Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

TRAF3IP2-AS1:38

Sequence Length

801 nt

GC Content

0.5306

AUGGAUGGGCUCCGAGGGGCUUGCGGGAGGGGGGCGCCAGUGUUCGGGGCCGUUUUGGCGGCUAUGCAGGAUUGGCAGGAGCUGCGAUGCUCACACUUGCCUCGCCGACCGCCAUUUCACAUCCAGCAGAGGAGGCGGGGGCAGCCGCUGAGACGGUUUUUCACAAGAACUGGUGUCCAUAGAAGACGAGAUUAGAACACAGACGUGUCCACACAGAGGAGAGACCAUGUGAGGACAGAAGGAGAAGACAGCCUCAGGAUGAAAUGAACCCUGCUGAAACCUUGAUCUUGGACUUCCAGACUCCAGAACUGAAAUGACCUCAUUCUUGAUGGCUGCUGCUAACUUAUGGUGAGAUGCUGGGUCCCUGCCCAAUACCACAUGGACAUCCAAUCAAUUUACCCAGGGACAAGUCCACUCAAGAGCAUCAUUUAGAAGAGGGAAAAGGCACUGGGGUUAUUUGUUUUUGGAGUAUGUGCUUAAGGAAAUCUAGAGUAUUCCCACGAGCAUUCUGCUGAGAUGAACAAUCAGAUGACCUCGUGUGAGAUUUGGAGGAGAGAAGGAAAUGGAGAGCAUGCGUCUGCCGCUUCUGUGGUUUCUGUCGGCUUUCUCCAUAUUUACGUGCUUGUAACUCUGGCAUGACCUUUGCUCCAGUCUCUACCAGAGGGCGGUGCCUGGAUUGAAGUGGAAAAGCCCUGUUUUCCAGCCAUGACCCAGGGAGCAAGCACUGACUCCUCAGGGGAACAGGAGACCUGCCAACUAGGACCCUGGGAGCCCCCAUGCUGGCAGUGCCCUGGGUCAUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-285.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -301.19

Frequency: 0.0000

Diversity: 205.51

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((((((((.(((((((((.((((...((((((((((((..((((((((((((((((((..........(((((((((......))))....)))))..(((..(((((.((((..........)))).))))).)))))))))))))))))))))..))....))))))))))...((((.(((((((((....(((...(((((.((((..((.....)).)))).)))))..(((.........)))((((...........))))))).....)))))))))..))))...(((((((((...(((((((((((((((.(((((.((((.((......(((((.(((.....(((((((............(((....)))...........)))))))..)))))).))))))))))))).))))..............)))))))))))..)))))))))..((((((.((.....)).)))))))))).))))).((((.(((((..(.....((((.((.((((..((((((((.((((.((((......(((((((((..(((...(((((....)))))...)))..))..))))))).....((((((.(.....).))))))..)))).)))))))))).))..))))..(.(.(((((.......(((((((......)))))))........))))).).)...)))))))..))))).))))((((...))))((.....)).)))).))))))((((.(..(((...)))))))).)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

..(((((((((((.{((((((((,{(({,{,(((({(((({((,,{(((((((((((((((((......,...(((((((((......))))...,)))))..(((..(((((.((((..........)))).))))).)))))))))))))))))))}},,},..,.,||||}|||}...((((.(((((((({....,.....(((((.((((..({.....)}.)))).)))))..{{(......{{{|,|{(((...........)))))))...,})))))))))..))))..}||{||||,,,,.{{{{{{((((,((((.(((((.((((.{{..,,,.,((((.(((..,..(((((((............(((....)))...........)))))))..))))))}})))))))))))).))))}}}}.....,,,.,}}}||||}|||{{|||||||||..((((((.,({...,}}.}}}},})))}.})))},||||,((((,..,.....}}}}..,.((((,,{{(((({{{((((.((((..,{{.(((((((((..(((...(((((....)))))...)))..)),.})))))).}},.((((((.{.....}.))))))..)))).)))))))))).}},.)))),|{,(,(((((.,{,...(((((((......)))))))....,}}.))))).}.},,})}),}}}}}),}}}})))}|||{.,.))))||...,.)),))))})}})))})},,,}},||,,.))))))))})))}}