Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

THUMPD3-AS1:25

Sequence Length

851 nt

GC Content

0.4383

CGGGUUCCCACCGCCUGAAGGGCGAGACAAGCCCGACCUGCUACAGGCACUCGUGGGGGUGUGGAAACAGGAAGAGAACUAGAACUGGAAGUAAAGCAUUGAAGAUGUGACUGAAUUGCUGCAAUCUCAUGAUCAAAUUUGAAUGGAUGAGGAGUUGCUUUUUAGGGAUGAGCAAAGAAAGUGGUUUCUCGAGAUGGAAUCUACUGGUUGCUCCUUGAGGGCAGGACAGUUCUUAUGGCUUUAUCCGUUGCGUAAGCACAGAGAGGUCUGCGAGGUCAAAACUAUUGUCAUGAUAGCAAGAUGCCUGUCUUUUUCAUUUAUUCUCACGGUGUGCAGAGGCUACAUGAUGUGUGAUGACAUCCUCAUUGAUGUUAAUGAAUGGUGCUAUACUUGAAUUUUCUAAGGUGUCAUUAGAUGAGGUCUUGCUGUGUUGCCCAGGCUAUUCACAGCUGCCAUCAUAGUGAACUACAGCCUGAAACUCCUGGGUUCAAGAGAUCCUUCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGAACUAUAGGCAUGCGCCACCAAGCCUGGGCUUUUAAAAAAAUUUUAAAAAGAAUUUUGAGACAGGAUCUUGCCAUGUUGCUCAGGCUAGUCUUCAACUCCUAGCCCUGAGUGAUCUUGCUUUGGGCCUCUCAAAAUGUUGAGUUAAUAGGCGUGAGCCACCAUACCCAGCCAAAAAUUUUUUUAGAGAUGGGAAUGGAAUGAUCUUGAAUAGUGUUGGUGCCACCUAUGUUGUGGCAUCAUUUUGAAACCAAUCAUUCAGAGUGCUUUUUUUGGUAAGGCAUUAUUUUUUAAUGCAGGUAUGCCACUACUGGGAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-261.9 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -278.84

Frequency: 0.0000

Diversity: 198.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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