Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

THUMPD3-AS1:35

Sequence Length

829 nt

GC Content

0.4644

ACGAGUCACGGUGGCUCCGCGCUGGCGGCGGGUUCCCCCACAAGGUCUUGGGGAAAGGAGCAUGCGCUGGAAGCUGUGUGCUGUUGGUUUUGAGGAUCUUCAGUAAGCUGAAAGCGGAGAGUCAGGGGCCUUGUGUCCUACCAUGGUAUUUGCUAACGUUUAGAGAGUGCUUCCCCUUGCCGAGCACUGGAACCCAAAGAUUGGAUCUUCUGAGAACAUCAGAGAAAGACUGUCCUUACCAUCCACACCACAGCAAAACUUUGGAGCCUUGAACAUUGGGUUCAUAAUCUCACAGCUGAGAAAGGUCCCUCCACACUCCUGGAACUGUACACCUAUUGGAACCCUUAAGCCUUCCAGGAGGCACCAGUCAGAGCAAUCAAAUGGAAUCAUCUCCUGGUGAAGUUACCCAGCUGCUAAAUCUAAAGCCCUGAGCAAGGUACUGUACAGUUUACAAAGAAGAGUCAGAUGCAGCCCCAUUGUACUCUUAAGGGACAACAAUAGAAGAAAUGACAGAAGACAAUCAGAGAUUAAUGACCAGAUGAAUGAUAUAUACCAGGUGGUCCCAACCUGAGCUCCCAGGCUCCCAAGGGUCUUAGAGAGCAGUAAUGGGGGGAGAAGGAAGGGGUGCUUAUGAGCUAUUUGCAGUACUUCAAAAAGACUAAUCCAAAGAGCUCAUAUUUGCUAGAUAUUAGAUGCACAGGCUAAUUAAAAGAAAACAUCAGGUUUCUUUGCUCGGGGCUAGAAACACCAGUUACCCCAUGCUGACUGGAAGAUCUGAUUGGCAGUUACCGUUGUCUUUGAUUAAUAAAACAUGAGAAAAUGAAUUAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-232.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -250.46

Frequency: 0.0000

Diversity: 214.86

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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