Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
THUMPD3-AS1:41
Sequence Length
7326 nt
GC Content
0.3938
GAACCAGGGCUCUUUCCUACACUCCUCUUCACAUUCCCGACUUACACGCAGAGGGAAAGAGAAUUCAUAAAGGGAAUAUUUUUCUGCCUUUGAAGAUAUUCUCACAAGAUCGUUCUCCACGCCCAAGGUGUGGAAACAGGAAGAGAACUAGAACUGGAAGUAAAGCAUUGAAGAUGUGACUGAAUUGCUGCAAUCUCAUGAUCAAAUUUGAAUGGAUGAGGAGUUGCUUUUUAGGGAUGAGCAAAGAAAGUGGUUUCUCGAGAUGGAAUCUACUGGUUGCUCCUUGAGGGCAGGACAGUUCUUAUGGCUUUAUCCGUUGCGUAAGCACAGAGAGGUCUGCGAGGUCAAAACUAUUGUCAUGAUAGCAAGAUGCCUGUCUUUUUCAUUUAUUCUCACGGUGUGCAGAGGCUACAUGAUGUGUGAUGACAUCCUCAUUGAUGUUAAUGAAUGGUGCUAUACUUGAAUUUUCUAAGGUGUCAUUAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGCAUAACUGGGACUACAGGGAAGCACCAUUUUCCACAAAACUCUCAAGAAGGACUUGUUGCAACUGGAAAAGCAAUUAAAUGUGAAUCGUGAUCCAGGAGAAAGUAACAACUCACAUAACUCCCAAAUUAAAAGUUUUCCAAAGAUAUAUCAUUUUUUUUCUCUUGGCCUUUUAAGAAACUAGCCAACAAAUACUCUUGACAGGUUUGUGUUUGGUUUUGAAAACACACACCUUAGUGUACUGAAAGAAAAACAAUUUCUUUUAAUUUGGUUUGUUGGUCCCACACCCCAUCUAUCAAUGUAUGUGCUAUUUACAAAUAAGUUCUAUACAGUAUUUUUGCAGUACCUUUGAUAAUUCCUAGACCUCUAUUUUCAUUCUGUGUAUUAAUGUGAAUAACAGAUGGAUAUUUUAAUAUUUAAGGCAGAUGGUAAACUUUCCUAUAGGUCUUGUGAGACUUCGUCUUAUAGGCUGAACACCAUUCACAAAAUGUAAUAAUGCUUCAUUCCUUCAGGUUGAGGUAAAGAACUUGAGCAACUGGAUUAGCAAAGCUGCAAAGAAUGAAAUGUGGCCUAAGAUGUAAUUAUGUUCUCUGCCCUUCCUUUGGGCCAGGGUAGUUUUGCACUUGACACAAUGGAAAAUAGGCCAUAAAGCCUGAAAAUAAAAUGUUCUAAACCCCAAUCUCACAGCACUUUAGUAGGCUUUUCACUAGGCAUCUUUAAAGUAUUUUCAACAAAAUACUAAUUAAGCUACCACUUCAAAAGAGCUUCAAGGAAAAGCUCUGCUUUCUUAUAAAAUCUUUUUGAGACAGAGUUUCGCUCUUGUCGCACAGGCUGGAGUGCAAUGGCGUGAUCUCGACUCACCGCAACCUCCGCCUGCUGGGUUCAAGUGAUUCUCUAGCCUCAGCCUCCUGAGUAGUUGGGAUUACAGGCGCCCGCCACCACACCUGGCUAAUUUUUGUAUUUCUAGUAGAGACAGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUCCGGACCUCAGGUGAUCUGCACACUUCGGCUUCCUAAACUGCUGGAAUUACAGUCGUGAGCCACUGUGCCUGGUCUCAUAAAACUUUUAAAUUCCAUCACAUUACAUUCACACCUUUUGCUAACCAGGAUGAAGAGCCUUAAACAGGUUUAAAGAGUGCAGACUGCAGUUUUGUUAAUACUUUUUUCCUCUCCAAGUUCUUUUAUGCUAACAUUUCCAGUGGUGGGAAGUACAAGUACUAUUAGUCAUCUUCAUUCUUUGCAUUGCCAAAGAGUUCCUCUUUCUCCGUCUUGUUCUGAAGGAUGAACAAAAGCUUGAGGUGUACGUAUCAGAACGUAAACUGCAGCACGAAGACCACCAACGUUCACCCAGACUGUAUCCACCUUUCGCCAUACGUGUCGCAUUCCAGAUAACGCCUGUGUACACACAAAAAAAAUAACAAUUAGGUUGACAAUCUACUUUUACAUCAACUAGGAUUCUUAACUGCCAAGAUAGGAAACCUCAGGGGAAGAGAAAACAAAUCUUAUCCAAACAAACAUCCCCAAAUCUCAAAAAGAUCCCAAAGUUGCCACAGGCUGCGAUUUUGAGCUAAUGUGUAUAGCACCUUGGUAAAGCAUUUUGUGUCUUGAGUAAGUAGUACAGCUCGGCCUGUGGUAGGUGUGCAGACACGGCUCAUCUCCCGUAGGCAAGCUGGAUAAAGGUUCCAGUUUCUCUUCUUGGAUCCCAUCCUAUAAUAGAAGGUCUCAUGAGUCAAACACUUGCAAAAGAUACAAAAUAGAAGGACUAUAUGAAACAAAAACAGUUUCAUGCAUCCUGAGGCAUGAAAAAUAGCUGUAGUUUUAGAAACCAGACCUUUGCCAUUACAUGUCUAUGAAAUAAGUUGAGUUAGUAAACUGCUUAGAAUUCUGAAUCAAAAAAAUUUUUUUUAGACAACUGUGUUAGUUAUAUGACUUGUCCUCUUAGUAUAAUAAGCAGUCAAACUGUAUAAACCAAACAAGUGAUUAGAAAUCAUUUAGGCCAGGUGUUUUGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCAGUUUGGGAGGCUGAGGCGGGCAGAUCACCUGAAGUCAGGAGUUUGAGACCAGCCUGGCCAAUAUGGUGAAACCCUGUCUUUUAAAAAUACAAAAAUAAGCUGGGCAUGAUGGCAUGUGCCUGAAAUCCGAGCUACUCAGGAGGGUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCCGGGAGGCAGAGGUUACAGUGAGCCGAGAUCAUACCACUGCACUCCAGCCUGGGCAACAGAGCAGGGCUCUGUCUCCAAAAAAAAAAAAAGAAUCAUUUAUGCUGAGAAACAGAAUGAGAACCAAGUCUUCUACCACCUUUUUGUGUAGGAUAUAUAAUUCAAGAAUGGGCUAGAAAGUGAAUUACAGGUAAUUUAAAAAUGAACCUCCCAUGAUGGUCAGGAUUCCAAAUGUAGUUAAUACAUUCCUGAGUUCUCGGAAGAAACAUAAUGGGUGAAUCCAUCAUGUUGUUAAGUGAAAAACAGCUCUGCUAAGUCUGCUAAAAUUCAAGAUUUUUUUCCUGACUUAGAAUAAACGCAAGGAAAAUAAUGACAUAUUUAGAAGACAAGCAGGUACUAGUAUUUCUCACCUUUUUCCAAAUGGCAAAUCUGUUACAAUAAUAUCCACAGAGCCAGUUCUCAAUGGCAGAUUGCAGAUAUCCCACUGAACAGCAUCUAUGGGCAAGCCCCAGGAGGGUUUGCUGUGGGGACAAAGGAAAGGUGCUUCAACAUACUGUGAAGCAUAAAGUUAUUACAACAAUUUUUGUUUCUGAAGAGAGACUGCUACAGCAAAACAUAAACUGCUAAGGAUAUCAGUGAUAAUAUCAACCUAUUCAAAAUUUAAGAAAUGGCACAAAGGUAAAAAAUAGGUCAGGCUGGGCAUGGUAGCUUGUGCCUAUAAUCAGCACUUUCAGGGGCUGAGGUGGGAGGAUCACUGGACUCCAGGAAUUUGAGACCAGCUGAGCAACACUGUGAGACCUUGUCUCUAAAAUACUUUUUUAAGAAGUUAGCAGGGCAUGAUGGCACACACCUAUAGUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGUGGGAGGAUCACUUGAGUCCAGGAGUUGAAAGAUGCAGUGAGCUAGGAUUGUGCCGCUUUACUCCAGCCUGGGUGACAGAGCAAGACCCCCGUCUCAGAAAAAAGGGAAACAAACUGAAAACAUGAUUGUAAUGCAGAGAACUGCAAAAGACAACUUUAAAAACAAUGCUGAAGCAGUAAAUUACAUAACCGAUGAUACAAAAAUUUAAGUUGCUGAUAAAACAUACACUGGAGAAAAACAAUACUAAAGAAUAGAUAAUGGGGUGAUGUAUCUGAAGAAUAAAGUUUGUAAAACUAGUAAUAACAGGAGGCCUAAAAGAAAAACAGAUAGUAAAAUUGGCAAAUAUAUAGGUAAUUGUUUCAAGAUGAAAAACCAAAAGGAAAAUAUGUGCCAUGCUAUAUAAAACAAGACUAAGAAAAAAGUUAAGAUAAAAAAUAUAGAUGACAGAAGACAGAAUGAAUAAUAAUAAAUACAAAGGAUUUAAAUCCUCCUCAUUAAGGCAAAGCAACUGGUUUAAGAAACAAAAUAAUGCACAGGCUAAGAACUGAAGAUAAGUCAAAGGUUAUCAGCAGAAAUUAAGGAUUUAAUUGACAUUUAAUGAAGAAUUUAAGAAAAAAAUGCAAUAAAAGCAAUCAUUACAUAAUUUUUAAAAGUACACAUAAAAUAUGUAUUAUAACCGCAUACCAAUAACUGCACAAAACAAAAGGCAAAAAAUAUUAAAAACCAAAGUAAAAUGGAUAGAAAUGUACAGGUUGAGGCCGGGCACAGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGUGGGCAGAUCAUGAGGUCAGGAGAUUGAGACCAUCCUGGCUAACAUGGUGAAAACCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAAAAAAUAAGCCGGGCAUGGUGGCGGGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUGGCGUGAACCCGGGAGGCGGAGCUUGCAGUGAGCCGAGAUCAAGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCGACAGAGUGAGACUCCGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGUACGGGUUGAACAGACAGUGUAGGUACAAACAAGAUAAAAUAUUCAGAAGCUAGAAAGGUACGUUUGUUUAAAUGUUUAUCAGUUUUAAUUAAAAAAAAAAAAGACUGGCCAUAUACUAGGCUCAUUAAAAAAAACCCUCAAUAAAUAUGAAACAACCAUUCAAAAUUAAUUCAUCACAAUAAAUCAGUAUUUAAGAAAAUUGAAGCCUUCCAACUACUUGUCUUAAUACACGUAAAAGGAUUUAAUGUUGAUACAUAGACCAGCAGCAUCAGCAUUGUCCUGGAGUUUCCUGGAAAAUGCAGACUCU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2148.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2280.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 1635.76
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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