Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
TEX26-AS1:28
Sequence Length
2183 nt
GC Content
0.4311
AGGGAGUUCUGCCCCUGCCAAGGGGUGCUGGCCACGCAGGAGGCUUAACCUGGCCGGCGCGGGAAUGGGGUGCAGAGAGCAAAGAAAUGUGGCUUUGAUCUUAUGGAUGCCUUACUUUUACAUUAUUUGUACAGUUCUUGCAGUGAGCUUUCCGGACCACUGUCUUGUAUGUUUCCUAAGAAAAGCAAAAAGGGAAGAGAUUGAAGAGAAAGUAGAUUUUCAACUACAAACUUUCAUCCAUUUGCUUUCAGCUUAAGCAAAUGUGCGCAAAGUUGUCAUGGAUUUUUGCAGUCAAUAAAAACCAAGCAAGAAGACUGAAUCCCAAGUCAUCUGGUAUAAAUGGAAGCAGUUUCUGUGAUAGUUCCACGCGGUCAGAAGGGUCAUCCUGGCUUAGGAGAGGGGCAGAAGAGGAAAUGCACGCGUGGAAACAGGAGUGGGCAGGGAGGAUGUGACACUGUCCUCCUCACCAGGCCACGUUCCUGGCACCAACCAUAGUGUUUGGGCAGAUAAGAAAAGAAACAAUUUGCUGAAACUCCCUCUGCUUAUAACAAAACUGACUGAAAUCAGCCGGAAUCAAUAUGGCCAAAUGCAGUUUGCGCACAGCAAGCUUGCUGAUGUCACAGCCUGAAUUUCUACUGCAUGUUUCAUACCAACUCCCUCCAAAUUUGCACAUGGGACCCACCAGGAAGCAUGAAGAGAGAGCCAUGCAUGCCUGAAGACUUCCCAGAUGUUCCCUUUGCUUCCACCAAUCACCUGCUAACCCCAGGAUCCAACCCUAAACCUUUUGUAAUAAAAUUACUGCCCUAAAGCCAGUACAAGACAGAUUUGAACUGGACUUUUGUUUCCUCAGAAGUUAACUUGCAAUGUGAAGCUUUCCUUUUCUCAAAAACUUGGUGUCAUAGUGUUGGCUUCUAGUGCAGUGAGCCCCUUUUGCUGGAUAACCUUACCUGGUAAUUUGACAUACUAGGUGGUUAGUAACUACUGACUGUCUCCAGGUUACAACACAGUUAUUACCCACUUGGGUGAAAAGAGAAGACAGGAAAUACAUUUUGGAGUUGGCUGGCAACCUGUUUACAAAGCAAUUUACAACAGUUCCUUAUUCUUAAGGGGCUAUUCUAAUACAAGACCUCAGAGAAACAGUGCAGUGUGACAAAGGAGGAAUUUAUCAAAGGAGACAGAAAAAGCAUCAAGGCAAGCUGUGAAAUGGUGCGGUAGGAACCAAAUAGAGAGCCAAAGGAUCUUUCUGUCACUGCAGGCCCUUAGGGGAGGACACAGCAAGAAGCCUCUCCCAGAUGCUGGCACCUUGAUCUUGGACUUCUCAGCCUCUGGAACUGUGAGGCAAAUACAUUUCUGUUCUUUAUAAGUUACCCAGUUGGUGGUAUUCUGUUAUCACAGCAUAAACAGACUAAGACACAAAGUUGGUGGCACUUUGUGAUGGCUGCCCAAGCUGUCUAAGCCCCUUCCUCAUGCUCAGAUACACAGCCUUUGCUUAAGGCUGUGGAAGAUGGCUUGCAGCUCCCUGAGGGUGCAGCUGGCUUUCCCUUGAUGCUGUGGACAAGCUGUUCCUGCCACACAGCUUCCUACUGUCUUCACAGCCCCUCACUCAUCUUUUAAGACCCAGUUUCAACAUCACCUACUCAAGGCUAAUUUUGGUGUCCUUCCUCCUUGUCCCAUAGGACAAAUGAUACAUAUUGUGUGUCCCCUUACCACAUCCUGUACUAUAAGUGUUGUGUUAUUGAUUUACUUGUCUGUCUCACCCUCUAAGCCCAAGAGAAAAGAAAACAGCAUCUUAUGCCUUUUUAUUCCUGGUACAAUGUGGUUUCACAGAAGAUAUCAUAUUUAUUUUUAUUGAAUGAAUGAAUAAAUGAAUGGAAAGCAGCAUUGAGUCAUGGUUAUAUAUAAAGUUCUGAGAACAGUGCCUGGCAUAAAUAAGCACUAUUGAGUGUUUGUUAAAUAAAUGAACAAAAUAUAUCUGAACAUGUCUCAGAUCAUUUCUUCUGCAAUUGUAACUGUAAAAAGUCUUGUGAAAGCUAAAGUAGGAACAUAUGGGAAAAUAAAAGCCCAGAUUUGCAGAGAUCCACUCAUGCAAAUACGUUCAAAUUCGAAGUUAUUGCAUUGAUUCCUGACAACUUUAGUCAUGGCUAAACUAGAAUGGAAAAUUUUACUUCCUUCCCUCUGCUUAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-625.59 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -667.11
Frequency: 0.0000
Diversity: 757.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((.((((((....))))))((((((((....((........))))))))))((((((((((.((.((((((.(((((........))))).)))).)).)).)).......((((.....))))..))))))))...)))))))).((((....)))).................(((((...(((((((.((.(((.(((...((((........))))...))))))..(((((((((.......))))))))).(((((((((((((((((((((((((((((...............(((.((((........)))).)))(((((..((((...(((...((((((((........(((((((..((((((...))))))((.(((((((((..........))).....(((...(((((((((((.(((((((.(.(((...))))))))).))..))).))))))))...)))........((((.(((((((.............))))))).)))).)))))).))..........)))))))......((((.........)))).....(((((((((.....)))))).)))...)))))))).)))..(((((.((.((((((((........((((...............))))........)))))))).))))))).))))..))))).......((((((.(((((((((((((((.(((........((((((((..((((((((..............((((.....(((((((.(((((((((((((....(((.......)))((((((((......)))))))).........(((((.(((....((((....))))...))).))))))))))))))).))).))))))).......)))))))))..))).((((((((........))))))))))))))))......((((.......((((((((..(((...((((((....))))))...(((((((((((((((.((.......((((.....)))).(((((...))))).........(((((((((....)))))))))....((((((((.((...........(((((((((((...(((((((((..(((((((((((((((...........(((.((((((((.........(((((((((...((((((((((...))..))))))))..((((..(((((((((((((((.((((.((...(((((.((((((.(((((..((........)).....))))).)))))....).))))).......)).)))))))))............((((.(((((......))))))))).....(((.(((...((((((((.(....))))))))).))))))....((((((..(((((.(((((..............((((((((.....)))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))..(((((((((........).))).)))))))))))))).))))))))))).))))))))..((((............................................))))...)))))))...)))))))))((((....))))....(((((((...))))))).......))))..)))))))....)).)))))))).)))))).))))))).))))...((((.......))))..((((........))))((((((((((((((.((((((..((((....))))...).)))))(((((((((.........)))))))))...))))))))))..))))((((.((((.(((.(((((..((((........((((...)))).((((((((((....))))))))))........))))....))))).))).)))).))))...........)))...))))))))......))))..))).)))).))))..))))))).))))))............)).))))))))))))).((((((((..((.(((......)))))..))))).)))....)))))))))).))....)).....((((((.....))))))..))))))))).)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((((,,,.((((((....))))))((((((({...{({........)})))))))){(((((((,{{(({((({,(,(,,,{...,{.{{||||,.||||{||.,|,||{{{{{{{((((..{{{|,||{{{{|||||{{{.|||({{{|{{(((....)))}.,..,{{{{{|,....,(((((,,.,{((({({({{((,((,(,,,{,,,.,,}},..)),),,.})))).}}|{|||||||,..,|,,}}||}}}}},}},.,||||||{({((({((((({({,{{..,,,,,,,,..,,.{((.((((........)))).)))|||{{..{{||,,,||,,{{((((((,,...(((({,{(((({.,(({,,.,}}}({((((({{(.(((((({{.{{{..{{||{{{,,{(((..{(((((((((,{{(((((((.(.(((,,,|||||||||.}}.{{|||,{{|||||{{.,,,..,,,,||((((.(((((({.............})))))).))}).,..}}}|}},,...,....|||,|||....}})|})),,......)))),....(((((((((.....))))))},))...}}||||}|{}||..(((((.((.((((((((........((((...............))))........)))))))).})))))).}))},,,||||,{,.{.{{({{{{.{(((({((((((((({{........(({((,,,,.,|{((,,.....||,......,,,{({{,....||||{({.{{(((((((((,({{{.,,..,}}}.})}}|{|||{((......}}}}||||,,,,,.,,,{({(,.{{{,,,{{{{{{{{.,.,,.,,||}|}||},|}}}))))}}.}}}.}}})})},......,,}}|}},|{{{{..((((((((........)))))))))||||{{,,,.,}||}}|,...,}))))}}}....,.,},.((((((....))))))...}})))}..}))},,,,}))}},))})))}}),}},,...(((({...})))}.........(((((((((....)))))))))..,,{...,,,|||,.,.,,,},,||||{||||||}|},.,{((((({,.....||||(((|{(|{....|{{.|,,{((.,.((({{|{..,||,|{{{{{||{|},,.,,{(((((((,..||,.}}})))}}..((((..{((((((((((((((|(,{{.,,...(((((.{(((((.(((((..((........)).....})))).)))))....}.))))).......,,.}))))))),....,,,,,,..{{,||{{{({.,,{{{|}}}}}}},....,|||,{{,...((((((({,(....))))))))).}|||||...,((((((,,{((({.{{{{,.............{((((((((.....)))))))))}})),.))))))))))))))))))))))))).}))))}}},,}}},.{{{({({{.,{({{{{....,...})))))))))},))))))))))))}.,,,......,{,....}}}...,}}..........||,.....,)),}..,))))))})}}})))))))|((((....))))}...(((((({...))))))),,,,..|}}},}})))),))|}..}}}},||,......}}},.))},)))}))})...|||}}}}}}..,},|{,.{{{{{,..((({...)))).})))}.}}}}))},})..))))),.})))}}}}}...||,{{(((((((,|,,,,,.,}))))))},.}))},})))))))..,,|((((.((((.{{(,((((,..((((...,.,}.((((...)))).((((((((((....))))))))))........}}}}...,))))).}}}.)))).))))},.....)),.))))}}..),))))))}..}}))..))))}))),,))}).,)),,}}),))))).....,,,,}}},,||||||||||,,,,.}||,|||||}|,,.{{{.....,)}}}}),))))))},)}}}})),},,,||{{{{....})}}},.,||||,{{{{...,,,..}))))))))).,,,,,..
Back