGGAAGAGAUUGAAGAGAAAGUAGAUUUUCAACUACAAACUUUCAUCCAUUUGCUUUCAGCUUAAGCAAAUGUGCGCAAAGUUGUCAUGGAUUUUUGCAGUCAAUAAAAACCAAGCAAGAAGACUGAAUCCCAAGUCAUCUGGUAUAAAUGGAAGCAGUUUCUGUGAUAGUUCCACGCGGUCAGAAGGGUCAUCCUGGCUUAGGAGAGGGGCAGAAGAGGAAAUGCACGCGUGGAAACAGGAGUGGGCAGGGAGGAUGUGACACUGUCCUCCUCACCAGGCCACGUUCCUGGCACCAACCAUAGUGUUUGGGCAGAUAAGAAAAGAAACAAUUUGCUGAAACUCCCUCUGCUUAUAACAAAACUGACUGAAAUCAGCCGGAAUCAAUAUGGCCAAAUGCAGUUUGCGCACAGCAAGCUUGCUGAUGUCACAGCCUGAAUUUCUACUGCAUGUUUCAUACCAACUCCCUCCAAAUUUGCACAUGGGACCCACCAGGAAGCAUGAAGAGAGAGCCAUGCAUGCCUGAAGACUUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-335.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -352.42

Frequency: 0.0000

Diversity: 206.5

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.........((((((((((.(.((((((((((....((((((((((......((((((...(((((((....)))))))..(((((.((.((((((((....))))))))..))...))))).....))))))...............(((((...(((.....))))))))......(((((((((((((.((((((...........))))))....)))))))))))))((.((((((((.((((....)))).........(((((..((((......)))))))))..((((.((((((..((((((....))))))..............((((((.((((........))))........((((((...((((......)))).))))))...(((((......)))))...(((((.((.....(((.((.....)))))....)).)))))))))))..)))))))))).....)))))))).)))))))).))))........(((.(((..((.(((((............))))).))..))).))).....)))))))))).)..)))))......((((((((...(((.(((((((((((.........)))))))........)))).))).))))))))((((((..(((....)))...))))))(((.(..(((((((.((........))...)))))))..)))))))))(((((.((.(((((..((((...(((...((((((((........(((((((..((((((...))))))((.(((((((((..........))).....(((...(((((((((((.(((((((.(.(((...))))))))).))..))).))))))))...)))........((((.(((((((.............))))))).)))).)))))).))..........)))))))......((((.........)))).....(((((((((.....)))))).)))...)))))))).)))..(((((.((.((((((((........((((...............))))........)))))))).))))))).))))..))))).)).))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.........((((((((((,(.((((((((((....((((((((((......((((((.,,(((((((....)))))))..{((((.((.((((((({....})))))))..)).,,)))}}.....)))))).,,............(((((,..(((.....))))))))......((((((((((,{({(((((,...,,......,}}}})}}.,)))))))))))))((.((((((((..,,{{{{{(((({{.......{((((..((((......))))))))}..,|||}||,,,,..((((((....))))))..{{{,......,,(((({{.({((,,......|||,........,,(({{{{,(,,(,,{{{.,|||,,,,,))}}.(((((......))))).}}|||||.||,,,,,{|{.{{.....)))}}...,)),}),}))))))}..,,})))))))},...)))))))).)))))))).)))).........,..(((..((.(((({............})))).))..))).))),....)))))))))).).,)))))......((((((((...(((.((({(((.((.((({,....}))))..)).))}.,)))}.))).))))))))((((((..(((....)))...))))))(((.(..(((((((.{{........}}...)))))))..)))))))))(((((.((.(((((..((((...(((...((((((((.,,,,,,,((({(({..,{{((.,,{||,|||{{.{{{{||{||,..,......))}.}},||||,..((((((((({(.(((((((.(.(((...))))))))).)).,})),),})))))...}},.,,...,,((((.(((((((.............))))))).)))).)}}))),))..........|||}}}}....,,|{||,........)))).....(((((((((.....))))))},))...)))))))).)))..(((((.((.((((((((........((((...............))))........)))))))).))))))).))))..))))).)).))))).