Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
THUMPD3-AS1:11
Sequence Length
734 nt
GC Content
0.4237
UUCGGCGCUCCGGCUCCUCAGAGAGCCUCGGCUAGGUGUGGAAACAGGAAGAGAACUAGAACUGGAAGUAAAGCAUUGAAGAUGUGACUGAAUUGCUGCAAUCUCAUGAUCAAAUUUGAAUGGAUGAGGAGUUGCUUUUUAGGGAUGAGCAAAGAAAGUGGUUUCUCGAGAUGGAAUCUACUGGUGAAGUUGCUGUGAACAUUGUUAAAAUGCCAAUAAAGGAUUUAGGAAUUACAGAAACCUGGUUGAUAAAGCAGUGCCAGGGUGUGAGAGAGUUGACUUCAAUUUUGAAAUAAGUUCCACUGGCUGGGUGUGGUGGCUCACACCUGCAAUCCCAGUACUUUAGGAGGCCGAGACUGGUAGAUCAUUUGAGGUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUUGCCAACAUGGUGAAACCCCACCUCUACCAAAUUAGCCAGGUUGCUCCUUGAGGGCAGGACAGUUCUUAUGGCUUUAUCCGUUGCGUAAGCACAGAGAGGUCUGCGAGGUCAAAACUAUUGUCAUGAUAGCAAGAUGCCUGUCUUUUUCAUUUAUUCUCACGGUGUGCAGAGGCUACAUGAUGUGUGAUGACAUCCUCAUUGAUGUUAAUGAAUGGUGCUAUACUUGAAUUUUCUAAGGUGUCAUUAGGUAGGUUUAGGUAUGCAUACUUGUUUUUAGAAAUUAUUUUUUUCCUUUUUCCCAUUUUUAGAAAUCAACUCAUUUUUUAGGUUAUGCCUUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-202.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -216.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 188.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((..(((((......)))))..))).(((((.(((((.((((((((((..(...(((((((..(((..((((..(((.((.((........)).)).)))..))))....(((((((((((((.((((((.........))))))....(((((.((((......)))).)))))((((((...(((((((..((((((....((((....(((((...............((((((((((((....(((((......(((...(((((((....)))))))...))).....)))))(((((((((((((.....)))).)))..))))))......(..(((.(((.(((((.((.(.((((....)))).).))...))))).))))))..)..((((......))))........))))))))))))..)))))...)))).))))))..)))))))))))))...(((....))).(((.((((((((...((((..((....))..)))).)).))..)))).))))))))))))))))(((((((((((....)).))))....)))))(((((((......))))))).......((((.(((((((((((((((((.......))))).)))))))))))))))).))).)))))))...)..)))))))))).))))))))))(((((((.........))))))).....)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((((..(((((......)))))..))).,((((.(((((.((((((((((.,{,..((((((({{{{({,,({{,,{{{.{{|{{...,|,,,|}.||,|||..|||.....(((((((((((({,{(((((.{,...,|.}}}}}}....(((((.((({......)))).)))))(({{{{{{{{{(({((,,,{((((....((((....{((({....,......,,|.((((((((((((...,{{{,({,,{({({(...(((((((....)))))}}...}}}...,|},}}}|((((((((((((.....)))).))}..))))}}......|},{({{({{.{{{{{.,,.|.{{||||,,}}},.,})),,.)))}),)))))}.....((((......))))........)))))))))))).})))))...)))).})))))}}})}})))))))}),,.{((....))),(((.((((((((...((((..((....))..)))).))},),.}))).)))})))))))))))).{{{{((((((....)).)))),,|||},},{{|||||..,,,,}}}}})}}},},,}((((.(((((((((((((((((.......))))).)))))))))))))))).,)),)))))))...,..)))))))))).)))))))))}{((((((.........))))))),....)))...
Back