Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
THUMPD3-AS1:48
Sequence Length
1868 nt
GC Content
0.3699
GGAAGCCGCCGGGGCCGCCUAGAGAAGAGGCUGUGCUUCGGCGCUCCGGCUCCUCAGAGAGCCUCGGCUAGGUGUGGAAACAGGAAGAGAACUAGAACUGGAAGUAAAGCAUUGAAGAUGUGACUGAAUUGCUGCAAUCUCAUGAUCAAAUUUGAAUGGAUGAGGAGUUGCUUUUUAGGGAUGAGCAAAGAAAGUGGUUUCUCGAGAUGGAAUCUACUGGUUGCUCCUUGAGGGCAGGACAGUUCUUAUGGCUUUAUCCGUUGCGUAAGCACAGAGAGGUCUGCGAGGUCAAAACUAUUGUCAUGAUAGCAAGAUGCCUGUCUUUUUCAUUUAUUCUCACGGUGUGCAGAGGCUACAUGAUGUGUGAUGACAUCCUCAUUGAUGUUAAUGAAUGGUGCUAUACUUGAAUUUUCUAAGGUGUCAUUAGGUAGGUUUAGGUAUGCAUACUUGUUUUUAGAAAUUAUUUUUUUCCUUUUUCCCAUUUUUAGAAAUCAACUCAUUUUUUAGGUUAUGCCUUCAGUAAUCUUUGCAACCUCAAUAUUGUGUAAUGGUUACUUUAAAAUACUGUAGUUUUCUUUGUGCCUAAGUAUAAACAUAAGUACAUUUUGUUGUUUUGUUUGCAAUAGUGGUUUAAAUAUUUUCCCAAAAUAUCCAAAUUUAAAAAUUCUACAACUUUAGAAUUUAAUAAAUUUAUUCUAAAAUAUUUAUAUAUUUUUUCAUUUAAGAAUGGAUCGGCUUAAAAAGACUGCUUCUCAUUUACUUACUGGCUAUACCAUCUGUAUACUAAUAAAAAACAAGAUUUGAUUUGGAAGGACUGACUCAAACUAACGAAAAUAUGAAACCUGUCUUUCUGCUUUGGAGAUAUUUACCUAAUCAUGUUCUGCAGUAGAAUAAUUUAGUUCUUUUGUCUUUUUUUGGAGAUGAGGUCUUGCUGUGUUGCCCAGGCUAUUCACAGCUGCCAUCAUAGUGAACUACAGCCUGAAACUCCUGGGUUCAAGAGAUCCUUCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGAACUAUAGGCAUGCGCCACCAAGCCUGGGCUUUUAAAAAAAUUUUAAAAAGAAUUUUGAGACAGGAUCUUGCCAUGUUGCUCAGGCUAGUCUUCAACUCCUAGCCCUGAGUGAUCUUGCUUUGGGCCUCUCAAAAUGUUGAGUUAAUAGGCGUGAGCCACCAUACCCAGCCAAAAAUUUUUUUAGAGAUGGGAAUGGAAUGAUCUUGAAUAGUGUUGGUGCCACCUAUGUUGUGGCAUCAUUUUGAAACCAAUCAUUCAGAGUGCUUUUUUUGGUAAGGCAUUAUUUUUUAAUGCAGGUAUGCCACUACUGGGAAAAAAAAAAAAACAGGUUUUAAAGCUAGAAAUGAAAAGCUACUUAAGUAUCUUAAAGGAUAAGUUACUUUAUUAUACACUAGAAACAUACACAAUAGCUGAAAAACUUAAAAAAUCUCACACUGCUGAAUGUCUCUGCUGGCUGAAGUGUAAGUAAAAGAUCAUAGUAGUGCCGCUGUUGAGUGAUAAAGCAACUUGUCAUUAAAGAUGUGUGUGCAGACAUGGAUUCUGAGUUAAUAUCUCAUCUGUAGAAGUAUAUAUUUGUCCCUUGCUUUGGGAUUGGUUUCUGGACAGCACUCCCCCACCCUUGCUGGCCAUUUGCCAAGGACACCAAAACCCAAGGAUGUUGAAUUCCCUUUUAUAAAAUGGCGCUGUAUCUGCAUACAACUUACACACAUCCUCCCAUAUACUUUAAAUCAUUUCCAGAUUUCUUAUACUUCAUACAAUGUGAAUGCUAUAUAAAUAGUUGUUACAUUGUGUACUUAUAUUUGUACUAUUGUAUUAAAUAUUCUCAAAUAUUUUCA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-493.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -528.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 405.6
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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