Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

TEX26-AS1:10

Sequence Length

683 nt

GC Content

0.4495

UUUGUACAGUUCUUGCAGUGAGCUUUCCGGACCACUGUCUUGUAUGUUUCCUAAGAAAAGCAAAAAGGGAAGAGAUUGAAGAGAAAGUAGAUUUUCAACUACAAACUUUCAUCCAUUUGCUUUCAGCUUAAGCAAAUGUGCGCAAAGUUGUCAUGGAUUUUUGCAGUCAAUAAAAACCAAGCAAGAAGACUGAAUCCCAAGUCAUCUGGUAUAAAUGGAAGCAGUUUCUGUGAUAGUUCCACGCGGUCAGAAGGGUCAUCCUGGCUUAGGAGAGGGGCAGAAGAGGAAAUGCACGCGUGGAAACAGGAGUGGGCAGGGAGGAUGUGACACUGUCCUCCUCACCAGGCCACGUUCCUGGCACCAACCAUAGUGUUUGGGCAGAUAAGAAAAGAAACAAUUUGCUGAAACUCCCUCUGCUUAUAACAAAACUGACUGAAAUCAGCCGGAAUCAAUAUGGCCAAAUGCAGUUUGCGCACAGCAAGCUUGCUGAUGUCACAGCCUGAAUUUCUACUGCAUGUUUCAUACCAACUCCCUCCAAAUUUGCACAUGGGACCCACCAGGAAGCAUGAAGAGAGAGCCAUGCAUGCCUGAAGACUUCCCAGAUGUUCCCUUUGCUUCCACCAAUCACCUGCUAACCCCAGGAUCCAACCCUAAACCUUUUGUAAUAAAAUUACUGCCCUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-182.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -194.47

Frequency: 0.0000

Diversity: 198.29

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..............(((((((....(((((((.(((....((((((((((.((((.((((((((...(((.(((((((((((.........)))))))........)))).))).))))))))...)))).).)))))))))...))).))).))))(((((((.((........))...)))))))((((........)))).(((((......(((((((((...)))).....))))).....)))))(((((.(((((((.((((.((.((((((((.(.((((..(((.((((((...(((((((((((.(((((((.(.(((...))))))))).))..))).))))))))(((....(((((..((((.(((((((.............))))))).))))....................(((.(((....))).)))......))))).....)))(((((((.....))))))).((((......)))).....(((((.((.((((((((........((((...............))))........)))))))).))))))).)))))).)))(((.........)))...)))))))))))))..........)).))))..)))))))...)))))..................)))))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,,,,.,,.,....(((((({,({.,{{{((,.|||}}||{|{{{|{{{,,{|||,|{{||||{.,{(({,{,({{((,(({(,,,{{,,.,,,,,..))})...})))),))|{|||||||....,,,)))}))))),||{...|||{||{{{{||,,,((((..{{.......{{{,.,,.|((.((((........)))).)))})}.....}}}|,)))}..))))}))})}}},.,))){{{....(((((.(((((((.((((.((.((((((({{(.((({..(((.((((((...((((((((({(.(((((((.(.(((...))))))))).)).,})),)}})))))(({....{{{{,,,((((,(((((({..,..........}}))})).}}}}.,..}}}}}},,...,....{((.{{{....))).)))......}}))),....}||(((((((.....))))))).||{{......)))).....(((((.((.((((((((........((((...............))))........)))))))).))))))).)))))).)))(((.........)))...)))))))))))}),.........)).))))..)))))))...)))))..}}}....,,,.....,}}))}}),,,...