Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
THUMPD3-AS1:49
Sequence Length
1808 nt
GC Content
0.3722
GGAAGCCGCCGGGGCCGCCUAGAGAAGAGGCUGUGCUUCGGCGCUCCGGCUCCUCAGAGAGCCUCGGCUAGGUGUGGAAACAGGAAGAGAACUAGAACUGGAAGUAAAGCAUUGAAGAUGUGACUGAAUUGCUGCAAUCUCAUGAUCAAAUUUGAAUGGAUGAGGAGUUGCUUUUUAGGGAUGAGCAAAGAAAGUUGCUCCUUGAGGGCAGGACAGUUCUUAUGGCUUUAUCCGUUGCGUAAGCACAGAGAGGUCUGCGAGGUCAAAACUAUUGUCAUGAUAGCAAGAUGCCUGUCUUUUUCAUUUAUUCUCACGGUGUGCAGAGGCUACAUGAUGUGUGAUGACAUCCUCAUUGAUGUUAAUGAAUGGUGCUAUACUUGAAUUUUCUAAGGUGUCAUUAGGUAGGUUUAGGUAUGCAUACUUGUUUUUAGAAAUUAUUUUUUUCCUUUUUCCCAUUUUUAGAAAUCAACUCAUUUUUUAGGUUAUGCCUUCAGUAAUCUUUGCAACCUCAAUAUUGUGUAAUGGUUACUUUAAAAUACUGUAGUUUUCUUUGUGCCUAAGUAUAAACAUAAGUACAUUUUGUUGUUUUGUUUGCAAUAGUGGUUUAAAUAUUUUCCCAAAAUAUCCAAAUUUAAAAAUUCUACAACUUUAGAAUUUAAUAAAUUUAUUCUAAAAUAUUUAUAUAUUUUUUCAUUUAAGAAUGGAUCGGCUUAAAAAGACUGCUUCUCAUUUACUUACUGGCUAUACCAUCUGUAUACUAAUAAAAAACAAGAUUUGAUUUGGAAGGACUGACUCAAACUAACGAAAAUAUGAAACCUGUCUUUCUGCUUUGGAGAUAUUUACCUAAUCAUGUUCUGCAGUAGAAUAAUUUAGUUCUUUUGUCUUUUUUUGGAGAUGAGGUCUUGCUGUGUUGCCCAGGCUAUUCACAGCUGCCAUCAUAGUGAACUACAGCCUGAAACUCCUGGGUUCAAGAGAUCCUUCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGAACUAUAGGCAUGCGCCACCAAGCCUGGGCUUUUAAAAAAAUUUUAAAAAGAAUUUUGAGACAGGAUCUUGCCAUGUUGCUCAGGCUAGUCUUCAACUCCUAGCCCUGAGUGAUCUUGCUUUGGGCCUCUCAAAAUGUUGAGUUAAUAGGCGUGAGCCACCAUACCCAGCCAAAAAUUUUUUUAGAGAUGGGAAUGGAAUGAUCUUGAAUAGUGUUGGUGCCACCUAUGUUGUGGCAUCAUUUUGAAACCAAUCAUUCAGAGUGCUUUUUUUGGUAAGGCAUUAUUUUUUAAUGCAGGUAUGCCACUACUGGGAAAAAAAAAAAAACAGGUUUUAAAGCUAGAAAUGAAAAGCUACUUAAGUAUCUUAAAGGAUAAGUUACUUUAUUAUACACUAGAAACAUACACAAUAGCUGAAAAACUUAAAAAAUCUCACACUGCUGAAUGUCUCUGCUGGCUGAAGUGUAAGUAAAAGAUCAUAGUAGUGCCGCUGUUGAGUGAUAAAGCAACUUGUCAUUAAAGAUGUGUGUGCAGACAUGGAUUCUGAGUUAAUAUCUCAUCUGUAGAAGUAUAUAUUUGUCCCUUGCUUUGGGAUUGGUUUCUGGACAGCACUCCCCCACCCUUGCUGGCCAUUUGCCAAGGACACCAAAACCCAAGGAUGUUGAAUUCCCUUUUAUAAAAUGGCGCUGUAUCUGCAUACAACUUACACACAUCCUCCCAUAUACUUUAAAUCAUUUCCAGAUUUCUUAUACUUCAUACAAUGUGAAUGCUAUAUAAAUAGUUGUUACAUUGUGUACUUAUAUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-480.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -513.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 409.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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