Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

THUMPD3-AS1:22

Sequence Length

583 nt

GC Content

0.4185

UCUGGAUGGCGGCGGCCGCGGCUCCGCCCCGGGUUCCCACCGCCUGAAGGGCGAGACAAGCCCGACCUGCUACAGGUGUGGAAACAGGAAGAGAACUAGAACUGGAAGUAAAGCAUUGAAGAUGUGACUGAAUUGCUGCAAUCUCAUGAUCAAAUUUGAAUGGAUGAGGAGUUGCUUUUUAGGGAUGAGCAAAGAAAGUGGUUUCUCGAGAUGGAAUCUACUGGUUGCUCCUUGAGGGCAGGACAGUUCUUAUGGCUUUAUCCGUUGCGUAAGCACAGAGAGGUCUGCGAGGUCAAAACUAUUGUCAUGAUAGCAAGAUGCCUGUCUUUUUCAUUUAUUCUCACGGUGUGCAGAGGCUACAUGAUGUGUGAUGACAUCCUCAUUGAUGUUAAUGAAUGGUGCUAUACUUGAAUUUUCUAAGGUGUCAUUAGGUAGGUUUAGGUAUGCAUACUUGUUUUUAGAAAUUAUUUUUUUCCUUUUUCCCAUUUUUAGAAAUCAACUCAUUUUUUAGGUUAUGCCUUCAGUAAUCUUUGCAACCUCAAUAUUGUGUAAUGGUUACUUUAAAAUACUGUAGUUUUCUUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-163.9 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -175.2

Frequency: 0.0000

Diversity: 198.98

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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