Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

THUMPD3-AS1:20

Sequence Length

2606 nt

GC Content

0.4493

GGGGGCGGGCUGCCGGCCGAGACUUCUGGAUGGCGGCGGCCGCGGCUCCGCCCCGGGUUCCCACCGCCUGAAGGGCGAGACAAGCCCGACCUGCUACAGGCACUCGUGGGGGUGGGGGAGGAGCGGGGGUCGGUCCGGCUGGUUUGUGGGUGGGAGGCGCUUGUUCUCCAAAAACCGGCGCGAGCUGCAAUCCUGAGGGAGCUGCGGUGGAGGAGGUGGAGAGAAGGCCGCACCCUUCUGGGCAGGGGGAGGGGAGUGCCGCAAUACCUUUAUGGGAGUUCUCUGCUGCCUCCCGUCUUGUAAGGACCGCCCUGGGCCUGGAAGAAGCCCUCCCUCCUUUCCUCCUCGCGUGAUCUCGUCAUCGCCUCCAUGUCGAGUCGCUUCUCGAUUAUGGGCGGGAUUCUUUUGCCUAGGCUUAAGGGGCUAACUUGGUCCCUGGGCGUUGCCCUGCAGGGGAGUGAGCAGCUGUAAGAUUUGAGGGGCGACUCCGAUUAGUUUAUCUUCCCACGGACUAGAGUUGGUGUCGAGGUUAUUGUAAUAAGGGUGGGGUAGGGAAAUGGAGCUUAGUCAUUCACCUGGGGCUGAUUUUAUGCAACGAGACUGCGGAUUAUCACUACUUAUCAUUUUUGGAGCAUUUUUCUAGAGACAGACAUAAAGCAUGAUCACCUGAGUUUUAUACCAUUUGAGACCCUUGCUGCACCACCAAAGUGUAGCAUCAGGUUAAAUCUUAAUAGAAAAAUUUUAGCUUUUGCUUGAGAAACCAGUGCUUCCCUCCCUCACCCUCUCUCCCCAGGCUCUCUACCCCUUUGCAUCCCUACCAGGCAUCUUAGCAACUCUCACUCAUACUUGAUCCCAUUUUCCAUUUGUUGUACUUGCUCCUCUAGUAUUCAGACAUAGCACUAGCUUUCUCCCUCUCUUGAUCUUGGGUAGCCUGGUGUCUCGCGAAACCAGACAGAUUGGUUCCACCACAAAUUAAGGCUUGAGCUGGGGCUUGACUCUUACCCAGCAGUGCUUUUAUUCCUCCCUAGUUCACGUUCUUAAAUGUUUAUCUUGAUUUUCAUUUUAUCCUUUUUCCUUAGCUGGGAUUCUGUCCCUGACCGUCUUCACAGUCCAGGUGAUCUUGACUACUGCUUUACAGAGAAUUGGAUCUGAGGUUAGGCAACAUCUCCCUUUUUCUUCCUCUAAAUACCUCUCAUUUCUGUUCUUACCAGUUAGUAACUGAUCUCAGAUGCCUGUGUGAUAGCUUCCAAAUUGCUGUCUCUGUCUUUAGUGUUAUCUUUUGAUCCAUCUUACAUCUUGUUAGGAUGAUUGUCCUAAAGGAAGAUAGAGCAUGAAAAUGACAGGUGAAACUCCAUUACUGGCUUGUACUGUUUACAGCAAGUUGUCUAACCCGCGGGCCGCAUGGGACCCAGGACAGCUUUGAAUGCGACCCAACACAAAUUCGUAAACUUUCUUAAAGUUUUAGGAGUUUUUUUUGCGGGGUGUUUUUUUUGUUGUUGUUGUCUGUUUUUUUUUUUUGCUCAUCAGCUGUCCUUUAUAUGUGGCCCAAGACAGUUCUUGCAGUGUGGCCCAGGGAAGCCGAAAGAUUGGACACCCCUGGUUUACAGGAUGAAUUCUGUUCUCGUGAAUGUGAUGCAUAAGGUCCCUGGAUAGACUUUCCUCAAUUUAACAGCUUUUUCAUUUUUCACUAUUUUCCACAUACUACACACACAAAUAUGACCUCUCUCCUGAAGUCACAUGGAAUGAAUUGCAGUUACCCAAAUCAUAGAGACGUCAUAUAUCUUUGUGGGGUGGUUCUUUUUGGAAUGCUACCCUUGCUGCUUUUAAUCCUGCAGAUUCAAAUGUCAUCUCCCCUUUGGUCAUGCCUUCCAUGGUCUGUUGUUCUAUGACCCAAACUGCCCUUUUAAAAAAGCAGUUUUCUUCUGACUCCUGAGCAGUUUGUACUGCGUGGGUCAUAGUAAUUCUGGGGUUGUUGUCAUUGCUGAUUUAAAUUACCUUAACUAUUCUGAGCUUUUUGAAGGAAUAGUGUCUUGUACUCCUGAGCUCCUAGUAUACUCUGAUGUCUAGCCAACUUUAAGUAAAUGGAGUGAGCGACAUGUAAAUGUCUUUAUGGUUUGACAUUUUAUUAAUCUUGAGCAUUGGAAAAGUGGCUGGUAUGACUAAAGAACUGAAUUUUUAUUUUUUAUCUAAUUUGAAUUGCAACUGUGGACAGUAUAGCUGUAGCCCCGGACUUGUUCUGUGGAUUACAGAAUACGUGGACAUUGAUGGUUUUCUCUUUUUACUGAGCAGUAAGGAAAUAAAAGCUGAAGCUCUCUGGCCCAUUACAUUUCAUUUAACUGCUUGUUUUGUUUUAUUUAUUAUAUAUUUAGCUGAAAGCUAAGUCCAACAAACCAUUUUUAAAGAUGUGCCUGCCUUGGACAACAGUGAAAGCAAGCGUUAAUGAGUUUGGAUUUCAAAAAAAAAUGCAUAAUGAAUUUUAGGGAGGUGUGGAAACAGGAAGAGAACUAGAACUGGAAGUAAAGCAUUGAAGAUGUGACUGAAUUGCUGCAAUCUCAUGAUCAAAUUUGAAUGGAUGAGGAGUUGCUUUUUAGGGAUGAGCAAAGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-805.97 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -860.49

Frequency: 0.0000

Diversity: 721.69

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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