Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
TEX26-AS1:23
Sequence Length
768 nt
GC Content
0.4453
GCAAUUUACAACAGUUCCUUAUUCUUAAGGGGCUAUUCUAAUACAAGACCUCAGAGAAACAGUGCAGUGUGACAAAGGAGGAAUUUAUCAAAGGAGACAGAAAAAGCAUCAAGGCAAGCUGUGAAAUGGUGCGGUAGGAACCAAAUAGAGAGCCAAAGGAUCUUUCUGUCACUGCAGGCCCUUAGGGGAGGACACAGCAAGAAGCCUCUCCCAGAUGCUGGCACCUUGAUCUUGGACUUCUCAGCCUCUGGAACUGUGAGGCAAAUACAUUUCUGUUCUUUAUAAGUUACCCAGUUGGUGGUAUUCUGUUAUCACAGCAUAAACAGACUAAGACACAAAGUUGGUGGCACUUUGUGAUGGCUGCCCAAGCUGUCUAAGCCCCUUCCUCAUGCUCAGAUACACAGCCUUUGCUUAAGGCUGUGGAAGAUGGCUUGCAGCUCCCUGAGGGUGCAGCUGGCUUUCCCUUGAUGCUGUGGACAAGCUGUUCCUGCCACACAGCUUCCUACUGUCUUCACAGCCCCUCACUCAUCUUUUAAGACCCAGUUUCAACAUCACCUACUCAAGGCUAAUUUUGGUGUCCUUCCUCCUUGUCCCAUAGGACAAAUGAUACAUAUUGUGUGUCCCCUUACCACAUCCUGUACUAUAAGUGUUGUGUUAUUGAUUUACUUGUCUGUCUCACCCUCUAAGCCCAAGAGAAAAGAAAACAGCAUCUUAUGCCUUUUUAUUCCUGGUACAAUGUGGUUUCACAGAAGAUAUCAUAUUUAUUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-221.19 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -235.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 183.91
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
............(((((((((....)))))))))....((((((((.((...........(((((((((((...(((((((((..(((((((((((((((...........(((.((((((((.........(((((((((...((((((((((...))..))))))))..((((..(((((((((((((((.((((.((...(((((.((((((.(((((..((........)).....))))).)))))....).))))).......)).)))))))))............((((.(((((......))))))))).....(((.(((...((((((((.(....))))))))).))))))....((((((..(((((.(((((..............((((((((.....)))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))..(((((((((........).))).)))))))))))))).))))))))))).))))))))..((((............................................))))...)))))))...)))))))))((((....))))....(((((((...))))))).......))))..)))))))....)).)))))))).((((.......(((((...((((.....(((..((.(((.(((((...((((...)))).))))).)))))))).....).)))...)))))....))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.........,,.(((((((((....)))))))))..,.({{{{{{{.{{......,....(((((((((((...,(((((((,..,,,,,{(((({(({(,,..(((.,..(((.,,(((((({...{{.{(((((((({,|,.,,,(((((((,..||,.,,})))}}..((((..{((((((((((((((,({{{.,,...(((((.{(((((.(((((..((........)).....})))).)))))....}.))))).......,,.})))))))}......,..,..{{,,|{||{{..,,,,|}}}})}}}.....|||,{{{...((((((({,(....))))))))).}|||||...,((((((,,{((((.(((({.............{((((((((.....)))))))))))))..))))))))))))))))))))))))).))))))}},,}}}..||{{{({,..{({,,,..,,,,..)))))))))))}))))))))}}}}}.,,,......,{,....}||...,}}..........,,,.....,))}}..,)))))),},,))))))))|((((....))))}...(((((((...))))))).......))))..)))))))....}),)))))}}).|{{{...,,..(((((...((({.....{,(,.{(.(((.(((((...((((...)))).))))).)))))))}.....}.)))...))))),}}.}))}..........
Back