Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
TRAF3IP2-AS1:10
Sequence Length
576 nt
GC Content
0.5312
GGCGGCUAUGCAGGAUUGGCAGGAGCUGCGAUGCUCACACUUGCCUCGCCGACCGCCAUUUCACAUCCAGCAGAGGAGGCGGGGGCAGCCGCUGAGACGGUUUUUCACAAGGCUUUCUCCAUAUUUACGUGCUUGUAACUCUGGCAUGACCUUUGCUCCAGUCUCUACCAGAGGGCGGUGCCUGGAUUGAAGUGGAAAAGCCCUGUUUUCCAGCCAUGACCCAGGGAGCAAGCACUGACUCCUCAGGGGAACAGGAGACCUGCCAACUAGGACCCUGGGAGCCCCCAUGCUGGCAGUGCCCUGGGUCAUCUCAGGCUCAUCAGCAAAUCCUGGGGGGAGAGCGGGGCUGGAGGGCGAAGAAGCCCAGGAGAGUUCCUGGCUCAGAACCCCUCUCUGAGGCUCCCAAUACAGAGCCCAGGCCCCACACCCAGGGCCUCUGAGUAUUUUUGUUUAUUGUAUGUAAAAUACUAGUGUAUUUUUGUUUAAGUCUCACAGGUAAACAGGUUCUCUCAUACUUUGCCAAGGGAAAUGUGAUCUGUGCAAUUUGGCAAUAACUAUCAGAAUUUUAAAAGCUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-208.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -219.25
Frequency: 0.0000
Diversity: 161.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.(((.......)))..))))))((((((((..(((.(.(((((..((.((((((((.((((((((((((.(((((......)))))((((.((((((....)))))).))))........((((((.(.....).)))))).)))))))).....((((...))))(((...))).))))))))))))...(((((((((((((....(((((((((((.((.((((..(.((((.(((((...((((...))))((.....)).)))))))))...)..)))).))....)))))))))))((((((.............)))))).)))))))))))))))..))))).)))).((((((....)))))).(((((.......)))))(((((........))))).((((((........)))))).)))))))).....(((((((....(((((((....)))))))....(((((..(((((((..(((..((((((((.....))...)))))).))).)))))))..))))))))))))......................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((((({.,((,{{...{|||,{|||,,,.,,||||,..}}}}},{,|||,.||.((((((((.((((((((((((.{(((({{{.{{||},|((((.{{{{||,,..,})))).))))........((((((.{.....}.)))))).}}})))}}{{.,{({({...})))|||}}.)}))))))))))))))...(((((((((((((,,,{(((((((((((.{{.{(((,,(.((((.(((((,..((((.,.|||}{{....,)).)))))}}}},},}..))}},)),,,,))))))))))){{{{||}|..,,{|.....,))))},)))))))))))))||{{||,},.,.{({((((((....)))))))|{,,,..}}}}})|||,(((((........))))),|(((((........)))))|{||||||||.,,{,,,{{{{{....{((((((....)))))}|,{,.{((((..(((((((..(((..(((((({{.....}}...)))))).))).)))))))..))))))))),}}...})))}.........,,...
Back