Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

THUMPD3-AS1:61

Sequence Length

2679 nt

GC Content

0.4487

GUAGAGAUGCUGGGUGUGCGGGCGCGGCCGGCCUCCUGCGGCGGGAGGGGAGGGUCAGUGAAAUCGGCUCUGGCGCGGGCGUCCUCCCACCCUCCCCUUCCUUCGGGGGAGUCGGUUUACCCGCCGCCUGCUUGUCUUCGACACCUGAUUGGCUGUCGAAGCUGUGGGACCGGGCCCUUGCUACUGGCUCGAGUCUCACAUGAGCGAAACCACUGCGCGGGGCGCGGGGGUGGCGGGGAGGCGGGCGUUGGUACGGUCCUCCCCGAGGCCGAGCGCCGCAGUGUCUGGCCCCGCGCCCCUGCGCAACGUGGCAGGAAGCGCGCGCUGGAGGCGGGGGCGGGCUGCCGGCCGAGACUUCUGGAUGGCGGCGGCCGCGGCUCCGCCCCGGGUUCCCACCGCCUGAAGGGCGAGACAAGCCCGACCUGCUACAGGUGUGGAAACAGGAAGAGAACUAGAACUGGAAGUAAAGCAUUGAAGAUGUGACUGAAUUGCUGCAAUCUCAUGAUCAAAUUUGAAUGGAUGAGGAGUUGCUUUUUAGGGAUGAGCAAAGAAAGUGGUUUCUCGAGAUGGAAUCUACUGGUGAAGUUGCUGUGAACAUUGUUAAAAUGCCAAUAAAGGAUUUAGGAAUUACAGAAACCUGGUUGAUAAAGCAGUGCCAGGGUGUGAGAGAGUUGACUUCAAUUUUGAAAUAAGUUCCACUGGCUGGGUGUGGUGGCUCACACCUGCAAUCCCAGUACUUUAGGAGGCCGAGACUGGUAGAUCAUUUGAGGUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUUGCCAACAUGGUGAAACCCCACCUCUACCAAAUUAGCCAGGUGUGGUGCACACCUGUAGUCCCAGCUACUUGGGAAGCUGAGGCAGGAGAAUCUCUUGAACCAGGGAGGAGGAGGUUGCAGUAAGCCGAGAUGGCGCCCCUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGUGAGACCUUGCGUUUAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAGGAAAAAAAAGUUCUACUGUGGGUAAAAUGCUAUCAUGCUAUCAAACAGCAUCACAUGCUACAGAGAAGUCUUGUGAAAGGAUGUCAGUGUGGCAAACUUCAUUGUCUUUUAAGAAAUUGCCACAGCUAUCGUAAUCUUCAACCACCACCACCCUGAUGAGUCAGUAGCCAUCGUUAACGUUGGCGUAAGACCCUCCACCAGCAAAAAGAUUGUUAGCAUUUUUUUAGCAGUGAUGUAUUUAUCAAUUAUACAUAAUGCUAUUGUACACUUCUUAAUAGACUAUGGUAUAGUGUAACCAUAAUUUAUGCACUGGGAAACCAACAAAUUCAUGAGAUUCGCUUUAUUGUAGUGCUCUGGAAUUGAGCCUGCCGUGUUUCUGAGGUAUACCUGUGUAUUUAGUAUGUUCCUUGUAUAUAAAACCCCAUUUUAUAGGGUAGGAAACUAAGGCUUAGAGUUUGAGCAAUUUUCCCAUAGAUAACACCAAUAAAUUGAGGGCUGCAGAGACCACUUAAGUGGUUCUCUUAACAGUAGUCUAGACAUGACGUAAUGAGAUUUGGCUUAGGAGUGACAAUGGUAAGGAAGUUAAAGGAUUCAGGAACCAAAUACCAGUUAUUGAGAAGAAAGAAUGGCCUCAAAACAUCACUUCUCAAGGAAGCCUUGAUACCCUCACCCUUACUACACUGUAUCCUCCAUUUGAAUGUUGUCAAGAGCUCUUCUCACAAUUGUAAAUAAUAAUUGUGUAAUUUUGUUUUUUUUUUCCUACUUUAGGUUGCUCCUUGAGGGCAGGACAGUUCUUAUGGCUUUAUCCGUUGCGUAAGCACAGAGAGGUCUGCGAGGUCAAAACUAUUGUCAUGAUAGCAAGAUGCCUGUCUUUUUCAUUUAUUCUCACGGUGUGCAGAGGCUACAUGAUGUGUGAUGACAUCCUCAUUGAUGUUAAUGAAUGGUGCUAUACUUGAAUUUUCUAAGGUGUCAUUAGGUAGGUUUAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGCAUAACUGGGACUACAGGGAAGCACCAUUUUCCACAAAACUCUCAAGAAGGACUUGUUGCAACUGGAAAAGCAAUUAAAUGUGAAUCGUGAUCCAGGAGAAAGUAACAACUCACAUAACUCCCAAAUUAAAAGUUUUCCAAAGAUAUAUCAUUUUUUUUCUCUUGGCCUUUUAAGAAACUAGCCAACAAAUACUCUUGACAGGUUUGUGUUUGGUUUUGAAAACACACACCUUAGUGUACUGAAAGAAAAACAAUUUCUUUUAAUUUGGUUUGUUGGUCCCACACCCCAUCUAUCAAUGUAUGUGCUAUUUACAAAUAAGUUCUAUACAGUAUUUUUGCAGUACCUUUGAUAAUUCCUAGACCUCUAUUUUCAUUCUGUGUAUUAAUGUGAAUAACAGAUGGAUAUUUUAAUAUUUAAGGCAGAUGGUAAACUUUCCUAUAGGUCUUGUGAGACUUCGUCUUAUAGGCUGAACACCAUUCACAAAAUGUAAUAAUGCUUCAUUCCUUCAGGUUGAGGUAAAGAACUUGAGCAACUGGAUUAGCAAAGCUGCAAAGAAUGAAAUGUGGCCUAAGAUGUAAUUAUGUUCUCUGCCCUUCCUUUGGGCCAGGGUAGUUUUGCACUUGACACAAUGGAAAAUAGGCCAUAAAGCCUGAAAAUAAAAUGUUCUAAACCCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-874.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -923.48

Frequency: 0.0000

Diversity: 679.94

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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