Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

TEX26-AS1:8

Sequence Length

747 nt

GC Content

0.4364

GGGUGCUGGCCACGCAGGAGGCUUAACCUGGCCGGCGCGGGAAUGGGGUGCAGAGAGCAAAGAAAUGUGGCUUUGAUCUUAUGGAUGCCUUACUUUUACAUUAUUUGUACAGUUCUUGCAGUGAGCUUUCCGGACCACUGUCUUGUAUGUUUCCUAAGAAAAGCAAAAAGGGAAGAGAUUGAAGAGAAAGUAGAUUUUCAACUACAAACUUUCAUCCAUUUGCUUUCAGCUUAAGCAAAUGUGCGCAAAGUUGUCAUGGAUUUUUGCAGUCAAUAAAAACCAAGCAAGAAGACUGAAUCCCAAGUCAUCUGGGGCAGAUAAGAAAAGAAACAAUUUGCUGAAACUCCCUCUGCUUAUAACAAAACUGACUGAAAUCAGCCGGAAUCAAUAUGGCCAAAUGCAGUUUGCGCACAGCAAGCUUGCUGAUGUCACAGCCUGAAUUUCUACUGCAUGUUUCAUACCAACUCCCUCCAAAUUUGCACAUGGGACCCACCAGGAAGCAUGAAGAGAGAGCCAUGCAUGCCUGAAGACUUCCCAGAUGUUCCCUUUGCUUCCACCAAUCACCUGCUAACCCCAGGAUCCAACCCUAAACCUUUUGUAAUAAAAUUACUGCCCUAAAGCCAGUACAAGACAGAUUUGAACUGGACUUUUGUUUCCUCAGAAGUUAACUUGCAAUGUGAAGCUUUCCUUUUCUCAAAAACUUGGUGUCAUAGUGUUGGCUUCUAGUGCAGUGAGCCCCUUUUGCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-195.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -209.3

Frequency: 0.0000

Diversity: 209.18

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((((((((((....((........)))))))))))).(((.((((((((((.((((((((...((((((.....(((((.(((.((..(((...((((.....))))........((((((..((....))..))))))...))).)).)))))))).(((((((...(((.(((((((((((.........)))))))........)))).))).)))))))(((((..((((...((((((((((.(((.(((.(((((...((((((.........((((((((.((((........)))).)))(((((((((.............)))))).......)))..)))))..........))))))))))).((((.........))))...))))))))))))))))....))))))))).))))))((.((..(((((.((.((((((((........((((...............))))........)))))))).)))))))..)).))....(((.........))).......))))))))...........))))..))))))...)))...............((((.....(((((((.(((((((((((((....(((.......)))((((((((......)))))))).........(((((.(((....((((....))))...))).))))))))))))))).))).))))))).......))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

{{((((((((({...{({........)}))))))))}}(((..((((((((((.((((((((..,{.{(({,,,,.(((({.(((,((..,{{...((((.....)))).,{,....((((((..((....))..)))))),,,}||,||,|||}}}},.|{(((({.{{(((.{,{.,(((((.,..((({(,..|||{.,,,|,,.|||||.,}|{{||{||{,.,,,..}|||}}}||{{{(({{|,||(,{{{.(((((...((((((.........((((((((.((((........)))).)))(((({((,,.{{..,,.......))},))....,})))}.)))))..........))))))))))).((((.........))))...,,}}}||||||}}}|||||,))}}||||..,,,,}}||.||,},,|||,||.{,{,||||,.......||||,......,,}}....||}}....,||})))))))).})))))),.)}.)),}.}},,},},,.,,))).}),}...))))))))...........))))..))))))...}}}..,},..........{{,,.....(((((((.(((((((((((((..{,((,..,,,..,,}((((((((......))))))))......,..{{{({.{{{....,{|,..,|},,....))),))}),)))))))))).))).)))))))..,,...,,}}..