Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

THUMPD3-AS1:46

Sequence Length

1115 nt

GC Content

0.3946

AGACACGCUGUGGCACACGCCACGGGGAGCCAGAGAACGUGUGGUGGGGGUGGCGAAGGUGUGGAAACAGGAAGAGAACUAGAACUGGAAGUAAAGCAUUGAAGAUGUGACUGAAUUGCUGCAAUCUCAUGAUCAAAUUUGAAUGGAUGAGGAGUUGCUUUUUAGGGAUGAGCAAAGAAAGUGGUUUCUCGAGAUGGAAUCUACUGGUUGCUCCUUGAGGGCAGGACAGUUCUUAUGGCUUUAUCCGUUGCGUAAGCACAGAGAGGUCUGCGAGGUCAAAACUAUUGUCAUGAUAGCAAGAUGCCUGUCUUUUUCAUUUAUUCUCACGGUGUGCAGAGGCUACAUGAUGUGUGAUGACAUCCUCAUUGAUGUUAAUGAAUGGUGCUAUACUUGAAUUUUCUAAGGUGUCAUUAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGCAUAACUGGGACUACAGGGAAGCACCAUUUUCCACAAAACUCUCAAGAAGGACUUGUUGCAACUGGAAAAGCAAUUAAAUGUGAAUCGUGAUCCAGGAGAAAGUAACAACUCACAUAACUCCCAAAUUAAAAGUUUUCCAAAGAUAUAUCAUUUUUUUUCUCUUGGCCUUUUAAGAAACUAGCCAACAAAUACUCUUGACAGGUUUGUGUUUGGUUUUGAAAACACACACCUUAGUGUACUGAAAGAAAAACAAUUUCUUUUAAUUUGGUUUGUUGGUCCCACACCCCAUCUAUCAAUGUAUGUGCUAUUUACAAAUAAGUUCUAUACAGUAUUUUUGCAGUACCUUUGAUAAUUCCUAGACCUCUAUUUUCAUUCUGUGUAUUAAUGUGAAUAACAGAUGGAUAUUUUAAUAUUUAAGGCAGAUGGUAAACUUUCCUAUAGGUCUUGUGAGACUUCGUCUUAUAGGCUGAACACCAUUCACAAAAUGUAAUAAUGCUUCAUUCCUUCAGGUUGAGGUAAAGAACUUGAGCAACUGGAUUAGCAAAGCUGCAAAGAAUGAAAUGUGGCCUAAGAUGUAAUUAUGUUCUCUGCCCUUCCUUUGGGCCAGGGUAGUUUUGCACUUGACACAAUGGAAAAUAGGCCAUAAAGCCUGAAAAUAAAAUGUUCUAAACCCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-283.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -308.35

Frequency: 0.0000

Diversity: 335.11

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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