Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
THUMPD3-AS1:63
Sequence Length
5054 nt
GC Content
0.4446
GUAGAGAUGCUGGGUGUGCGGGCGCGGCCGGCCUCCUGCGGCGGGAGGGGAGGGUCAGUGAAAUCGGCUCUGGCGCGGGCGUCCUCCCACCCUCCCCUUCCUUCGGGGGAGUCGGUUUACCCGCCGCCUGCUUGUCUUCGACACCUGAUUGGCUGUCGAAGCUGUGGGACCGGGCCCUUGCUACUGGCUCGAGUCUCACAUGAGCGAAACCACUGCGCGGGGCGCGGGGGUGGCGGGGAGGCGGGCGUUGGUACGGUCCUCCCCGAGGCCGAGCGCCGCAGUGUCUGGCCCCGCGCCCCUGCGCAACGUGGCAGGAAGCGCGCGCUGGAGGCGGGGGCGGGCUGCCGGCCGAGACUUCUGGAUGGCGGCGGCCGCGGCUCCGCCCCGGGUUCCCACCGCCUGAAGGGCGAGACAAGCCCGACCUGCUACAGGCACUCGUGGGGGUGGGGGAGGAGCGGGGGUCGGUCCGGCUGGUUUGUGGGUGGGAGGCGCUUGUUCUCCAAAAACCGGCGCGAGCUGCAAUCCUGAGGGAGCUGCGGUGGAGGAGGUGGAGAGAAGGCCGCACCCUUCUGGGCAGGGGGAGGGGAGUGCCGCAAUACCUUUAUGGGAGUUCUCUGCUGCCUCCCGUCUUGUAAGGACCGCCCUGGGCCUGGAAGAAGCCCUCCCUCCUUUCCUCCUCGCGUGAUCUCGUCAUCGCCUCCAUGUCGAGUCGCUUCUCGAUUAUGGGCGGGAUUCUUUUGCCUAGGCUUAAGGGGCUAACUUGGUCCCUGGGCGUUGCCCUGCAGGGGAGUGAGCAGCUGUAAGAUUUGAGGGGCGACUCCGAUUAGUUUAUCUUCCCACGGACUAGAGUUGGUGUCGAGGUUAUUGUAAUAAGGGUGGGGUAGGGAAAUGGAGCUUAGUCAUUCACCUGGGGCUGAUUUUAUGCAACGAGACUGCGGAUUAUCACUACUUAUCAUUUUUGGAGCAUUUUUCUAGAGACAGACAUAAAGCAUGAUCACCUGAGUUUUAUACCAUUUGAGACCCUUGCUGCACCACCAAAGUGUAGCAUCAGGUUAAAUCUUAAUAGAAAAAUUUUAGCUUUUGCUUGAGAAACCAGUGCUUCCCUCCCUCACCCUCUCUCCCCAGGCUCUCUACCCCUUUGCAUCCCUACCAGGCAUCUUAGCAACUCUCACUCAUACUUGAUCCCAUUUUCCAUUUGUUGUACUUGCUCCUCUAGUAUUCAGACAUAGCACUAGCUUUCUCCCUCUCUUGAUCUUGGGUAGCCUGGUGUCUCGCGAAACCAGACAGAUUGGUUCCACCACAAAUUAAGGCUUGAGCUGGGGCUUGACUCUUACCCAGCAGUGCUUUUAUUCCUCCCUAGUUCACGUUCUUAAAUGUUUAUCUUGAUUUUCAUUUUAUCCUUUUUCCUUAGCUGGGAUUCUGUCCCUGACCGUCUUCACAGUCCAGGUGAUCUUGACUACUGCUUUACAGAGAAUUGGAUCUGAGGUUAGGCAACAUCUCCCUUUUUCUUCCUCUAAAUACCUCUCAUUUCUGUUCUUACCAGUUAGUAACUGAUCUCAGAUGCCUGUGUGAUAGCUUCCAAAUUGCUGUCUCUGUCUUUAGUGUUAUCUUUUGAUCCAUCUUACAUCUUGUUAGGAUGAUUGUCCUAAAGGAAGAUAGAGCAUGAAAAUGACAGGUGAAACUCCAUUACUGGCUUGUACUGUUUACAGCAAGUUGUCUAACCCGCGGGCCGCAUGGGACCCAGGACAGCUUUGAAUGCGACCCAACACAAAUUCGUAAACUUUCUUAAAGUUUUAGGAGUUUUUUUUGCGGGGUGUUUUUUUUGUUGUUGUUGUCUGUUUUUUUUUUUUGCUCAUCAGCUGUCCUUUAUAUGUGGCCCAAGACAGUUCUUGCAGUGUGGCCCAGGGAAGCCGAAAGAUUGGACACCCCUGGUUUACAGGAUGAAUUCUGUUCUCGUGAAUGUGAUGCAUAAGGUCCCUGGAUAGACUUUCCUCAAUUUAACAGCUUUUUCAUUUUUCACUAUUUUCCACAUACUACACACACAAAUAUGACCUCUCUCCUGAAGUCACAUGGAAUGAAUUGCAGUUACCCAAAUCAUAGAGACGUCAUAUAUCUUUGUGGGGUGGUUCUUUUUGGAAUGCUACCCUUGCUGCUUUUAAUCCUGCAGAUUCAAAUGUCAUCUCCCCUUUGGUCAUGCCUUCCAUGGUCUGUUGUUCUAUGACCCAAACUGCCCUUUUAAAAAAGCAGUUUUCUUCUGACUCCUGAGCAGUUUGUACUGCGUGGGUCAUAGUAAUUCUGGGGUUGUUGUCAUUGCUGAUUUAAAUUACCUUAACUAUUCUGAGCUUUUUGAAGGAAUAGUGUCUUGUACUCCUGAGCUCCUAGUAUACUCUGAUGUCUAGCCAACUUUAAGUAAAUGGAGUGAGCGACAUGUAAAUGUCUUUAUGGUUUGACAUUUUAUUAAUCUUGAGCAUUGGAAAAGUGGCUGGUAUGACUAAAGAACUGAAUUUUUAUUUUUUAUCUAAUUUGAAUUGCAACUGUGGACAGUAUAGCUGUAGCCCCGGACUUGUUCUGUGGAUUACAGAAUACGUGGACAUUGAUGGUUUUCUCUUUUUACUGAGCAGUAAGGAAAUAAAAGCUGAAGCUCUCUGGCCCAUUACAUUUCAUUUAACUGCUUGUUUUGUUUUAUUUAUUAUAUAUUUAGCUGAAAGCUAAGUCCAACAAACCAUUUUUAAAGAUGUGCCUGCCUUGGACAACAGUGAAAGCAAGCGUUAAUGAGUUUGGAUUUCAAAAAAAAAUGCAUAAUGAAUUUUAGGGAGGUGUGGAAACAGGAAGAGAACUAGAACUGGAAGUAAAGCAUUGAAGAUGUGACUGAAUUGCUGCAAUCUCAUGAUCAAAUUUGAAUGGAUGAGGAGUUGCUUUUUAGGGAUGAGCAAAGAAAGUGGUUUCUCGAGAUGGAAUCUACUGGUGAAGUUGCUGUGAACAUUGUUAAAAUGCCAAUAAAGGAUUUAGGAAUUACAGAAACCUGGUUGAUAAAGCAGUGCCAGGGUGUGAGAGAGUUGACUUCAAUUUUGAAAUAAGUUCCACUGGCUGGGUGUGGUGGCUCACACCUGCAAUCCCAGUACUUUAGGAGGCCGAGACUGGUAGAUCAUUUGAGGUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUUGCCAACAUGGUGAAACCCCACCUCUACCAAAUUAGCCAGGUGUGGUGCACACCUGUAGUCCCAGCUACUUGGGAAGCUGAGGCAGGAGAAUCUCUUGAACCAGGGAGGAGGAGGUUGCAGUAAGCCGAGAUGGCGCCCCUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGUGAGACCUUGCGUUUAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAGGAAAAAAAAGUUCUACUGUGGGUAAAAUGCUAUCAUGCUAUCAAACAGCAUCACAUGCUACAGAGAAGUCUUGUGAAAGGAUGUCAGUGUGGCAAACUUCAUUGUCUUUUAAGAAAUUGCCACAGCUAUCGUAAUCUUCAACCACCACCACCCUGAUGAGUCAGUAGCCAUCGUUAACGUUGGCGUAAGACCCUCCACCAGCAAAAAGAUUGUUAGCAUUUUUUUAGCAGUGAUGUAUUUAUCAAUUAUACAUAAUGCUAUUGUACACUUCUUAAUAGACUAUGGUAUAGUGUAACCAUAAUUUAUGCACUGGGAAACCAACAAAUUCAUGAGAUUCGCUUUAUUGUAGUGCUCUGGAAUUGAGCCUGCCGUGUUUCUGAGGUAUACCUGUGUAUUUAGUAUGUUCCUUGUAUAUAAAACCCCAUUUUAUAGGGUAGGAAACUAAGGCUUAGAGUUUGAGCAAUUUUCCCAUAGAUAACACCAAUAAAUUGAGGGCUGCAGAGACCACUUAAGUGGUUCUCUUAACAGUAGUCUAGACAUGACGUAAUGAGAUUUGGCUUAGGAGUGACAAUGGUAAGGAAGUUAAAGGAUUCAGGAACCAAAUACCAGUUAUUGAGAAGAAAGAAUGGCCUCAAAACAUCACUUCUCAAGGAAGCCUUGAUACCCUCACCCUUACUACACUGUAUCCUCCAUUUGAAUGUUGUCAAGAGCUCUUCUCACAAUUGUAAAUAAUAAUUGUGUAAUUUUGUUUUUUUUUUCCUACUUUAGGUUGCUCCUUGAGGGCAGGACAGUUCUUAUGGCUUUAUCCGUUGCGUAAGCACAGAGAGGUCUGCGAGGUCAAAACUAUUGUCAUGAUAGCAAGAUGCCUGUCUUUUUCAUUUAUUCUCACGGUGUGCAGAGGCUACAUGAUGUGUGAUGACAUCCUCAUUGAUGUUAAUGAAUGGUGCUAUACUUGAAUUUUCUAAGGUGUCAUUAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGCAUAACUGGGACUACAGGGAAGCACCAUUUUCCACAAAACUCUCAAGAAGGACUUGUUGCAACUGGAAAAGCAAUUAAAUGUGAAUCGUGAUCCAGGAGAAAGUAACAACUCACAUAACUCCCAAAUUAAAAGUUUUCCAAAGAUAUAUCAUUUUUUUUCUCUUGGCCUUUUAAGAAACUAGCCAACAAAUACUCUUGACAGGUUUGUGUUUGGUUUUGAAAACACACACCUUAGUGUACUGAAAGAAAAACAAUUUCUUUUAAUUUGGUUUGUUGGUCCCACACCCCAUCUAUCAAUGUAUGUGCUAUUUACAAAUAAGUUCUAUACAGUAUUUUUGCAGUACCUUUGAUAAUUCCUAGACCUCUAUUUUCAUUCUGUGUAUUAAUGUGAAUAACAGAUGGAUAUUUUAAUAUUUAAGGCAGAUGGUAAACUUUCCUAUAGGUCUUGUGAGACUUCGUCUUAUAGGCUGAACACCAUUCACAAAAUGUAAUAAUGCUUCAUUCCUUCAGGUUGAGGUAAAGAACUUGAGCAACUGGAUUAGCAAAGCUGCAAAGAAUGAAAUGUGGCCUAAGAUGUAAUUAUGUUCUCUGCCCUUCCUUUGGGCCAGGGUAGUUUUGCACUUGACACAAUGGAAAAUAGGCCAUAAAGCCUGAAAAUAAAAUGUUCUAAACCCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1603 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1704.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 1159.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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