Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
TEX26-AS1:18
Sequence Length
712 nt
GC Content
0.4747
CAGUGAGCCCCUUUUGCUGGAUAACCUUACCUGGUAAUUUGACAUACUAGGUGGUUAGUAACUACUGACUGUCUCCAGGUUACAACACAGUUAUUACCCACUUGGGUGAAAAGAGAAGACAGGAAAUACAUUUUGGAGUUGGCUGGCAACCUGUUUACAAAGCAAUUUACAACAGUUCCUUAUUCUUAAGGGGCUAUUCUAAUACAAGACCUCAGAGAAACAGUGCAGUGUGACAAAGGAGGAAUUUAUCAAAGGAGACAGAAAAAGCAUCAAGGCAAGCUGUGAAAUGGUGCGGUAGGAACCAAAUAGAGAGCCAAAGGAUCUUUCUGUCACUGCAGGCCCUUAGGGUCAUCAGCAGAGACAGCUCCAAGCAAUUCUUUCUGGCUGAUUGUCCUUCCAGUGCCUGACAUGAAAAUCACAGCCUUGGCGAGAAAACAGCCGCUGCAGGGAGUGGUGCCCACAGUACUCUAGGCAUCCCUCACCUGCGUCCACUUCCCACCAUCCCUCGGAGGGGCCAGCACACAAGACAGUGACCGGGGCAUGUGUCAAGAGCAUGCGAGAGAAUAUCUACCCUGAGGCAGGAAAACACGGCUUCCGCUCGGCUGUCUCCCAGCUUGGUUUCUUAGAAAUCUAUGUCAUUAUCUUUCUGCUGGGAUUGUCAGACCUGAUUUUGAGAGCAUUUAAAACCUGACCCCUGAUGGAGCCUCUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-207.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -222.77
Frequency: 0.0000
Diversity: 179.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.....)))))))..(((((..((((((((........)))))))))))))((.((.((((((((((((.(((((............((((((....))))))..........(((((......)))))..((((.....)))).(((((...))))).........(((((((((....)))))))))............)))))..))))..)))).)))))).))...(((((..(((((((..((.(((((((..((.(((..(((...((((....((((.(.....).)))).))))...)))....))))))))))))..(((((((.((.((((.((((((((((((..(((...))).....))))).))))).)).))))..)).))))).))........((((((..((((.((....(((((.(((((((((.((((((...((....)).)))))).))).))))))......((((.((.......)).))))((.((((........))).).)).((((((.......)))))).(((.....)))..((((...))))......))))))))))).)))))).(((((((..((((((...)))))).................)))))))..(((((....(.((((((......)))))))))))))).))))))).)))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.....}))))))..(((((..((((((((........)))))))))))))((.{(.((((((((((((.(((((.........|,.((((((....)))))).....,.,{{((((,....,.,||}|..{{{{..,,.}},)}}|||}....,,,....,.....(((((((((....)))))))))..,.,.......)))))..)))}.,)))).)))))}.})...(((((..(((((((..((.(((((,...{({,{{..(({,,,(((({...{(((,{,,..,|.})),.|||{{{{|||...}),,))))))))|..(((((((.((.((((.((((((((((((..(((...)))...,.))))),}))))},).)))}..}).))))).)},}.....,|{{{{{..((({.{{....,|||{.{((((((((.((((((...{{....}).)))))).))).)))))}.,,.,,,{{|.||.,,,,..}},)))}((.((((,.......))).}.|)}((((((.......)))))).(((.....))).,((((...))))......))))))))))).}})))).|{{((({..((((((...|}}}})...,.,....,,,,...))))))}..{((((....|.||||||,,....}}},,,,)))}),},))))))).)))))....
Back