Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

TEX26-AS1:3

Sequence Length

815 nt

GC Content

0.4307

GAGUGGUUCUCCCUCCACAGACCCAAAAGGCUGAACUGGUGAACCUGCUGCAUCUGUGGGCAGAAUUAGGAUGAAAAGCACUACCUCUGUGAAAUACAAAAUCUCUGUGGAAGAAAAAUCAAUUCAGUUCUUGCAGUGAGCUUUCCGGACCACUGUCUUGUAUGUUUCCUAAGAAAAGCAAAAAGGGAAGAGAUUGAAGAGAAAGUAGAUUUUCAACUACAAACUUUCAUCCAUUUGCUUUCAGCUUAAGCAAAUGUGCGCAAAGUUGUCAUGGAUUUUUGCAGUCAAUAAAAACCAAGCAAGAAGACUGAAUCCCAAGUCAUCUGGUAUAAAUGGAAGCAGUUUCUGUGAUAGUUCCACGCGGUCAGAAGGGUCAUCCUGGCUUAGGAGAGGGGCAGAAGAGGAAAUGCACGCGUGGAAACAGGAGUGGGCAGGGAGGAUGUGACACUGUCCUCCUCACCAGGCCACGUUCCUGGCACCAACCAUAGUGUUUGUGAGGGUCAAUUUAAUUGUUCUUGUGCUCUCAUAGAGGAAGCUGUGUCUUUCAUCCCCUUGUAAGAGUUUUCACUGAUGAAGGGGGUCUUUUAUCUUCAUAUCUUGGGAACUACUGAAACUGUUUCAAAGAGUCAAAGACACCAAUAACUAACAGAAAUUCUUGUUUUCAGGGGCAGAUAAGAAAAGAAACAAUUUGCUGAAACUCCCUCUGCUUAUAACAAAACUGACUGAAAUCAGCCGGAAUCAAUAUGGCCAAAUGCAGUUUGCGCACAGCAAGCUUGCUGAUGUCACAGCCUGAAUUUCUACUGCAUGUUUCAUAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-219 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -235.58

Frequency: 0.0000

Diversity: 291.01

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((((.....(((((((..((..(((.............)))..))..)))))))(((((..(((...........)))..)))))........(((.(((..((.(((((............))))).))..))).)))..))))))))(((((.....((((((.............)))))))))))(((((....((((((..((((................(((((((((.......)))))))))((((((((.(((.(((.(((((...((((((.........((((((((.((((........)))).))).........(((((((((((((((..((((((((((((..((......((.((.((.(((......))).)))).)).....))..))))))))..(((((((((((.(((((((.(.(((...))))))))).))..))).))))))))((((........))))(((((((((((((...........))).))))))))))((....))((((((((.((((((((.....(((....)))....))))))))..............((((.(((((..........))))).))))...)))))))).....))))))))))))...)))))))((((((((((.............)))))).......)))).)))))..........))))))))))).((((.........))))...))))))))))))))(((((....)))))...........))))..)))))).....)))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((((((,{(,,{{{((({.,{{..{{{,|,....,,.,},))}.,)}..}}}}}}}|,{{,...,||,,||,..,|||}.,,||((((({{((........,(((((.((({......,{{{{{,||||{{((((,,({....||,,}}}})}||,{...,{{{,,|,}},,{((({,{.,|{({|{{({{(({((,{,,,{{,{.,}}}}..)),),,.})))}.))|.}))|))}}..||,,||||,,,||{{{({{{{.{(({((({(({{{,,,({{(({......,,,{,{{,(((.((((........)))).))),}}.....|{((((((((((({{{,.|{{(((((((((..((......((.{,(((.(((......))).))),.)).....))..)))))))),.((((((((({(.(((((((.(.(((...))))))))).)).,})),),,))))){(((........)))){((((((((((((...........})).))))))))))}|}...,,|||||||}}||((((((.,,.,(((....}))..,,))))))}}..,...,,,,....{(({,(((((....,,....))))).,}}},,,,}}))),}......,,,})))}}}},,,})))}})|{((({((,,.,,..,,.......))),))....,}}}})}))))}..........}}}}||}}}}}.(({(.........})))...,,|}|||||||}}}}}},,,)))}||||......}})}}))))))))).)))))}))))))},.