Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
TEX26-AS1:26
Sequence Length
2055 nt
GC Content
0.4579
AGGGAGUUCUGCCCCUGCCAAGGGGUGCUGGCCACGCAGGAGGCUUAACCUGGCCGGCGCGGGAAUGGGGUGCAGAGAGCAAAGAAAUGUGGCUUUGAUCUUAUGGAUGCCUUACUUUUACAUUAUUUGUACAGUUCUUGCAGUGAGCUUUCCGGACCACUGUCUUGUAUGUUUCCUAAGAAAAGCAAAAAGGGAAGAGAUUGAAGAGAAAGUAGAUUUUCAACUACAAACUUUCAUCCAUUUGCUUUCAGCUUAAGCAAAUGUGCGCAAAGUUGUCAUGGAUUUUUGCAGUCAAUAAAAACCAAGCAAGAAGACUGAAUCCCAAGUCAUCUGGUAUAAAUGGAAGCAGUUUCUGUGAUAGUUCCACGCGGUCAGAAGGGUCAUCCUGGCUUAGGAGAGGGGCAGAAGAGGAAAUGCACGCGUGGAAACAGGAGUGGGCAGGGAGGAUGUGACACUGUCCUCCUCACCAGGCCACGUUCCUGGCACCAACCAUAGUGUUUGUGAGGGUCAAUUUAAUUGUUCUUGUGCUCUCAUAGAGGAAGCUGUGUCUUUCAUCCCCUUGUAAGAGUUUUCACUGAUGAAGGGGGUCUUUUAUCUUCAUAUCUUGGGAACUACUGAAACUGUUUCAAAGAGUCAAAGACACCAAUAACUAACAGAAAUUCUUGUUUUCAGGGGCAGAUAAGAAAAGAAACAAUUUGCUGAAACUCCCUCUGCUUAUAACAAAACUGACUGAAAUCAGCCGGAAUCAAUAUGGCCAAAUGCAGUUUGCGCACAGCAAGCUUGCUGAUGUCACAGCCUGAAUUUCUACUGCAUGUUUCAUACCAACUCCCUCCAAAUUUGCACAUGGGACCCACCAGGAAGCAUGAAGAGAGAGCCAUGCAUGCCUGAAGACUUCCCAGAUGUUCCCUUUGCUUCCACCAAUCACCUGCUAACCCCAGGAUCCAACCCUAAACCUUUUGUAAUAAAAUUACUGCCCUAAAGCCAGUACAAGACAGAUUUGAACUGGACUUUUGUUUCCUCAGAAGUUAACUUGCAAUGUGAAGCUUUCCUUUUCUCAAAAACUUGGUGUCAUAGUGUUGGCUUCUAGUGCAGUGAGCCCCUUUUGCUGGAUAACCUUACCUGGUAAUUUGACAUACUAGGUGGUUAGUAACUACUGACUGUCUCCAGGUUACAACACAGUUAUUACCCACUUGGGUGAAAAGAGAAGACAGGAAAUACAUUUUGGAGUUGGCUGGCAACCUGUUUACAAAGCAAUUUACAACAGUUCCUUAUUCUUAAGGGGCUAUUCUAAUACAAGACCUCAGAGAAACAGUGCAGUGUGACAAAGGAGGAAUUUAUCAAAGGAGACAGAAAAAGCAUCAAGGCAAGCUGUGAAAUGGUGCGGUAGGAACCAAAUAGAGAGCCAAAGGAUCUUUCUGUCACUGCAGGCCCUUAGGGAGACGGGGUCUCACUGUAUCAGCUCAGCUGGAGUACAGUGGUGAGAUCAGAGCUCACCGCAGCCUCCGGGCUCCUGGUCUCAAGCAAUCCGGACCUCAGCCUCCCAAGUAGUGGGGACUACAGAGAAUGUACAACUCCUCUGCCACAACGUGAGGGAGAGAAGUCUGCAGACGGCUGACUGGUGACGACUGAACAAGACGGAAAGGCAAGUCGCUAUGCCCGAAGCCUUUGAAGGGAGCCAGCAGGGUCCAUGGGAGGUUCAGGACACAUAUCUGCAGCCCUGCUUCUGGCCCCACCCUUGGGGAAGCCUUUUGCAGGUGAUCCUGGGCCUCUGCUGGGGAAGGCCCCAAGAGGUGAAGCAUCCUCUGCAGAGGAGAGAGCACAUCCGGAAGUAGAAGACAGACCACUGUCUGGGCUCCGUUUAACUGCUGUGAUUUGGGAUUGUAACUUACUCCCGUAAAGCCUCAGUUUCCCACAUGGAAAAUCAAAUCGAUCAUUGUUAUAACAUUUCACUUUUUUGUUAUGUGAUGUAAUUUACACAGUGCUUUCGUAUACGUUAUCCAAUUUAGCGAAAUAAUACAGAGCAAUGCAUUUUGAAAAGAAUAAAAUGCUUAACAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-631.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -670.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 698.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((((((((....))))).((((((((....((........))))))))))((((((..((.((.((((((.(((((........))))).)))).)).)).)).......((((.....)))).(((((.......))))).(((((((.(((....((((((((((.((((.((((((((...(((.(((((((((((.........)))))))........)))).))).))))))))...)))).).)))))))))...))).))).))))......(((((...................)))))(((((((((((((..((((((((((((.((...((((.((.((((((((((((((((((((((((....((((((((.(((((((((..........)))...(.(((((((((((((..((((((.(((((.(((((.((..(((((.(((((.......)))))(((........)))..((((((((((((...........))).)))))))))))))).)).)))))...))))))))))).((((((((((...(((((((..........)))))))....)))))))).))....(((((.......(((...)))..........)))))..))))))))))))).)(((((((.............)))))))......)))))).))..........(((.(((....))).)))..........((.....))(((((((.....))))))).((((......)))).....((((((((((((.(((((((....(((.(((......(((...(((......)))....)))....))).)))....((.(((((((.(.(((......((((.(((((((((((.....((((((((.......(((.......))).........(((((...)))))......(((((((((.((((.....)))).))))).))))((((((((.((.(((((((((..((((((....((((((((((((....(((.((.((((......)))).)).))).(((((((.....)))))))..(((((..((((((((........)))))))))))))(((((..(((........))))))))..........((((((....))))))...))))))..))))))))))))...))))))))).......(((((...))))).........(((((((((....)))))))))..(((......))).)).)).))))))..)))).))))....))))).......)))))).))))....)))).)).))))).)))))))))..)))))))))))).........))))))...))))))))))..))))).....(((.(((((.((((((((((((((((((((...))))..)))))))).((((((((((((((............))))).)))))))))........))))))).).))))))))..)).))))))))).))))......(((.((((.((.((...)).)).)))).)))((((((((((((..((..(..((.((.....)).))..).))..))))).((((.((..(((((((.(..(((.((....)).))).).)))))))..))...)))))))))))..(((((((((((((((....)))))....((((((((((.(((.((..((((((..(((((....)))))))))))..)).))).))))))))))...........)))))))))).((((((....))))))..))))))))))..))))))))))))))))).........))))))..........(((((.....))))).......(((.((((((.((((((...........))))))((((......))))))))))...)))....(((((.......)))))........))))))...((((((((.......)))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,,,(((((({((((....))))||((((((({...{({........)}))))))))||(((,.(({{(({((((((,{{,{{.....{{{||||,.|||,.||{}|.||,,{{{..,,((,,,,,|}||{(({{{{{{{..{{{{{{,{{{(({{,{((|{{{((({({((({{(,,{.,{(((({{.,{(((,((({((({((,({,,{,,,.,}}}}..}},}}|.|}}}}.}}|,|||||||,...|,,)})})))))}}||.||}}}||||,||||,,|||||.,{|.......,,...}|}|||.{{||,,,,,,,,||||,|}}|||.,,,{{(({,(({{{((((,{{.{{{((((((((({{((,,{{{{((.,.,(({(((,{.{{,|||{|||..|}.....}}|.|}|}|||||.(((((((((((.(((((((,(.(((...}})}}))}}.}|.||}}.}.,}))))|(((........)))}{((((((((((((...........})).))))))))))}|}},}},}}}})}},)||{{{{{|,|...(((...,|}}.,||}}}}}}}}.,,,.,}}}},,,,{{{|||{{||,..,{,,.,{|||}}..,,,{{{...)))..........,}}}}..,}}}}}|||||||{|((((((,..,..........,})),)).....,}}})))}))..........{((.{((...,)}|,||}........||||.....{{(((((((.....))))))},))}}.,}}},||||.{{..((((({(({(((((((({{,....{((,({{......{{{...{||,,....}}}.,,,)))}}..))),))}.,,.||.{{|||||,|,|{|,,,,,.|{||,||||||||(((.,,..{{{(((((......,|||.......}}}.........(((({...})))).,,...,{{((((((.(({|.....,})).))))).}}||((((((((,,(,(((((((((.,((((((....((((((((((((...{((({((.({({,,{{{,||||,{{,,|,.{{|{|||,,....,}}}}),,|{(((..((((((((........)))))))))}|||{|,|,.}))}}}}}.,.})))))),,.......,..((((((....))))))...))))))..}))))))}))),,,,))))))))){{...,,(((({...})))}.........(((((((((....)))))))))..{{{......}}}.||,.},})}}}}..)))).))))....))})),......)}}))),))))....)))).))},}))),))))))))))})))}))))))}},},...,,}))))))...},}))))))).,)))})}..},|,,.(((((.((((((((((((((((((((...)))),.}))))))),((((((((((((((............))))),}))))))))........})))))).}.))))),,|,,||||}}}}}}}|,|},.,,,...{{{.((((.((.{,...,}.)).)))).}}}{|{{{{{,{{|{|,{{{{{,,({.((.....,,.}}....}|,.}))))}},{{,((,.((({{((,(,.(((,((....)),))).|,})))))),,)).}.,...)))))}},,(((((((((((((((....)))))...{((((((((((.(((.((..((((((..(((((....)))))))))))..)).))).)))))))))).,...,,....)))))))))).((((((....)))))).,)))))}))))},})}}}}},}))}))}}}|}...,}}})})))}...}}.,),}}||||}...,|||,,,,.....,||,{{{{{{,{{{(((...,,,.....}}},}})||},},....}},}}})}}|||}}|,,,.{{{{{.......)))))......,,))))))...((((((((.......)))))))).......
Back