Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

TEX26-AS1:34

Sequence Length

1022 nt

GC Content

0.4530

CAUCCCUUGCUCUAUCUGUCUUCUUAUCUUGGGGUGCCUCGUGUUUACAAGAAACGCGUACGUCCUUUCUAGAAAUUAGCAAGCAGAAUUCAGAAACAAGUGUGUCCAUGUGACAUAAGCAUGCUUCUUAUAAUUUGCUAUUGCAGUGGUUCCCACCUCCUUUGAAGAUUUUAUUCAUUUAUAACCUUCCUCUCUGCUCCCUCACAACCUUACUACAAAGCCUCGCCAGAUUUCUAGAAGUGUUUCUGAGAAUUUUGCAGAUUUGAAGGAGGUUCUGGGCUGCUGUAAAGGCAGGCUAGAUAAUCAGCUCCCACAAGGCUGCAGUUUGUAACUGGAGUCUCAGAAAUCAAAAAUUCCACUCUAUAAUUAUCACAGAUGAGAACUGUGCCUCCACAGCAUGUAUCCAUUAUGGGGAAGGAAAGUGGAAGAUCGAGAUAGCUGGUUUUCAUGUUCCUGCAGUGCUGGAUUUUUUCUUCUUCUUUUUUUUUUUUAUUUUUUUAAGACAGUUUCUGUCACCCAGGCUGGAGUACAGUGGUGUAAUCAAAGCUCACUGCAGCCUCAACCUCCUGGGCUCAAGUGAUCCUCCUGCCUCAGCCUUCAAAGUUGCUGGGACCACAGGCAUUCGCCACCAUGCCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUUUUUGCAGAGACAGGGUUUCAUUAUGUUGCCCAGGGUGGUCUUGAACUCCUGAACUUGCGCAAUCUGCCAGCCACGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUAUAGGCAUAAGCCACCAUGACUUGCUGGGUAUUCAAAUCACAACUUGGCUCUUACAGAAACUUUCUUAUUUGCAAAAGAAAAUCUGCAAAGAUCAGGAAACAGGGCUGCUCCAUGCUUUCCACCUCCACCCCUACCCCUACCCCAUGCCCAGCUCUCCCCAGCUUCUCCAGGGACCAGACAUUCUGACAAAUGGCUAGUCUAGGGUUCUAUGGACCAAGGCAACCAGAGGUUGAUUCUUCUCCCUGCUGCUACCUCUAACACAAUCCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-282.2 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -299.74

Frequency: 0.0000

Diversity: 203.78

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.........(((.((((((......((..(((((((...(((((((.....))))))).......((((((((((((.((.((((((....((((.((.(((((((.....)))))..)).)).)))).......(((....)))((((...)))).......((((...((((......)))).))))...))))))..........(((......)))....))..)))))))))))).((((((((((...((((((..(((..((((.((((((.(((((.....))))).))))).....).))))..)))..)))))).............)))))))))).........)))))))..))....)))))))))..(((((....))))).............(((((((((((((.((((((..(((((..(((((.....(((....)))..)))))))))).)))))).)))))))))..............(((((...)))))....((((((.(((..(((..((....))..))).))).)))))).....((((((((.(((((((..(.((((.((((((..........))))))....(((((((........))))))).....((((((((........)))))))))))))..))))).))..))))))))((((((.((((.((((.(((.((.((....(((......))).((((..((.((((((......(((....)))..........(((((((((...........(((((.((((.((((...((((((........)))))).))))..))))))))).....(((..((.....))..))).......................)))))))))....))))))..))...)))).((((...)))).....)))).))).))))))))...))))))(((....((((((..((....))..))).)))...)))..........)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

,,,,,,.......................{||||||...(((((((.....)))))))...........((((...((((,{((((.....((((.{(,(((((({.....}})))..}),)),))}}......,((((.((((((((({{(,.(((((((((((((...,((,......),}}.}}}}...(((((...((((.((((((.(((.(((...{,....),))).)))))).)))..))))......))))).,,)))))))))...)))))))))))).)))){(((.{{...,})))}......((((((((((..((...{(((({,..,{..........}}},},|||,.......{{{{|,},,...)))|).,.,}{(|,{{((({((((...(((((((((((((.((((((..{(({,.,({(({.....{{{....))}..)))})},,,},))}))),))})))))),,,...........(((((...))))).))))...)))},)))}|)}.}),.......))..)))))))))),,,,,((((((((.(((((((..(.((((.((((((,......,..))))))....(((((((........))))))).....((((((((........)))))))))))))..))))).))..))))))),((((((.((((.((((.(((.((.{{....(((......))).((((..{(.((((((......(((....))).....,....(((((((((...........,{{((.((((.((((...((((((........)))))).))))..))))})}||{,,,{(((..{,.,,.,)},,))).......................)))))))))....))))))..)}...)))).((((...)))).....}})).))).))))))))...)))))).{{,,,||.,})))))..,}},....)))))))))..)))).....,,}}}}.