Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

TRAF3IP2-AS1:31

Sequence Length

1619 nt

GC Content

0.4892

AGGAGCACCCGGCAAGGGGCCGCAGGAGAGAAGCCCUCGAGCUUUCGUCGGUGCUGGUGCUGCCGCCACUGCCGCCACCGCCGGGAAUCACACGGGCUCCUCGGUCCCAGGCUGCAGCUCUUGUUGCCAUGAUGAUGAUGUCACGGACGCAACCACUGGGGGGAGGGGAGAGGGGGGUGUGUGUGGCGAAGGGAGGCUGCGAGUAGUGCGGGGGAGGGGGCUCGGCGGGAAAAGGAGCGAGAGGGCGGGCGCCCGGGCGGGACACGGAGGGCGGGGGCCGAGAAGGGGCUUUCUCCCCCUCCCCGGGCACGCGGCGAGGGAGGCGGCCGGCGGCCGGCAGCGCCCGCGCGGGAUCGAUGACUCGGCUGGCGGGCACGGUCACCUGGGUGAGGGGCAGCGGAAGGGGCGGCGGAGCACCGAUCUCAUGGAUGGGCUCCGAGGGGCUUGCGGGAGGGGGGCGCCAGUGUUCGGGGCCGUUUUGGCGGCUAUGCAGGAUUGGCAGGAGCUGCGAUGCUCACACUUGCCUCGCCGACCGCCAUUUCACAUCCAGCAGAGGAGGCGGGGGCAGCCGCUGAGACGGUUUUUCACAAGGUGCAUUUUAGUGGUUACCAGGUUGCCACGUAUUUGAAGUGGUGUGAGAGCUACUCGUUUGGAACCGUUGUGGAUUUUCAAAUAGGAAAAUCAAAAGGCCCAAAGAGACAGCUCACUGGUGACCAUGCUUUGGGAUUUUCAUAGUUUGAGUAAUUCCUAUGGGCUCUACCACCCAGCGAGUUAAAGAAGACAAGAUUCCACCCCCAGGGGGUUGUGGUUCUGGGAAUGUGAGCAGCUUGUUUUCAGGAGAUCUGCAUCUUGAUCUGGCCUGCUAUUAGGAUCUGUGGUGGUGGUGCCUGUCUGGUUUUAGUUGUUUCUUUUAUCUUACACAGAUUUUUGUAAGUUAUUUGCAUAUAAAGGUUUUUGAAAAGUGAAUGUUUUAUGGGGGCAUCUUGCUUAUACAAAGAAAAAUUAAAACUGUUUUAAAAUAAUCACUCGUGUUACACUUGUCUAUUCUAAAAUAAAUGAAAGUAUUAAUGUUGUUGUCUGGAAGGAAAAUGAAGACCAGGAAAAUAGCUAUGCUCUUAAUGUUUUAAAAUAAGGUAAUAUUAUUCUCUGUUUGAAUGGAGGCUUCUAAGGAAUUACCACAGUCUCACACACAAUCGACUUAAAUGCAUUCUUUAUCUUUAAAAGGAAGCAGAAUAGGAUCAUUGAGUAAAUCACAUGUGUUCACAGUCUUGUCUGGUGUAAUCGUAUACUACACAAACACAUUAUUCUGUAGUCAGGAGGGGAAGGGGACAUUUGAAGCAGGACUUGCCCUUGAGGAGGCCUUUUUCUGUUUAAAGUAUAGUGCAGUGAAAGACCACACAGUAGAAGAUAACAAAAUAUCUUCCAUGCCACCCCCACUUUUUCAUUUUCUCAUUCUCCUUUGUUCUCUAAGGACAUCUGUUGAAAUGAUUAUUCUGUAAAACUCAUAGGUACCUAGCAGAAGCCAUAUCAUAUUUCAUUUAUUAUUUUGUCUACUUAAUUAUUGUUUUCUUUUAUAUCAUGCAAUUGUGGGUUUUAAAAAUAUUCUGUUUAUAAAAGAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-553 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -577.59

Frequency: 0.0000

Diversity: 281.35

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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