Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

TEX26-AS1:30

Sequence Length

1614 nt

GC Content

0.4554

AGGGAGUUCUGCCCCUGCCAAGGGGUGCUGGCCACGCAGGAGGCUUAACCUGGCCGGCGCGGGAAUGGGGUGCAGAGAGCAAAGAAAUGUGGCUUUGAUCUUAUGGAUGCCUUACUUUUACAUUAUUUGUACAGUUCUUGCAGUGAGCUUUCCGGACCACUGUCUUGUAUGUUUCCUAAGAAAAGCAAAAAGGGAAGAGAUUGAAGAGAAAGUAGAUUUUCAACUACAAACUUUCAUCCAUUUGCUUUCAGCUUAAGCAAAUGUGCGCAAAGUUGUCAUGGAUUUUUGCAGUCAAUAAAAACCAAGCAAGAAGACUGAAUCCCAAGUCAUCUGGGGCAGAUAAGAAAAGAAACAAUUUGCUGAAACUCCCUCUGCUUAUAACAAAACUGACUGAAAUCAGCCGGAAUCAAUAUGGCCAAAUGCAGUUUGCGCACAGCAAGCUUGCUGAUGUCACAGCCUGAAUUUCUACUGCAUGUUUCAUACCAACUCCCUCCAAAUUUGCACAUGGGACCCACCAGGAAGCAUGAAGAGAGAGCCAUGCAUGCCUGAAGACUUCCCAGAUGUUCCCUUUGCUUCCACCAAUCACCUGCUAACCCCAGGAUCCAACCCUAAACCUUUUGUAAUAAAAUUACUGCCCUAAAGCCAGUACAAGACAGAUUUGAACUGGACUUUUGUUUCCUCAGAAGUUAACUUGCAAUGUGAAGCUUUCCUUUUCUCAAAAACUUGGUGUCAUAGUGUUGGCUUCUAGUGCAGUGAGCCCCUUUUGCUGGAUAACCUUACCUGGUAAUUUGACAUACUAGGUGGUUAGUAACUACUGACUGUCUCCAGGUUACAACACAGUUAUUACCCACUUGGGUGAAAAGAGAAGACAGGAAAUACAUUUUGGAGUUGGCUGGCAACCUGUUUACAAAGCAAUUUACAACAGUUCCUUAUUCUUAAGGGGCUAUUCUAAUACAAGACCUCAGAGAAACAGUGCAGUGUGACAAAGGAGGAAUUUAUCAAAGGAGACAGAAAAAGCAUCAAGGCAAGCUGUGAAAUGGUGCGGUAGGAACCAAAUAGAGAGCCAAAGGAUCUUUCUGUCACUGCAGGCCCUUAGGGCUGAACUCUGAGAACACCACAACUUCACAGAGACUGCUGGUUUUCUGCAAUUAGCAGCAAGAGUCCUGACUCAGGGAAGUUGCUCUCCAGUCCAGACUAGCAAAAGACAGAGAGAAUGGGCUCUGCAGAAGACAGAUCCAGACAAGCCAUGCAUGAUUCAUGCCACCUGCAGCCACACGGGUGUCAAUACCAAGAACCUGCCAUAUGUCAUCAAGAGUGUGUUAAGUGAAACCUUCUCAAGAGUUAUUCUUUUGUGCUCUGUCCAAAUCUGGAGAACCCUUCCAAAUACUAUAAAGAUUGAUAUCUUGGCCGGGCCCGGUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGCAGGCAGAUCACAAGGUCAGGAGUUCCAGACCAGCCUGGCCAACCUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAACUACAAAAAUUAGCCAGGCGUGGUGGUGUGCGCCUGGAAUUCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCACUUGAACCCGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-475.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -506.63

Frequency: 0.0000

Diversity: 434.24

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((.((((.((((((....))))))((((((((....((........))))))))))..((((.((((((((((((((((((....(((..((((..((((((...(((((((....((((.....)))).(((((.......))))).(((((((.(((....((((((((((.((((.((((((((...(((.(((((((((((.........)))))))........)))).))).))))))))...)))).).)))))))))...))).))).))))(((((((.((........))...)))))))((((........))))...))))))).))))))))))..))).))))))........))))))...........(((.(((....))).))).((((...((((((...(((((((((.....))))))).((((......)))).....((((((((((((.(((((((....(((.(((......(((...(((......)))....)))....))).)))....((.(((((((.(.(((......((((.(((((((((((.....((((((((.......(((.......))).........(((((...)))))......(((((((((.((((.....)))).))))).))))((((((((.((.(((((((((..((((((....((((((((((((....(((.((.((((......)))).)).))).(((((((.....)))))))..(((((..((((((((........)))))))))))))(((((..(((........))))))))..........((((((....))))))...))))))..))))))))))))...))))))))).......(((((...))))).........(((((((((....)))))))))..(((......))).)).)).))))))..)))).))))....))))).......)))))).))))....)))).)).))))).)))))))))..))))))))))))........((((((......((((((((((..(((.(((((...)))))...(((((.(((.........))).))))).(((((((((......)))))))))....((((..((((..((((......)))).))))..)))).)))...))))))))))...))))))(((......................))).(((((..((((.(((.(((((..((((((((...((((..(..((.((((.((((((((..(((...(((......)))...))).(((((...........))))).........(((((.....)))))...........)).))))))..)))).))..).))))....))))))))..((((((....))))))))))))))..)))))))))...((((.((....)).)))).)).))))))...))))...)))))))))).....................(((((((((......)))))))))...(((.((..(((((....))))))).))).........))))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

..((.((((.((((((....)))))|((((((({...{({........)})))))))),,((({{(((((({({((({,(((((....,,,,||||}.||||.|,,.||||,,{{,..{(((.....)))).|||{{.{((,.((,((((((.(((...(((((((,{.,{{{{{.,..|,|(((((((..,(((,((({(((,((,({{,{....,})))..)).)},.})))).))).)))))))|{{{|,,{{((...((((((((((.{((,{{{,(((((,..((((((.........{((({(((.((((........)))).)))(((({((,,,{{.,|,.......))),))....,,}))},))))}..........))))))}}))).((({.........))))...,})))})))))))))),,..)))}||||...,,.}}}}.{{..((((((((((((((((((({....(((.(((......(((...(((......)))....))),,..))).)))....((.(((((((.(.(((......((((.(((((({((((.,,..((((((((.......(((.......)}}.........(((({...}}))).,....{((((((((.((({.....,))).))))).)))|((((({{(||{,(((((((((.,(({(((....((((((((((((...,(({{((.({({,,{{{,||||{|{|,|,,{||{|||,.....,}}}})},|{{{{..((((((((........)))))))))}|||{|,,,.}})|}}}}.,.})))))),,.......,..((((((....))))))...))))))..))))))}))))},,})))))))))||....,(((({...}}))}.........(((((((((....)))))))))..{{{......}}}.,}.,),)))))),.)))).))))....))})),,.....)))))).))))....)))).))},)))).)))))))))},}))))))))))}.,.....,((((((......((((((((((..{{(,(((((...))))),..(((((.(((.........))).))))).,((((((((,.,,,.,,,,|||||{...,,(({{(,,,}}}||..,}}}))}}.,))},.,))))})))...))))))))))...))))))}}).}}))))).))).)}.}})))})}}}{||{{{.((((.(((.(((((..((((((((...((((..(..((.((((.((((((((..,({.({(({..,.,,,,,.,,},|.(((({.,,......},))))).,,,,....||||{.....}))},,}}}}......)),})))))..)))).))..}.))))....))))))))..((((({....})))))))))))))..))))))|||,..((((.((....}}.}))}.,}})))},..,}}})},..))))))))))..,,,............,}}}(((((((((......)))))))))..,(((.((..(((((....))))))).)))}........))))))....