Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

TRAF3IP2-AS1:1

Sequence Length

1591 nt

GC Content

0.5431

CAGGAGAGAAGCCCUCGAGCUUUCGUCGGUGCUGGUGCUGCCGCCACUGCCGCCACCGCCGGGAAUCACACGGGCUCCUCGGUCCCAGGCUGCAGCUCUUGUUGCCAUGAUGAUGAUGUCACGGACGCAACCACUGGGGGGAGGGGAGAGGGGGGUGUGUGUGGCGAAGGGAGGCUGCGAGUAGUGCGGGGGAGGGGGCUCGGCGGGAAAAGGAGCGAGAGGGCGGGCGCCCGGGCGGGACACGGAGGGCGGGGGCCGAGAAGGGGCUUUCUCCCCCUCCCCGGGCACGCGGCGAGGGAGGCGGCCGGCGGCCGGCAGCGCCCGCGCGGGAUCGAUGACUCGGCUGGCGGGCACGGUCACCUGGGUGAGGGGCAGCGGAAGGGGCGGCGGAGCACCGAUCUCAUGGAUGGGCUCCGAGGGGCUUGCGGGAGGGGGGCGCCAGUGUUCGGGGCCGUUUUGGCGGCUAUGCAGGAUUGGCAGGAGCUGCGAUGCUCACACUUGCCUCGCCGACCGCCAUUUCACAUCCAGCAGAGGAGGCGGGGGCAGCCGCUGAGACGGUUUUUCACAAGUAUUCCCACGAGCAUUCUGCUGAGAUGAACAAUCAGAUGACCUCGUGUGAGAUUUGGAGGAGAGAAGGAAAUGGAGAGCAUGCGUCUGCCGCUUCUGUGGUUUCUGUCGGCUUUCUCCAUAUUUACGUGCUUGUAACUCUGGCAUGACCUUUGCUCCAGUCUCUACCAGAGGGCGGUGCCUGGAUUGAAGUGGAAAAGCCCUGUUUUCCAGCCAUGACCCAGGGAGCAAGCACUGACUCCUCAGGGGAACAGGAGACCUGCCAACUAGGACCCUGGGAGCCCCCAUGCUGGCAGUGCCCUGGGUCAUCUCAGGCUCAUCAGCAAAUCCUGGGGGGAGAGCGGGGCUGGAGGGCGAAGAAGCCCAGGAGAGUUCCUGGCUCAGAACCCCUCUCUGAGGCUCCCAAUACAGAGCCCAGGCCCCACACCCAGGGCCUCUGAGUAUUUUUGUUUAUUGUAUGUAAAAUACUAGUGUAUUUUUGUUUAAGUCUCACAGGUAAACAGGUUCUCUCAUACUUUGCCAAGGGAAAUGUGAUCUGUGCAAUUUGGCAAUAACUAUCAGAAUUUUAAAAGCUUAUGCCCUUUGACCUAGUAAUUUCACUUCUAAGAAUUUCCCCUGCAGAGAUAUGUAUAUCUUGUAUGAAAUGAAGAGGCUACGAAGACAGGCAACGCCGCAGUGUUUAUAAUAGCGAAGACCAGACACAACCCACAUGUCUAAAGGUUCUGAUUUUUAAAACUGUAGUAUAUCUGUACAAUGAGCACUCCACAUCCUUUAAGAAUGAGGAAGGGCUGUGUGAACUGAAAUGGAACUAUCUCUAAGAUUUAUUAAGUUAAAAAAAUUCAAGAGUAGCACAGUGUGUAGGGUAUGCCAUCAUUUGUAUGAUAUAAGGUCGUAUAUCUGCCAUCUCAAAUGAGGAACAGUGGUUGCCUCUGGGAAGGGAAUUGGAUGGCUAGGAAUGGGGUAGGAAAGAGGUUUGCUUUUCAGAACAUUUUAUACUAUUUAAGUUUUGUAACAAGUGCAUCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-601.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -628.85

Frequency: 0.0000

Diversity: 405.02

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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