Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
TEX26-AS1:29
Sequence Length
2155 nt
GC Content
0.4432
AGGGAGUUCUGCCCCUGCCAAGGGGUGCUGGCCACGCAGGAGGCUUAACCUGGCCGGCGCGGGAAUGGGGUGCAGAGAGCAAAGAAAUGUGGCUUUGAUCUUAUGGAUGCCUUACUUUUACAUUAUUUGUACAGUUCUUGCAGUGAGCUUUCCGGACCACUGUCUUGUAUGUUUCCUAAGAAAAGCAAAAAGGGAAGAGAUUGAAGAGAAAGUAGAUUUUCAACUACAAACUUUCAUCCAUUUGCUUUCAGCUUAAGCAAAUGUGCGCAAAGUUGUCAUGGAUUUUUGCAGUCAAUAAAAACCAAGCAAGAAGACUGAAUCCCAAGUCAUCUGGUAUAAAUGGAAGCAGUUUCUGUGAUAGUUCCACGCGGUCAGAAGGGUCAUCCUGGCUUAGGAGAGGGGCAGAAGAGGAAAUGCACGCGUGGAAACAGGAGUGGGCAGGGAGGAUGUGACACUGUCCUCCUCACCAGGCCACGUUCCUGGCACCAACCAUAGUGUUUGGGCAGAUAAGAAAAGAAACAAUUUGCUGAAACUCCCUCUGCUUAUAACAAAACUGACUGAAAUCAGCCGGAAUCAAUAUGGCCAAAUGCAGUUUGCGCACAGCAAGCUUGCUGAUGUCACAGCCUGAAUUUCUACUGCAUGUUUCAUACCAACUCCCUCCAAAUUUGCACAUGGGACCCACCAGGAAGCAUGAAGAGAGAGCCAUGCAUGCCUGAAGACUUCCCAGAUGUUCCCUUUGCUUCCACCAAUCACCUGCUAACCCCAGGAUCCAACCCUAAACCUUUUGUAAUAAAAUUACUGCCCUAAAGCCAGUACAAGACAGAUUUGAACUGGACUUUUGUUUCCUCAGAAGUUAACUUGCAAUGUGAAGCUUUCCUUUUCUCAAAAACUUGGUGUCAUAGUGUUGGCUUCUAGUGCAGUGAGCCCCUUUUGCUGGAUAACCUUACCUGGUAAUUUGACAUACUAGGUGGUUAGUAACUACUGACUGUCUCCAGGUUACAACACAGUUAUUACCCACUUGGGUGAAAAGAGAAGACAGGAAAUACAUUUUGGAGUUGGCUGGCAACCUGUUUACAAAGCAAUUUACAACAGUUCCUUAUUCUUAAGGGGCUAUUCUAAUACAAGACCUCAGAGAAACAGUGCAGUGUGACAAAGGAGGAAUUUAUCAAAGGAGACAGAAAAAGCAUCAAGGCAAGCUGUGAAAUGGUGCGGUAGGAACCAAAUAGAGAGCCAAAGGAUCUUUCUGUCACUGCAGGCCCUUAGGGCUGAACUCUGAGAACACCACAACUUCACAGAGACUGCUGGUUUUCUGCAAUUAGCAGCAAGAGUCCUGACUCAGGGAAGUUGCUCUCCAGUCCAGACUAGCAAAAGACAGAGAGAAUGGGCUCUGCAGAAGACAGAUCCAGACAAGCCAUGCAUGAUUCAUGCCACCUGCAGCCACACGGGUGUCAAUACCAAGAACCUGCCAUAUGUCAUCAAGAGUGUGUUAAGUGAAACCUUCUCAAGAGUUAUUCUUUUGUGCUCUGUCCAAAUCUGGAGAACCCUUCCAAAUACUAUAAAGAUUGAUAUCUUGGCCGGGCCCGGUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGCAGGCAGAUCACAAGGUCAGGAGUUCCAGACCAGCCUGGCCAACCUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAACUACAAAAAUUAGCCAGGCGUGGUGGUGUGCGCCUGGAAUUCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCACUUGAACCCGGAAGGCUGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUCACACCACUGAACUCCAGCCUGGACAACGAGAGUGAAACUCCGUUUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACUGAUAUCUUGACCAUAUAGUGACUCCUCCCAACUGAUCAUUUUUGUUCACAUUCUGUUGUACAGAAUAUGAACAUUUGGAAGGCAGCAGUCUUCCAAUAUGAUUGCCAAUAAUAUUUAAAUGAUCAUCAAUACUCAUUUAAAUUAAUAAUAAUAUUUAAAGUUAUUUUGGGGUAUACUGCAUAAUGUAAUCCUCAUGUCAGAAGACUUAAAGGAGCUCAAAAGGAAAAGUCACUGCAUUUGUUUUUGGUAAUAAACAUGCCCCACUUCUUACUUUCUGAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-645 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -685.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 391.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((...((((((....))))))((((((((....((........))))))))))..((((((((((((((((((.(((((........))))).)))).....)))...(((..((((.....)))).)))...((((((((..(((((((((....)))).(((((((((.((((.((((((((...(((.(((((((((((.........)))))))........)))).))).))))))))...)))).).))))))))(((...(((((.(((((((.(((.((........))...)))(((.((((........)))).)))............((((((((((((((.((((....(((((((((((((((....((((((((.(((((((((..........))).....(((...(((((((((((.(((((((.(.(((...))))))))).))..))).))))))))...)))........((((.(((((((.............))))))).)))).)))))).))..........(((.(((....))).)))..........((.....))(((((((.....))))))).((((......)))).....((((((((((((.(((((((....(((.(((......(((...(((......)))....)))....))).)))....((.(((((((.(.(((......((((.(((((((((((.....((((((((.......(((.......))).........(((((...)))))......(((((((((.((((.....)))).))))).))))((((((((.((.(((((((((..((((((....((((((((((((....(((.((.((((......)))).)).))).(((((((.....)))))))..(((((..((((((((........)))))))))))))(((((..(((........))))))))..........((((((....))))))...))))))..))))))))))))...))))))))).......(((((...))))).........(((((((((....)))))))))..(((......))).)).)).))))))..)))).))))....))))).......)))))).))))....)))).)).))))).)))))))))..)))))))))))).........))))))...))))))))))..))))).((..(((((((.....)))))))....))..)))))))))))))))))).((((((((((...((.(((((...(((((...)))))...)))))))..((((((..((..(........)..))..)))))).))))))))))))))))))))))....))).(((((..((((.(((.(((((..((((((((...((((..(..((.((((.((((((((..(((...(((......)))...))).(((((...........))))).........(((((.....)))))...........)).))))))..)))).))..).))))....))))))))..((((((....))))))))))))))..)))))))))...((((.(((((((((((((((((((((......((((......))))......................))))))).)))).........))))))))))((((........))))(((((.((((..((((((.........((((((.((((.(((((..............))))))))).)))))).........))))))..)))))))))................((((......))))))))......((((((((.......((((((...((((((.(((((((...))))))).)))))).(((((((((....))))))))).)))))).........((((((((((..........))))))))))....((((((.......)))))).(((((..(((........)))..))))).(((....)))....))))).)))...)))))..))))))))..(((((........))))).)))))).))))))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((...{(((((....)))))}((((((({...{({........)}))))))))..(((({((((((((.(((({(((({....,.{{|}||,,||},.,,}}.})}..,{{..((((.....)))).}}}...((((((((..(((((((((....)))).((((((((,{((((.{(((((((...(((.(((,(((.((,({{{,....,))))..)).)}}.,)))).))).))))))))...)))),).))))))))(((..{(((((.(((((((,{{,...........,|,..||,{((.((((........)))).))),,}.....,,,.((((((((((((((.((((....(((((((((((((((....((((((((.(((((((((..........)))....,(((...((((((((({(.(((((((.(.(((...))))))))).)).,})),),})))))...))}.},...,.((((.(((((((.............))))))).)))).)))))).))..........(((.{((...,))|,||}........||||.....{{(((((((.....))))))},))||.,,,},}}},.,,..(((((((((((({(((((((....(((.(((......(((...(((......)))....)))....))).)))....((.(((((((.(.(((......((((.((((((,((((.{,..((((((((.......(((.......))}.........(((({...}))))......{((((((((.((({.....}))).))))).)))|((((({{({,{,(((((((((.,((((((....((((((((((((...{((({((.({({,,{{{,||||,{{,,|,.{{|{|||,,....,}}}}),,|{(((..((((((((........)))))))))}|||{|,|,.}))}}}}}.,.})))))),,.......,..((((((....))))))...))))))..}))))))}))),,,,))))))))){{...,,(((({...})))}.........(((((((((....)))))))))..{({......})}.,}.,),)))))),.)))).))))....)),))},.....)))))).))))....)))).)),})))).)))))))))}.}))))))))))).........))))))...))))))))))..))))).{{..(((((((.....)))))))........)))))))))))))))))).((((((((((...{(.(((((...(((((...)))))...)))))},..((((((..((..(........)..))..)))))).))))))))))}))))))))))),}..))).(((((,.((((.(((.(((((..((((((((...((((..(..((.((((.((((((((..,({.({(({..,.,,,,,.,,},|.(((({.,,......},))))).,,,,....||||{.....}))},,})}}......)),})))))..)))).))..}.))))....))))))))..((((({....})))))))))))))..)))))))))...(((({(((((((((((((((((((((.....,((((......}}}}....................,.))))))).)))),,,....,})))))))))),(({.{,{{{..,}))|||||.((((..((((((.........((((((.((((.(((((..............))))))))).)))))).........))))))..))))}}}}}.................{{{......))))))))......{(((((((......{((((((,..((((((.(((((((...))))))).)))))).(((((((((....))))))))).||}}}}.........{{{{{{||||,,........}}}}}}}}}}....,,,,,,..,....}}}}}}.{((((..(((........)))..))))}.(((....)))....))))).))}...)))))..)))))))).,|||||,,.,,...}}}},.)))))).)))),)))))))....
Back