Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

THUMPD3-AS1:9

Sequence Length

1860 nt

GC Content

0.3699

GCCGCCGGGGCCGCCUAGAGAAGAGGCUGUGCUUCGGCGCUCCGGCUCCUCAGAGAGCCUCGGCUAGGUGUGGAAACAGGAAGAGAACUAGAACUGGAAGUAAAGCAUUGAAGAUGUGACUGAAUUGCUGCAAUCUCAUGAUCAAAUUUGAAUGGAUGAGGAGUUGCUUUUUAGGGAUGAGCAAAGAAAGUGGUUUCUCGAGAUGGAAUCUACUGGUUGCUCCUUGAGGGCAGGACAGUUCUUAUGGCUUUAUCCGUUGCGUAAGCACAGAGAGGUCUGCGAGGUCAAAACUAUUGUCAUGAUAGCAAGAUGCCUGUCUUUUUCAUUUAUUCUCACGGUGUGCAGAGGCUACAUGAUGUGUGAUGACAUCCUCAUUGAUGUUAAUGAAUGGUGCUAUACUUGAAUUUUCUAAGGUGUCAUUAGGUAGGUUUAGGUAUGCAUACUUGUUUUUAGAAAUUAUUUUUUUCCUUUUUCCCAUUUUUAGAAAUCAACUCAUUUUUUAGGUUAUGCCUUCAGUAAUCUUUGCAACCUCAAUAUUGUGUAAUGGUUACUUUAAAAUACUGUAGUUUUCUUUGUGCCUAAGUAUAAACAUAAGUACAUUUUGUUGUUUUGUUUGCAAUAGUGGUUUAAAUAUUUUCCCAAAAUAUCCAAAUUUAAAAAUUCUACAACUUUAGAAUUUAAUAAAUUUAUUCUAAAAUAUUUAUAUAUUUUUUCAUUUAAGAAUGGAUCGGCUUAAAAAGACUGCUUCUCAUUUACUUACUGGCUAUACCAUCUGUAUACUAAUAAAAAACAAGAUUUGAUUUGGAAGGACUGACUCAAACUAACGAAAAUAUGAAACCUGUCUUUCUGCUUUGGAGAUAUUUACCUAAUCAUGUUCUGCAGUAGAAUAAUUUAGUUCUUUUGUCUUUUUUUGGAGAUGAGGUCUUGCUGUGUUGCCCAGGCUAUUCACAGCUGCCAUCAUAGUGAACUACAGCCUGAAACUCCUGGGUUCAAGAGAUCCUUCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGAACUAUAGGCAUGCGCCACCAAGCCUGGGCUUUUAAAAAAAUUUUAAAAAGAAUUUUGAGACAGGAUCUUGCCAUGUUGCUCAGGCUAGUCUUCAACUCCUAGCCCUGAGUGAUCUUGCUUUGGGCCUCUCAAAAUGUUGAGUUAAUAGGCGUGAGCCACCAUACCCAGCCAAAAAUUUUUUUAGAGAUGGGAAUGGAAUGAUCUUGAAUAGUGUUGGUGCCACCUAUGUUGUGGCAUCAUUUUGAAACCAAUCAUUCAGAGUGCUUUUUUUGGUAAGGCAUUAUUUUUUAAUGCAGGUAUGCCACUACUGGGAAAAAAAAAAAAACAGGUUUUAAAGCUAGAAAUGAAAAGCUACUUAAGUAUCUUAAAGGAUAAGUUACUUUAUUAUACACUAGAAACAUACACAAUAGCUGAAAAACUUAAAAAAUCUCACACUGCUGAAUGUCUCUGCUGGCUGAAGUGUAAGUAAAAGAUCAUAGUAGUGCCGCUGUUGAGUGAUAAAGCAACUUGUCAUUAAAGAUGUGUGUGCAGACAUGGAUUCUGAGUUAAUAUCUCAUCUGUAGAAGUAUAUAUUUGUCCCUUGCUUUGGGAUUGGUUUCUGGACAGCACUCCCCCACCCUUGCUGGCCAUUUGCCAAGGACACCAAAACCCAAGGAUGUUGAAUUCCCUUUUAUAAAAUGGCGCUGUAUCUGCAUACAACUUACACACAUCCUCCCAUAUACUUUAAAUCAUUUCCAGAUUUCUUAUACUUCAUACAAUGUGAAUGCUAUAUAAAUAGUUGUUACAUUGUGUACUUAUAUUUGUACUAUUGUAUUAAAUAUUCUCAAAUAUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-488.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -523.54

Frequency: 0.0000

Diversity: 452.54

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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